LOCUS AEE75515.1 367 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana Aldolase-type TIM barrel family protein
protein.
ACCESSION CP002686-2657
PROTEIN_ID AEE75515.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Salanoubat,M., Lemcke,K., Rieger,M., Ansorge,W., Unseld,M.,
Fartmann,B., Valle,G., Blocker,H., Perez-Alonso,M., Obermaier,B.,
Delseny,M., Boutry,M., Grivell,L.A., Mache,R., Puigdomenech,P., De
Simone,V., Choisne,N., Artiguenave,F., Robert,C., Brottier,P.,
Wincker,P., Cattolico,L., Weissenbach,J., Saurin,W., Quetier,F.,
Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M., Benes,V.,
Wurmbach,E., Drzonek,H., Erfle,H., Jordan,N., Bangert,S.,
Wiedelmann,R., Kranz,H., Voss,H., Holland,R., Brandt,P.,
Nyakatura,G., Vezzi,A., D'Angelo,M., Pallavicini,A., Toppo,S.,
Simionati,B., Conrad,A., Hornischer,K., Kauer,G., Lohnert,T.H.,
Nordsiek,G., Reichelt,J., Scharfe,M., Schon,O., Bargues,M.,
Terol,J., Climent,J., Navarro,P., Collado,C., Perez-Perez,A.,
Ottenwalder,B., Duchemin,D., Cooke,R., Laudie,M., Berger-Llauro,C.,
Purnelle,B., Masuy,D., de Haan,M., Maarse,A.C., Alcaraz,J.P.,
Cottet,A., Casacuberta,E., Monfort,A., Argiriou,A., flores,M.,
Liguori,R., Vitale,D., Mannhaupt,G., Haase,D., Schoof,H., Rudd,S.,
Zaccaria,P., Mewes,H.W., Mayer,K.F., Kaul,S., Town,C.D., Koo,H.L.,
Tallon,L.J., Jenkins,J., Rooney,T., Rizzo,M., Walts,A.,
Utterback,T., Fujii,C.Y., Shea,T.P., Creasy,T.H., Haas,B.,
Maiti,R., Wu,D., Peterson,J., Van Aken,S., Pai,G., Militscher,J.,
Sellers,P., Gill,J.E., Feldblyum,T.V., Preuss,D., Lin,X.,
Nierman,W.C., Salzberg,S.L., White,O., Venter,J.C., Fraser,C.M.,
Kaneko,T., Nakamura,Y., Sato,S., Kato,T., Asamizu,E., Sasamoto,S.,
Kimura,T., Idesawa,K., Kawashima,K., Kishida,Y., Kiyokawa,C.,
Kohara,M., Matsumoto,M., Matsuno,A., Muraki,A., Nakayama,S.,
Nakazaki,N., Shinpo,S., Takeuchi,C., Wada,T., Watanabe,A.,
Yamada,M., Yasuda,M. and Tabata,S.
CONSRTM European Union Chromosome 3 Arabidopsis Sequencing Consortium;
Institute for Genomic Research; Kazusa DNA Research Institute
TITLE Sequence and analysis of chromosome 3 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 408 (6814), 820-822 (2000)
PUBMED 11130713
REFERENCE 2 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="3"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="GOX2"
/locus_tag="AT3G14415"
/gene_synonym="glycolate oxidase 2"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:EH944544.1,INSD:EH880592.1,INSD:EL041907.1,
INSD:EL328988.1,INSD:DR232797.1,INSD:EH931496.1,
INSD:EH972968.1,INSD:EH941787.1,INSD:EL264255.1,
INSD:EH865583.1,INSD:EL090073.1,INSD:EH984882.1,
INSD:EH898597.1,INSD:EL120823.1,INSD:EH993685.1,
INSD:EH977700.1,INSD:EL273121.1,INSD:BP859657.1,
INSD:AA394750.1,INSD:EL257038.1,INSD:DR373914.1,
INSD:AV829242.1,INSD:DR232769.1,INSD:EH885308.1,
INSD:EH825926.1,INSD:F14021.1,INSD:EL205462.1,
INSD:EH922928.1,INSD:EH844641.1,INSD:EL193798.1,
INSD:DR232801.1,INSD:DR244663.1,INSD:DR244664.1,
INSD:AU238309.1,INSD:ES100632.1,INSD:EH988460.1,
INSD:EL025602.1,INSD:EH903915.1,INSD:EH932871.1,
INSD:AV828635.1,INSD:BP854386.1,INSD:EL082459.1,
INSD:EH855676.1,INSD:EL211036.1,INSD:EH988358.1,
INSD:EL057133.1,INSD:DR232779.1,INSD:AV802219.1,
INSD:EL212716.1,INSD:EL185211.1,INSD:AV525021.1,
INSD:EL036086.1,INSD:EL015012.1,INSD:EL331986.1,
INSD:EL172222.1,INSD:EL194419.1,INSD:BP778733.1,
INSD:EH921423.1,INSD:EL025272.1,INSD:EL077097.1,
INSD:EL276853.1,INSD:EH964068.1,INSD:AV788501.1,
INSD:EH846982.1,INSD:CB074140.1,INSD:EL041257.1,
INSD:EH907167.1,INSD:EL111768.1,INSD:EH826304.1,
INSD:EL208456.1,INSD:EL102763.1,INSD:AV534417.1,
INSD:EL310821.1,INSD:EH810998.1,INSD:EL227178.1,
INSD:EH957169.1,INSD:EH856712.1,INSD:EL168992.1,
INSD:EH952673.1,INSD:ES044897.1,INSD:EH888802.1,
INSD:EH871589.1,INSD:EL035676.1,INSD:EL128143.1,
INSD:DR232803.1,INSD:DR232790.1,INSD:EL103014.1,
INSD:BP792945.1,INSD:DR232787.1,INSD:EL275912.1,
INSD:EH845986.1,INSD:ES144096.1,INSD:EL158387.1,
INSD:EL130714.1,INSD:EL148924.1,INSD:BP792799.1,
INSD:BP792249.1,INSD:EL192677.1,INSD:EL166798.1,
INSD:EH865743.1,INSD:EH851967.1,INSD:EL337858.1,
INSD:EL304993.1,INSD:EL248014.1,INSD:EL040763.1,
INSD:BP846841.1,INSD:EL177539.1,INSD:EH920951.1,
INSD:BP844735.1,INSD:N65614.1,INSD:EH983808.1,
INSD:EL100053.1,INSD:EL096193.1,INSD:AU229471.1,
INSD:EH952134.1,INSD:EL031073.1,INSD:EL017636.1,
INSD:DR370169.1,INSD:EL000299.1,INSD:AA394816.1,
INSD:EH887809.1,INSD:EL239250.1,INSD:EH991951.1,
INSD:EL046743.1,INSD:EG527908.1,INSD:EL224811.1,
INSD:EL062291.1,INSD:EL106193.1,INSD:AV522247.1,
INSD:AV521810.1,INSD:DR232768.1,INSD:AV829977.1,
INSD:AV805093.1,INSD:DR379821.1,INSD:EL236888.1,
INSD:EL214599.1,INSD:AV809448.1,INSD:EL336625.1,
INSD:EH969778.1,INSD:EL031950.1,INSD:EL338495.1,
INSD:EH812542.1,INSD:EL143889.1,INSD:EH827215.1,
INSD:EL091460.1,INSD:EL161007.1,INSD:EL103538.1,
INSD:EH854017.1,INSD:DR232782.1,INSD:EL154217.1,
INSD:EH839307.1,INSD:EL112077.1,INSD:EL281933.1,
INSD:AA650867.1,INSD:EH814416.1,INSD:DR232784.1,
INSD:EH920892.1,INSD:EH934182.1,INSD:EL236774.1,
INSD:EL108259.1,INSD:EH836639.1,INSD:EH969195.1,
INSD:BP845010.2,INSD:EL266211.1,INSD:EH810729.1,
INSD:EH873928.1,INSD:DR232780.1,INSD:EL061808.1,
INSD:EH869797.1,INSD:EL109524.1,INSD:EL316673.1,
INSD:AA598139.1,INSD:EG462475.1,INSD:EH797331.1,
INSD:AA394446.1,INSD:EL108394.1,INSD:EL170993.1,
INSD:BP843099.1,INSD:BP562244.2,INSD:DR232771.1,
INSD:DR232789.1,INSD:EH898786.1,INSD:EL249305.1,
INSD:EL010105.1,INSD:DR232799.1,INSD:EL094711.1,
INSD:DR232802.1,INSD:EH832631.1,INSD:EL061149.1,
INSD:EL145353.1,INSD:DR232774.1,INSD:EH891238.1,
INSD:DR232783.1,INSD:BP780596.1,INSD:EL114206.1,
INSD:EL314032.1,INSD:AA598112.1,INSD:DR232792.1,
INSD:DR232785.1,INSD:ES001855.1,INSD:EH879133.1,
INSD:EL104153.1,INSD:AV811126.1,INSD:DR232772.1,
INSD:EL243249.1,INSD:AA598079.1,INSD:AV530891.1,
INSD:EH917711.1,INSD:AA598080.1,INSD:EG462479.1,
INSD:CB263581.1,INSD:ES028074.1,INSD:EL258760.1,
INSD:DR232800.1,INSD:EH961789.1,INSD:EL158961.1,
INSD:EH861905.1,INSD:EL048330.1,INSD:DR232773.1,
INSD:EL294745.1,INSD:EG462474.1,INSD:EL198805.1,
INSD:EL075578.1,INSD:EG529303.1,INSD:EL299975.1,
INSD:EL284947.1,INSD:EH985199.1,INSD:EL079183.1,
INSD:EL201946.1,INSD:EL028094.1,INSD:EH838933.1,
INSD:DR232791.1,INSD:EL187936.1,INSD:EH818499.1,
INSD:EL286916.1,INSD:EH957835.1,INSD:EL033466.1,
INSD:EL106879.1,INSD:EH810923.1,INSD:DR232775.1,
INSD:EL039008.1,INSD:DR232796.1,INSD:EH983826.1,
INSD:EL119730.1,INSD:EL295507.1,INSD:AV805823.1,
INSD:EH930069.1,INSD:EL105631.1,INSD:EL333602.1,
INSD:EL114344.1,INSD:EH985561.1,INSD:EH913160.1,
INSD:EL162039.1,INSD:DR232794.1,INSD:EG520773.1,
INSD:EL194867.1,INSD:EL272006.1,INSD:DR232770.1,
INSD:DR232777.1,INSD:EL330673.1,INSD:EG529302.1,
INSD:BP783829.1,INSD:EL048040.1,INSD:EG462471.1,
INSD:AA394755.1,INSD:EH971083.1,INSD:EL204136.1,
INSD:EH866374.1,INSD:EL095338.1,INSD:EL328093.1,
INSD:AV829372.1,INSD:EH963666.1,INSD:EL155526.1,
INSD:AV788632.1,INSD:EL125215.1,INSD:EL130258.1,
INSD:EH890108.1,INSD:BP854093.1,INSD:EL261181.1,
INSD:EL099703.1,INSD:EL278287.1,INSD:EL284830.1,
INSD:BP778212.1,INSD:EL264176.1,INSD:EL263026.1,
INSD:EG527910.1,INSD:EL319022.1,INSD:EH883619.1,
INSD:BP613610.1,INSD:AA598173.1,INSD:EL017101.1,
INSD:EH870963.1,INSD:EL300343.1,INSD:EL261176.1,
INSD:EL233132.1,INSD:BP785544.1,INSD:AA651581.1,
INSD:DR232798.1,INSD:EL027371.1,INSD:EL168454.1,
INSD:EH823058.1,INSD:DR232776.1,INSD:EL333241.1,
INSD:EL006493.1,INSD:EL295108.1,INSD:EH932534.1,
INSD:EL116272.1,INSD:EL169279.1,INSD:EH895589.1,
INSD:EL099532.1,INSD:EL155092.1,INSD:DR232793.1,
INSD:EL091718.1,INSD:EL308344.1,INSD:EH979635.1,
INSD:EL049091.1,INSD:EH802285.1,INSD:AA598174.1,
INSD:EH988824.1,INSD:AA394818.1,INSD:EH831111.1,
INSD:EH929991.1,INSD:BP782457.1,INSD:DR232805.1,
INSD:EL203523.1,INSD:AA394798.1,INSD:BP780669.1,
INSD:EH874269.1,INSD:DR232788.1,INSD:EH874532.1,
INSD:EL280962.1,INSD:EL071856.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:AY136402.1,INSD:U91509.1,INSD:AK221716.1,
INSD:AY058095.1,INSD:BT002129.1"
/note="Aldolase-type TIM barrel family protein; FUNCTIONS
IN: glycolate oxidase activity, oxidoreductase activity,
FMN binding, catalytic activity; INVOLVED IN: oxidation
reduction, metabolic process; LOCATED IN: in 6 components;
EXPRESSED IN: cotyledon, fruit, guard cell, juvenile leaf,
leaf; EXPRESSED DURING: seedling growth; CONTAINS InterPro
DOMAIN/s: Aldolase-type TIM barrel (InterPro:IPR013785),
FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase, active
site (InterPro:IPR008259), FMN-dependent dehydrogenase
(InterPro:IPR000262), Alpha-hydroxy acid dehydrogenase,
FMN-dependent (InterPro:IPR012133); BEST Arabidopsis
thaliana protein match is: Aldolase-type TIM barrel family
protein (TAIR:AT3G14420.2); Has 11834 Blast hits to 11812
proteins in 1926 species: Archae - 158; Bacteria - 5520;
Metazoa - 369; Fungi - 693; Plants - 265; Viruses - 0;
Other Eukaryotes - 4829 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="TAIR:AT3G14415"
/db_xref="Araport:AT3G14415"
intron_pos 46:2 (1/10)
intron_pos 88:1 (2/10)
intron_pos 104:0 (3/10)
intron_pos 130:0 (4/10)
intron_pos 171:2 (5/10)
intron_pos 194:0 (6/10)
intron_pos 215:0 (7/10)
intron_pos 238:1 (8/10)
intron_pos 272:0 (9/10)
intron_pos 307:0 (10/10)
BEGIN
1 MEITNVTEYD AIAKAKLPKM VYDYYASGAE DQWTLQENRN AFARILFRPR ILIDVNKIDM
61 ATTVLGFKIS MPIMVAPTAF QKMAHPDGEY ATARAASAAG TIMTLSSWAT SSVEEVASTG
121 PGIRFFQLYV YKNRKVVEQL VRRAEKAGFK AIALTVDTPR LGRRESDIKN RFTLPPNLTL
181 KNFEGLDLGK MDEANDSGLA SYVAGQIDRT LSWKDIQWLQ TITNMPILVK GVLTGEDARI
241 AIQAGAAGII VSNHGARQLD YVPATISALE EVVKATQGRV PVFLDGGVRR GTDVFKALAL
301 GASGIFIGRP VVFALAAEGE AGVKKVLQML RDEFELTMAL SGCRSLSEIT RNHIVTEWDT
361 PRHLPRL
//