LOCUS AEE75009.1 446 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana fatty acid desaturase 7 protein.
ACCESSION CP002686-1966
PROTEIN_ID AEE75009.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Salanoubat,M., Lemcke,K., Rieger,M., Ansorge,W., Unseld,M.,
Fartmann,B., Valle,G., Blocker,H., Perez-Alonso,M., Obermaier,B.,
Delseny,M., Boutry,M., Grivell,L.A., Mache,R., Puigdomenech,P., De
Simone,V., Choisne,N., Artiguenave,F., Robert,C., Brottier,P.,
Wincker,P., Cattolico,L., Weissenbach,J., Saurin,W., Quetier,F.,
Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M., Benes,V.,
Wurmbach,E., Drzonek,H., Erfle,H., Jordan,N., Bangert,S.,
Wiedelmann,R., Kranz,H., Voss,H., Holland,R., Brandt,P.,
Nyakatura,G., Vezzi,A., D'Angelo,M., Pallavicini,A., Toppo,S.,
Simionati,B., Conrad,A., Hornischer,K., Kauer,G., Lohnert,T.H.,
Nordsiek,G., Reichelt,J., Scharfe,M., Schon,O., Bargues,M.,
Terol,J., Climent,J., Navarro,P., Collado,C., Perez-Perez,A.,
Ottenwalder,B., Duchemin,D., Cooke,R., Laudie,M., Berger-Llauro,C.,
Purnelle,B., Masuy,D., de Haan,M., Maarse,A.C., Alcaraz,J.P.,
Cottet,A., Casacuberta,E., Monfort,A., Argiriou,A., flores,M.,
Liguori,R., Vitale,D., Mannhaupt,G., Haase,D., Schoof,H., Rudd,S.,
Zaccaria,P., Mewes,H.W., Mayer,K.F., Kaul,S., Town,C.D., Koo,H.L.,
Tallon,L.J., Jenkins,J., Rooney,T., Rizzo,M., Walts,A.,
Utterback,T., Fujii,C.Y., Shea,T.P., Creasy,T.H., Haas,B.,
Maiti,R., Wu,D., Peterson,J., Van Aken,S., Pai,G., Militscher,J.,
Sellers,P., Gill,J.E., Feldblyum,T.V., Preuss,D., Lin,X.,
Nierman,W.C., Salzberg,S.L., White,O., Venter,J.C., Fraser,C.M.,
Kaneko,T., Nakamura,Y., Sato,S., Kato,T., Asamizu,E., Sasamoto,S.,
Kimura,T., Idesawa,K., Kawashima,K., Kishida,Y., Kiyokawa,C.,
Kohara,M., Matsumoto,M., Matsuno,A., Muraki,A., Nakayama,S.,
Nakazaki,N., Shinpo,S., Takeuchi,C., Wada,T., Watanabe,A.,
Yamada,M., Yasuda,M. and Tabata,S.
CONSRTM European Union Chromosome 3 Arabidopsis Sequencing Consortium;
Institute for Genomic Research; Kazusa DNA Research Institute
TITLE Sequence and analysis of chromosome 3 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 408 (6814), 820-822 (2000)
PUBMED 11130713
REFERENCE 2 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="3"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="FAD7"
/locus_tag="AT3G11170"
/gene_synonym="AtFAD7"
/gene_synonym="CHLOROPLAST PRECURSOR"
/gene_synonym="FADD"
/gene_synonym="fatty acid desaturase 7"
/gene_synonym="FATTY ACID DESATURASE D"
/gene_synonym="OMEGA-3 FATTY ACID DESATURASE"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:BP794441.1,INSD:EL113293.1,INSD:EH936046.1,
INSD:BP815950.1,INSD:EL997620.1,INSD:EH851409.1,
INSD:DR364830.1,INSD:BP646954.1,INSD:EL216861.1,
INSD:EL227213.1,INSD:AV784429.1,INSD:BP832673.1,
INSD:EH945357.1,INSD:EL201571.1,INSD:EL174931.1,
INSD:EL033508.1,INSD:EL292911.1,INSD:EH804901.1,
INSD:EL159970.1,INSD:BP799813.1,INSD:EL094735.1,
INSD:AV558054.1,INSD:EH817226.1,INSD:EH872561.1,
INSD:EH948034.1,INSD:EL233035.1,INSD:EL336395.1,
INSD:BP789169.1,INSD:EL010744.1,INSD:EL130950.1,
INSD:EL135030.1,INSD:EL160895.1,INSD:ES072491.1,
INSD:BP816942.1,INSD:EH859413.1,INSD:EL216540.1,
INSD:EL020736.1,INSD:DR364825.1,INSD:AV524991.1,
INSD:EH924159.1,INSD:EL116349.1,INSD:EH806952.1,
INSD:EH978289.1,INSD:EL181734.1,INSD:ES038616.1,
INSD:EH973313.1,INSD:AV519970.1,INSD:DR364828.1,
INSD:EL120562.1,INSD:BP646167.1,INSD:BP563867.1,
INSD:EL014187.1,INSD:EL241660.1,INSD:EL069991.1,
INSD:EL050779.1,INSD:EL017499.1,INSD:EH833567.1,
INSD:EL018460.1,INSD:AV822135.1,INSD:DR364824.1,
INSD:EH966139.1,INSD:EH845036.1,INSD:BP789205.1,
INSD:ES206010.1,INSD:AV549797.1,INSD:EL222159.1,
INSD:BP575789.1,INSD:BP844061.1,INSD:EL014414.1,
INSD:AV801257.1,INSD:EL310585.1,INSD:DR364829.1,
INSD:AV527480.1,INSD:BP777881.1,INSD:EH905681.1,
INSD:EL197472.1,INSD:EH913451.1,INSD:DR364826.1,
INSD:DR364823.1,INSD:BP794932.1,INSD:EH802414.1,
INSD:EL172049.1,INSD:EL211634.1,INSD:EH922570.1,
INSD:EH806613.1,INSD:EH849331.1,INSD:BU636308.1,
INSD:EL175873.1,INSD:EL297297.1,INSD:EL302752.1,
INSD:DR364819.1,INSD:EG421015.1,INSD:BX838822.1,
INSD:AV806893.1,INSD:BP790936.1,INSD:EL063404.1,
INSD:BP790638.1,INSD:BP653488.1,INSD:EH967416.1,
INSD:EH940462.1,INSD:EL145659.1,INSD:EL248043.1,
INSD:EL164663.1,INSD:EH807125.1,INSD:EH918272.1,
INSD:EL039857.1,INSD:EL202071.1,INSD:EH991723.1,
INSD:EL246136.1,INSD:EL172585.1,INSD:AV805111.1,
INSD:EH834501.1,INSD:BP849101.1,INSD:EH828472.1,
INSD:BP865804.1,INSD:DR364822.1,INSD:EL194764.1,
INSD:EH819962.1,INSD:EL164074.1,INSD:T04476.1,
INSD:BP778853.1,INSD:BP632827.1,INSD:AV537783.1,
INSD:EL268548.1,INSD:EL115750.1,INSD:AV814930.1,
INSD:EL155086.1,INSD:BP624107.1,INSD:AV532975.1,
INSD:EH971423.1,INSD:AV519981.1,INSD:EH916754.1,
INSD:EL117301.1,INSD:EH982450.1,INSD:EH945339.1,
INSD:EL145779.1,INSD:AV791551.1,INSD:EL135206.1,
INSD:ES122324.1,INSD:DR364821.1,INSD:AV816631.1,
INSD:BP795293.1,INSD:BP833196.1,INSD:DR259634.1,
INSD:EL014593.1,INSD:EL176172.1,INSD:AV814997.1,
INSD:AV804726.1,INSD:BP795255.1,INSD:EL230111.1,
INSD:EL334884.1,INSD:EH851907.1,INSD:EL258901.1,
INSD:ES010810.1,INSD:EL054255.1,INSD:BP794584.1,
INSD:ES025245.1,INSD:ES037299.1,INSD:EH851843.1,
INSD:EL261166.1,INSD:AV532053.1,INSD:EL265199.1,
INSD:AV801829.1,INSD:BP783037.1,INSD:EL223216.1,
INSD:ES045530.1,INSD:EL256083.1,INSD:AV785992.1,
INSD:ES182394.1,INSD:EL268308.1,INSD:EH857284.1,
INSD:BP835931.1,INSD:EH833206.1,INSD:EL044409.1,
INSD:EH828608.1,INSD:BP656139.1,INSD:EH955336.1,
INSD:EH914395.1,INSD:EH954947.1,INSD:EL089684.1,
INSD:EH929038.1,INSD:BP789264.1,INSD:EL241700.1,
INSD:EL265473.1,INSD:AV440178.1,INSD:BP828704.1,
INSD:EL320477.1,INSD:EL102631.1,INSD:EH934747.1,
INSD:AV806856.1,INSD:AV552816.1,INSD:EH986502.1,
INSD:ES046419.1,INSD:EL117997.1,INSD:EH821208.1,
INSD:EL228149.1,INSD:ES151328.1,INSD:BP660216.1,
INSD:EL016771.1,INSD:EL210135.1,INSD:DR364827.1,
INSD:AV793576.1,INSD:EL175795.1,INSD:EH848594.1,
INSD:AV788142.1,INSD:AV808703.1,INSD:ES041430.1,
INSD:BP825448.1,INSD:EH955186.1,INSD:EL097790.1,
INSD:EL237347.1,INSD:AV809274.1,INSD:BP591215.1,
INSD:EH840046.1,INSD:EL003797.1,INSD:EH956357.1,
INSD:EL019793.1,INSD:EH919415.1,INSD:EH973336.1,
INSD:BP660242.1,INSD:EL303471.1,INSD:EL186681.1,
INSD:BP650236.1,INSD:AV532730.1,INSD:EL142243.1,
INSD:BP779534.1,INSD:EH888222.1,INSD:EL149998.1,
INSD:EL259653.1,INSD:BP782333.1,INSD:BP779387.1,
INSD:EH797058.1,INSD:BX838179.1,INSD:EH909017.1,
INSD:EH882435.1,INSD:EL235916.1,INSD:EH832216.1,
INSD:AV807906.1,INSD:EL158857.1,INSD:EL131420.1,
INSD:BP561018.1,INSD:DR364820.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:D26019.1,INSD:BX824183.1,INSD:BX823702.1,
INSD:L22961.1,INSD:BX824950.1,INSD:AY102158.1,
INSD:AK220858.1,INSD:BX823863.1,INSD:AF389295.1"
/note="fatty acid desaturase 7 (FAD7); FUNCTIONS IN:
omega-3 fatty acid desaturase activity; INVOLVED IN:
response to cold, response to wounding, fatty acid
biosynthetic process, jasmonic acid mediated signaling
pathway; LOCATED IN: plastid membrane, chloroplast,
chloroplast envelope; EXPRESSED IN: male gametophyte,
guard cell, pollen tube; EXPRESSED DURING: L mature pollen
stage, M germinated pollen stage; CONTAINS InterPro
DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF3474
(InterPro:IPR021863), Fatty acid desaturase, type 1
(InterPro:IPR005804); BEST Arabidopsis thaliana protein
match is: fatty acid desaturase 8 (TAIR:AT5G05580.1); Has
2938 Blast hits to 2935 proteins in 698 species: Archae -
0; Bacteria - 1234; Metazoa - 17; Fungi - 265; Plants -
926; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 496 (source: NCBI
BLink)."
/db_xref="TAIR:AT3G11170"
/db_xref="Araport:AT3G11170"
intron_pos 165:2 (1/7)
intron_pos 195:2 (2/7)
intron_pos 218:0 (3/7)
intron_pos 249:0 (4/7)
intron_pos 311:0 (5/7)
intron_pos 338:0 (6/7)
intron_pos 384:0 (7/7)
BEGIN
1 MANLVLSECG IRPLPRIYTT PRSNFLSNNN KFRPSLSSSS YKTSSSPLSF GLNSRDGFTR
61 NWALNVSTPL TTPIFEESPL EEDNKQRFDP GAPPPFNLAD IRAAIPKHCW VKNPWKSLSY
121 VVRDVAIVFA LAAGAAYLNN WIVWPLYWLA QGTMFWALFV LGHDCGHGSF SNDPKLNSVV
181 GHLLHSSILV PYHGWRISHR THHQNHGHVE NDESWHPMSE KIYNTLDKPT RFFRFTLPLV
241 MLAYPFYLWA RSPGKKGSHY HPDSDLFLPK ERKDVLTSTA CWTAMAALLV CLNFTIGPIQ
301 MLKLYGIPYW INVMWLDFVT YLHHHGHEDK LPWYRGKEWS YLRGGLTTLD RDYGLINNIH
361 HDIGTHVIHH LFPQIPHYHL VEATEAAKPV LGKYYREPDK SGPLPLHLLE ILAKSIKEDH
421 YVSDEGEVVY YKADPNLYGE VKVRAD
//