LOCUS AEE75752.1 734 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana DNA topoisomerase-like protein protein.
ACCESSION CP002686-2963
PROTEIN_ID AEE75752.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Salanoubat,M., Lemcke,K., Rieger,M., Ansorge,W., Unseld,M.,
Fartmann,B., Valle,G., Blocker,H., Perez-Alonso,M., Obermaier,B.,
Delseny,M., Boutry,M., Grivell,L.A., Mache,R., Puigdomenech,P., De
Simone,V., Choisne,N., Artiguenave,F., Robert,C., Brottier,P.,
Wincker,P., Cattolico,L., Weissenbach,J., Saurin,W., Quetier,F.,
Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M., Benes,V.,
Wurmbach,E., Drzonek,H., Erfle,H., Jordan,N., Bangert,S.,
Wiedelmann,R., Kranz,H., Voss,H., Holland,R., Brandt,P.,
Nyakatura,G., Vezzi,A., D'Angelo,M., Pallavicini,A., Toppo,S.,
Simionati,B., Conrad,A., Hornischer,K., Kauer,G., Lohnert,T.H.,
Nordsiek,G., Reichelt,J., Scharfe,M., Schon,O., Bargues,M.,
Terol,J., Climent,J., Navarro,P., Collado,C., Perez-Perez,A.,
Ottenwalder,B., Duchemin,D., Cooke,R., Laudie,M., Berger-Llauro,C.,
Purnelle,B., Masuy,D., de Haan,M., Maarse,A.C., Alcaraz,J.P.,
Cottet,A., Casacuberta,E., Monfort,A., Argiriou,A., flores,M.,
Liguori,R., Vitale,D., Mannhaupt,G., Haase,D., Schoof,H., Rudd,S.,
Zaccaria,P., Mewes,H.W., Mayer,K.F., Kaul,S., Town,C.D., Koo,H.L.,
Tallon,L.J., Jenkins,J., Rooney,T., Rizzo,M., Walts,A.,
Utterback,T., Fujii,C.Y., Shea,T.P., Creasy,T.H., Haas,B.,
Maiti,R., Wu,D., Peterson,J., Van Aken,S., Pai,G., Militscher,J.,
Sellers,P., Gill,J.E., Feldblyum,T.V., Preuss,D., Lin,X.,
Nierman,W.C., Salzberg,S.L., White,O., Venter,J.C., Fraser,C.M.,
Kaneko,T., Nakamura,Y., Sato,S., Kato,T., Asamizu,E., Sasamoto,S.,
Kimura,T., Idesawa,K., Kawashima,K., Kishida,Y., Kiyokawa,C.,
Kohara,M., Matsumoto,M., Matsuno,A., Muraki,A., Nakayama,S.,
Nakazaki,N., Shinpo,S., Takeuchi,C., Wada,T., Watanabe,A.,
Yamada,M., Yasuda,M. and Tabata,S.
CONSRTM European Union Chromosome 3 Arabidopsis Sequencing Consortium;
Institute for Genomic Research; Kazusa DNA Research Institute
TITLE Sequence and analysis of chromosome 3 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 408 (6814), 820-822 (2000)
PUBMED 11130713
REFERENCE 2 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="3"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="NAI2"
/locus_tag="AT3G15950"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:EL183621.1,INSD:AA394761.1,INSD:EL039661.1,
INSD:EH831320.1,INSD:BP601709.1,INSD:BP603157.1,
INSD:EG529080.1,INSD:EL210915.1,INSD:EH887643.1,
INSD:EL033208.1,INSD:EH823132.1,INSD:EH899777.1,
INSD:EL168239.1,INSD:EL124847.1,INSD:EL035098.1,
INSD:EH972873.1,INSD:N65234.1,INSD:AV791681.1,
INSD:EH901150.1,INSD:EH951558.1,INSD:BP793657.1,
INSD:EH886452.1,INSD:BP804740.1,INSD:BP616259.1,
INSD:EL095968.1,INSD:EH968837.1,INSD:BP603991.1,
INSD:EH859604.1,INSD:AA042213.1,INSD:EL177801.1,
INSD:EH968928.1,INSD:EH819801.1,INSD:AI994573.1,
INSD:BP611971.1,INSD:BP610817.1,INSD:EH983940.1,
INSD:EH876843.1,INSD:EH898305.1,INSD:EH910365.1,
INSD:EL326894.1,INSD:EL263763.1,INSD:EH863611.1,
INSD:EL259043.1,INSD:EL178664.1,INSD:AV552562.1,
INSD:EL161190.1,INSD:BP605499.1,INSD:AV542752.1,
INSD:EL236662.1,INSD:EL201668.1,INSD:AV546186.1,
INSD:EL192089.1,INSD:AV551409.1,INSD:AV518896.1,
INSD:EH879932.1,INSD:EL170410.1,INSD:EL255263.1,
INSD:BP808899.1,INSD:EL303703.1,INSD:BP785474.1,
INSD:EL327790.1,INSD:AV540495.1,INSD:AV540459.1,
INSD:EL308109.1,INSD:EL320337.1,INSD:EH910162.1,
INSD:EL088794.1,INSD:EH846627.1,INSD:BP603375.1,
INSD:BP807876.2,INSD:EH920849.1,INSD:EH848433.1,
INSD:EL166756.1,INSD:EH814977.1,INSD:AV540634.1,
INSD:EH956159.1,INSD:EL328854.1,INSD:EL126083.1,
INSD:DR261936.1,INSD:AV547429.1,INSD:EH951864.1,
INSD:EL335056.1,INSD:BP784357.1,INSD:EH921551.1,
INSD:EL315783.1,INSD:AV542887.1,INSD:EH941509.1,
INSD:EH859450.1,INSD:EL090432.1,INSD:EL286713.1,
INSD:EL035586.1,INSD:BP804797.1,INSD:AV540780.1,
INSD:BP611900.1,INSD:EH848437.1,INSD:R86790.1,
INSD:H76678.1,INSD:BP808366.1,INSD:EL080584.1,
INSD:EL008936.1,INSD:BP781471.1,INSD:EL052058.1,
INSD:EH963840.1,INSD:EH919943.1,INSD:EH873242.1,
INSD:EL110950.1,INSD:EL066235.1,INSD:EL235692.1,
INSD:EH913969.1,INSD:ES037565.1,INSD:EH951620.1,
INSD:EL084068.1,INSD:BP604695.1,INSD:EH951402.1,
INSD:EH990621.1,INSD:BP807487.1,INSD:BP806752.1,
INSD:EL216916.1,INSD:EL247683.1,INSD:EL269760.1,
INSD:EL060658.1,INSD:DR380836.1,INSD:EL018604.1,
INSD:EH807739.1,INSD:EL339900.1,INSD:EH960542.1,
INSD:EL165311.1,INSD:EH831961.1,INSD:EL055787.1,
INSD:EL209688.1,INSD:AV548836.1,INSD:EL143319.1,
INSD:EL221591.1,INSD:AV538013.1,INSD:EL112482.1,
INSD:EH971333.1,INSD:BP613825.1,INSD:AV553290.1,
INSD:EL255805.1,INSD:AV550761.1,INSD:EH801488.1,
INSD:R30510.1,INSD:EH800039.1,INSD:EL322330.1,
INSD:AV795201.1,INSD:BP791205.1,INSD:AV543561.1,
INSD:BP808888.1,INSD:EL302584.1,INSD:AV554060.1,
INSD:EH887842.1,INSD:AA720309.1,INSD:EL154216.1,
INSD:EL011030.1,INSD:EH854479.1,INSD:EH893565.1,
INSD:EH952787.1,INSD:BP615889.1,INSD:EL284245.1,
INSD:EH979784.1,INSD:EH799427.1,INSD:EL291748.1,
INSD:EL101117.1,INSD:AV550159.1,INSD:EL297377.1,
INSD:EL313258.1,INSD:BP806879.1,INSD:EL339610.1,
INSD:EL143317.1,INSD:EL226266.1,INSD:EH971033.1,
INSD:EG447588.1,INSD:EL104336.1,INSD:EH858568.1,
INSD:EL100212.1,INSD:EL068909.1,INSD:EH991661.1,
INSD:EH951460.1,INSD:EL057813.1,INSD:BP604408.1,
INSD:EL333574.1,INSD:EL194092.1,INSD:EH982219.1,
INSD:EL239309.1,INSD:EL043136.1,INSD:EL297273.1,
INSD:EL046232.1,INSD:BP806915.1,INSD:EL183791.1,
INSD:EL038068.1,INSD:EH835393.1,INSD:EL284267.1,
INSD:BP604152.1,INSD:BP596191.1,INSD:EL029950.1"
/inference="Similar to RNA sequence, mRNA:INSD:AJ271471.1"
/note="NAI2; INVOLVED IN: ER body organization, response
to salt stress; LOCATED IN: peroxisome, membrane, ER body;
EXPRESSED IN: 16 plant structures; EXPRESSED DURING: 7
growth stages; BEST Arabidopsis thaliana protein match is:
TSK-associating protein 1 (TAIR:AT1G52410.2); Has 35333
Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae -
798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants
- 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI
BLink)."
/db_xref="TAIR:AT3G15950"
/db_xref="Araport:AT3G15950"
intron_pos 26:0 (1/25)
intron_pos 44:1 (2/25)
intron_pos 58:1 (3/25)
intron_pos 97:0 (4/25)
intron_pos 120:1 (5/25)
intron_pos 145:1 (6/25)
intron_pos 161:1 (7/25)
intron_pos 183:1 (8/25)
intron_pos 199:1 (9/25)
intron_pos 220:1 (10/25)
intron_pos 236:1 (11/25)
intron_pos 261:1 (12/25)
intron_pos 277:1 (13/25)
intron_pos 299:1 (14/25)
intron_pos 315:1 (15/25)
intron_pos 337:1 (16/25)
intron_pos 353:1 (17/25)
intron_pos 376:1 (18/25)
intron_pos 392:1 (19/25)
intron_pos 407:1 (20/25)
intron_pos 424:1 (21/25)
intron_pos 435:1 (22/25)
intron_pos 455:1 (23/25)
intron_pos 465:1 (24/25)
intron_pos 500:0 (25/25)
BEGIN
1 MGTKFLALGL SLCLVLSSFY QVSCQDEGTG SLSTLDLIEH EYQTSVNSLQ GNEAVDQTET
61 SGQKNSTVSD NNTISLSLSE EPALETLKES VDTSAELGAV TDEVDKPSSM LDHIELEFEA
121 HINELKEAGS DGINKVEESK DDEEAARRHK MLEAIEREFE AAHAGFEQLK TDDSAQGLDD
181 EQSAKRQKML EEIEREFEEA TKGLEELRHS TSSTDDEAQS AKRQNMLDEI EREFEAATSG
241 LKELKINAHT VKDDVDDKEQ DAKRQSMLDA IEREFEAVTE SFKQLEDIAD NKAEGDDESA
301 KRQSMLDEIE REFEAATNSL KQLNLDDFSE GDDSAESARR NSMLEAIERE FEAATKGLEE
361 LKANDSTGDK DDDEHVARRK IMLEAIEREF EAATKGLEEL KNESEQAENK RNSMLEAFER
421 EFEAATNAKA NGENSAKNPS TISTTVQKSS GGYNAGLEGL LKPADGVCGC FNKDKDGLQA
481 DTDSSINIAE ILAEESKLQG SGTSRLTTSL NNLVDTHRKE TSSKVGSVLG SSSSVTSTTS
541 ESAATSESIE SLKQTLRKLR GLSARDLVNH PNFDAIIAAG TRYEVLSSAS IGYISLLAKY
601 KTVIKEGLEA SQRVQIAQTR AKLLKETAME KQRTVDSVFA AAKTTAQRGD ALHIRIVAIK
661 KLLAKLEAEK VDVDSKFTSL TTSLSELLKE ASQAYEEYHE AVHKAKDEQA AEEFAVETTK
721 RAEHIWVEFL SSLN
//