LOCUS AEE75521.1 348 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana Aldolase-type TIM barrel family protein
protein.
ACCESSION CP002686-2663
PROTEIN_ID AEE75521.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Salanoubat,M., Lemcke,K., Rieger,M., Ansorge,W., Unseld,M.,
Fartmann,B., Valle,G., Blocker,H., Perez-Alonso,M., Obermaier,B.,
Delseny,M., Boutry,M., Grivell,L.A., Mache,R., Puigdomenech,P., De
Simone,V., Choisne,N., Artiguenave,F., Robert,C., Brottier,P.,
Wincker,P., Cattolico,L., Weissenbach,J., Saurin,W., Quetier,F.,
Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M., Benes,V.,
Wurmbach,E., Drzonek,H., Erfle,H., Jordan,N., Bangert,S.,
Wiedelmann,R., Kranz,H., Voss,H., Holland,R., Brandt,P.,
Nyakatura,G., Vezzi,A., D'Angelo,M., Pallavicini,A., Toppo,S.,
Simionati,B., Conrad,A., Hornischer,K., Kauer,G., Lohnert,T.H.,
Nordsiek,G., Reichelt,J., Scharfe,M., Schon,O., Bargues,M.,
Terol,J., Climent,J., Navarro,P., Collado,C., Perez-Perez,A.,
Ottenwalder,B., Duchemin,D., Cooke,R., Laudie,M., Berger-Llauro,C.,
Purnelle,B., Masuy,D., de Haan,M., Maarse,A.C., Alcaraz,J.P.,
Cottet,A., Casacuberta,E., Monfort,A., Argiriou,A., flores,M.,
Liguori,R., Vitale,D., Mannhaupt,G., Haase,D., Schoof,H., Rudd,S.,
Zaccaria,P., Mewes,H.W., Mayer,K.F., Kaul,S., Town,C.D., Koo,H.L.,
Tallon,L.J., Jenkins,J., Rooney,T., Rizzo,M., Walts,A.,
Utterback,T., Fujii,C.Y., Shea,T.P., Creasy,T.H., Haas,B.,
Maiti,R., Wu,D., Peterson,J., Van Aken,S., Pai,G., Militscher,J.,
Sellers,P., Gill,J.E., Feldblyum,T.V., Preuss,D., Lin,X.,
Nierman,W.C., Salzberg,S.L., White,O., Venter,J.C., Fraser,C.M.,
Kaneko,T., Nakamura,Y., Sato,S., Kato,T., Asamizu,E., Sasamoto,S.,
Kimura,T., Idesawa,K., Kawashima,K., Kishida,Y., Kiyokawa,C.,
Kohara,M., Matsumoto,M., Matsuno,A., Muraki,A., Nakayama,S.,
Nakazaki,N., Shinpo,S., Takeuchi,C., Wada,T., Watanabe,A.,
Yamada,M., Yasuda,M. and Tabata,S.
CONSRTM European Union Chromosome 3 Arabidopsis Sequencing Consortium;
Institute for Genomic Research; Kazusa DNA Research Institute
TITLE Sequence and analysis of chromosome 3 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 408 (6814), 820-822 (2000)
PUBMED 11130713
REFERENCE 2 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="3"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="GOX1"
/locus_tag="AT3G14420"
/gene_synonym="glycolate oxidase 1"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:EH880907.1,INSD:EL252121.1,INSD:EL311401.1,
INSD:AV559242.1,INSD:DR236964.1,INSD:EL339883.1,
INSD:DR236913.1,INSD:EL250860.1,INSD:AV810321.1,
INSD:BU636445.1,INSD:EL219707.1,INSD:EL034924.1,
INSD:BP840944.2,INSD:AV819072.1,INSD:AI999414.1,
INSD:BP567605.1,INSD:DR236909.1,INSD:EL339654.1,
INSD:AA597647.1,INSD:EH856009.1,INSD:AV800658.1,
INSD:EL339534.1,INSD:EH824291.1,INSD:EL274939.1,
INSD:EH926369.1,INSD:AV805705.1,INSD:AV521314.1,
INSD:EL102963.1,INSD:EH951563.1,INSD:BP586269.1,
INSD:EL120706.1,INSD:EL225286.1,INSD:EL240337.1,
INSD:AV535808.1,INSD:BP625044.1,INSD:BP667631.1,
INSD:AV519672.1,INSD:EL025193.1,INSD:AV789250.1,
INSD:EH895640.1,INSD:EH884832.1,INSD:BP794477.1,
INSD:EL276369.1,INSD:BP789013.1,INSD:BP587197.1,
INSD:BE521809.1,INSD:EL147651.1,INSD:EH949118.1,
INSD:EL159251.1,INSD:EH823556.1,INSD:BP851534.1,
INSD:AV815320.1,INSD:EH934205.1,INSD:BP596320.1,
INSD:EL149079.1,INSD:EL173527.1,INSD:BP631594.1,
INSD:EL196392.1,INSD:BP622070.1,INSD:AV519688.1,
INSD:EL156538.1,INSD:AV525847.1,INSD:EH824522.1,
INSD:EH904531.1,INSD:EL233168.1,INSD:EH856594.1,
INSD:EH933031.1,INSD:AV807693.1,INSD:BP633892.1,
INSD:EH924779.1,INSD:BP589679.1,INSD:EL117923.1,
INSD:EL030070.1,INSD:AV525495.1,INSD:EL193981.1,
INSD:EL266680.1,INSD:EL047140.1,INSD:EL273950.1,
INSD:EL252160.1,INSD:EL181820.1,INSD:EL241233.1,
INSD:BP627187.1,INSD:BU634926.1,INSD:EL004051.1,
INSD:AV788951.1,INSD:AV816263.1,INSD:AV817055.1,
INSD:EL207247.1,INSD:EL311537.1,INSD:AV518298.1,
INSD:EH831401.1,INSD:AV518765.1,INSD:EL015291.1,
INSD:EH960788.1,INSD:BP622015.1,INSD:EL327718.1,
INSD:BP663214.1,INSD:BP662326.1,INSD:AV440836.2,
INSD:EL050266.1,INSD:EH893844.1,INSD:EL147987.1,
INSD:AV799279.1,INSD:EH980881.1,INSD:EL160569.1,
INSD:AV789496.1,INSD:AV525676.1,INSD:EL243564.1,
INSD:EH939198.1,INSD:EG520777.1,INSD:AV812843.1,
INSD:EH810855.1,INSD:EL103896.1,INSD:EL066036.1,
INSD:EL198365.1,INSD:EL146618.1,INSD:EL036216.1,
INSD:EH938027.1,INSD:EL142448.1,INSD:BP646062.1,
INSD:BP661147.1,INSD:BP819502.2,INSD:BP563157.1,
INSD:EL190468.1,INSD:BP790486.1,INSD:N37956.1,
INSD:EG526289.1,INSD:EH963764.1,INSD:AV519483.1,
INSD:BP663081.1,INSD:DR236905.1,INSD:BP659976.1,
INSD:BU636211.1,INSD:EH942915.1,INSD:EL110712.1,
INSD:EL210140.1,INSD:BP629454.1,INSD:BP781414.1,
INSD:AV823710.1,INSD:EL219097.1,INSD:AV802060.1,
INSD:EH817932.1,INSD:AV520320.1,INSD:AV519735.1,
INSD:EL270171.1,INSD:BP633265.1,INSD:AV796160.1,
INSD:T41831.1,INSD:EL221904.1,INSD:AV787473.1,
INSD:AV807599.1,INSD:EL210845.1,INSD:AV532998.1,
INSD:AV519060.1,INSD:EL267803.1,INSD:EL063518.1,
INSD:AV790926.1,INSD:BP630243.1,INSD:EL281546.1,
INSD:BP652126.1,INSD:EL220157.1,INSD:EL177860.1,
INSD:EL118363.1,INSD:AV785727.1,INSD:AV520060.1,
INSD:BP624588.1,INSD:EL064542.1,INSD:EL245900.1,
INSD:AV564274.1,INSD:AV518042.1,INSD:AV788888.1,
INSD:EL122140.1,INSD:EL239340.1,INSD:AV813056.1,
INSD:ES067735.1,INSD:AV819121.1,INSD:EH975025.1,
INSD:ES202700.1,INSD:BP659892.1,INSD:EG520772.1,
INSD:EH956689.1,INSD:EL081610.1,INSD:EH957134.1,
INSD:EL233344.1,INSD:EH822960.1,INSD:EL244584.1,
INSD:EL135584.1,INSD:EH856309.1,INSD:AV804789.1,
INSD:EH830357.1,INSD:H37285.1,INSD:EL096614.1,
INSD:AV518865.1,INSD:EG490603.1,INSD:EH872535.1,
INSD:EH975915.1,INSD:EH812187.1,INSD:EH812967.1,
INSD:AV803622.1,INSD:AV810545.1,INSD:EG526378.1,
INSD:EH878230.1,INSD:EH829352.1,INSD:AV819729.1,
INSD:EL292464.1,INSD:BP661575.1,INSD:EL203100.1,
INSD:AV518925.1,INSD:EH980166.1,INSD:EH880117.1,
INSD:EL333038.1,INSD:BP622530.1,INSD:EH825607.1,
INSD:EL033315.1,INSD:EL262428.1,INSD:EH800241.1,
INSD:EL182402.1,INSD:BP591912.1,INSD:AV820529.1,
INSD:BP670138.1,INSD:EL022784.1,INSD:EH858678.1,
INSD:EH796107.1,INSD:BP669028.1,INSD:BU636348.1,
INSD:EL316376.1,INSD:BP671526.1,INSD:EL128354.1,
INSD:EL312244.1,INSD:BP660626.1,INSD:EL156317.1,
INSD:BP661044.1,INSD:EH921908.1,INSD:EH933525.1,
INSD:AV800786.1,INSD:EL139918.1,INSD:EH807627.1,
INSD:AV519166.1,INSD:EL233943.1,INSD:EL102511.1,
INSD:EH967747.1,INSD:AV565698.1,INSD:EL270836.1,
INSD:AV797817.1,INSD:EH919863.1,INSD:BU636244.1,
INSD:EH917421.1,INSD:EL025431.1,INSD:EL268555.1,
INSD:EL253032.1,INSD:EL159912.1,INSD:EL182329.1,
INSD:AV519000.1,INSD:AV797275.1,INSD:AV807296.1,
INSD:BP628453.1,INSD:AV560526.1,INSD:DR236895.1,
INSD:EL262558.1,INSD:EH933055.1,INSD:EH819719.1,
INSD:DR237002.1,INSD:EH953177.1,INSD:BP619128.1,
INSD:BP661818.1,INSD:BP622765.1,INSD:DR237000.1,
INSD:EL026015.1,INSD:BP779087.1,INSD:AV790573.1,
INSD:AV442465.1,INSD:EL029991.1,INSD:EH858101.1,
INSD:EL000169.1,INSD:EL219511.1,INSD:AV518183.1,
INSD:BP601428.1,INSD:EL135218.1,INSD:BP777820.1,
INSD:EL059357.1,INSD:AV519010.1,INSD:AV788313.1,
INSD:BP623292.1,INSD:BP662056.1,INSD:EH800078.1,
INSD:BP651463.1,INSD:AV818159.1,INSD:EH824908.1,
INSD:BP585198.1,INSD:AV794936.1,INSD:AV802290.1,
INSD:EL244058.1,INSD:BP588630.1,INSD:DR236951.1,
INSD:EL198676.1,INSD:BP623273.1,INSD:AV520516.1,
INSD:AV531982.1,INSD:AV788627.1,INSD:BP665079.1,
INSD:AV519277.1,INSD:EL057581.1,INSD:AV790955.1,
INSD:EL091883.1,INSD:EH938243.1,INSD:EL213026.1,
INSD:AV798052.1,INSD:AV797834.1,INSD:AV814189.1,
INSD:EH869951.1,INSD:BP633706.1,INSD:EL148842.1,
INSD:EH918181.1,INSD:BP636282.1,INSD:EH803396.1,
INSD:AV518196.1,INSD:EL146706.1,INSD:BP627296.1,
INSD:EH890014.1,INSD:EH892999.1,INSD:EL128194.1,
INSD:Z17593.1,INSD:AV805498.1,INSD:EL004800.1,
INSD:EH866515.1,INSD:AV784733.1,INSD:BP666630.1,
INSD:EL080330.1,INSD:EL036193.1,INSD:AV804380.1,
INSD:EH830416.1,INSD:AV556072.1,INSD:EG520778.1,
INSD:AV526928.1,INSD:EL156629.1,INSD:EL162574.1,
INSD:AV799192.1,INSD:EH839370.1,INSD:AV811579.1,
INSD:EH920753.1,INSD:BP595233.1,INSD:EL113940.1,
INSD:BP630039.1,INSD:BP595154.1,INSD:EL075816.1,
INSD:EL094765.1,INSD:AV812254.1,INSD:EH802469.1,
INSD:ES169322.1,INSD:EL096928.1,INSD:AV810028.1,
INSD:EH821892.1,INSD:EL102381.1,INSD:EL308666.1,
INSD:AV518680.1,INSD:AV805523.1,INSD:BP662805.1,
INSD:EL085552.1,INSD:DR236886.1,INSD:BP585157.1,
INSD:EL124808.1,INSD:BP652963.1,INSD:AV442050.1,
INSD:EL133275.1,INSD:AV803484.1,INSD:EL153781.1,
INSD:EH846949.1,INSD:EL061389.1,INSD:AV535869.1,
INSD:EL193511.1,INSD:EL126866.1,INSD:EL295467.1,
INSD:BP666706.1,INSD:AV813033.1,INSD:BP625035.1,
INSD:DR236893.1,INSD:AV518499.1,INSD:EL054148.1,
INSD:EL322392.1,INSD:BP638924.1,INSD:EL148400.1,
INSD:AV805124.1,INSD:EL053214.1,INSD:BP660531.1,
INSD:DR236999.1,INSD:BP594077.1,INSD:BP636873.1,
INSD:EH866664.1,INSD:AV519802.1,INSD:AV798512.1,
INSD:EL142140.1,INSD:AV804683.1,INSD:AV811952.1,
INSD:EL993038.1,INSD:AV525568.1,INSD:EL330839.1,
INSD:BP663097.1,INSD:EH927208.1,INSD:BP623082.1,
INSD:EL079580.1,INSD:EL215753.1,INSD:BP665417.1,
INSD:EL051713.1,INSD:EL305456.1,INSD:AV801655.1,
INSD:BP782992.1,INSD:EL254092.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:AK220934.1,INSD:AY065122.1"
/note="Aldolase-type TIM barrel family protein; FUNCTIONS
IN: glycolate oxidase activity; INVOLVED IN: oxidation
reduction, metabolic process; LOCATED IN: cytosolic
ribosome, apoplast, chloroplast, peroxisome, membrane;
EXPRESSED IN: cotyledon, fruit, guard cell, leaf;
EXPRESSED DURING: seedling growth; CONTAINS InterPro
DOMAIN/s: Aldolase-type TIM barrel (InterPro:IPR013785),
FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase, active
site (InterPro:IPR008259), FMN-dependent dehydrogenase
(InterPro:IPR000262), Alpha-hydroxy acid dehydrogenase,
FMN-dependent (InterPro:IPR012133); BEST Arabidopsis
thaliana protein match is: Aldolase-type TIM barrel family
protein (TAIR:AT3G14415.3); Has 35333 Blast hits to 34131
proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429;
Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0;
Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="TAIR:AT3G14420"
/db_xref="Araport:AT3G14420"
intron_pos 27:2 (1/10)
intron_pos 69:1 (2/10)
intron_pos 85:0 (3/10)
intron_pos 111:0 (4/10)
intron_pos 152:2 (5/10)
intron_pos 175:0 (6/10)
intron_pos 196:0 (7/10)
intron_pos 219:1 (8/10)
intron_pos 253:0 (9/10)
intron_pos 288:0 (10/10)
BEGIN
1 MVYDYYASGA EDQWTLQENR NAFARILFRP RILIDVSKID MTTTVLGFKI SMPIMVAPTA
61 MQKMAHPDGE YATARAASAA GTIMTLSSWA TSSVEEVAST GPGIRFFQLY VYKNRNVVEQ
121 LVRRAERAGF KAIALTVDTP RLGRRESDIK NRFTLPPNLT LKNFEGLDLG KMDEANDSGL
181 ASYVAGQIDR TLSWKDVQWL QTITKLPILV KGVLTGEDAR IAIQAGAAGI IVSNHGARQL
241 DYVPATISAL EEVVKATQGR IPVFLDGGVR RGTDVFKALA LGASGIFIGR PVVFSLAAEG
301 EAGVRKVLQM LRDEFELTMA LSGCRSLKEI SRNHITTEWD TPRPSARL
//