LOCUS AEE73852.1 178 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana thioredoxin F-type 1 protein.
ACCESSION CP002686-375
PROTEIN_ID AEE73852.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Salanoubat,M., Lemcke,K., Rieger,M., Ansorge,W., Unseld,M.,
Fartmann,B., Valle,G., Blocker,H., Perez-Alonso,M., Obermaier,B.,
Delseny,M., Boutry,M., Grivell,L.A., Mache,R., Puigdomenech,P., De
Simone,V., Choisne,N., Artiguenave,F., Robert,C., Brottier,P.,
Wincker,P., Cattolico,L., Weissenbach,J., Saurin,W., Quetier,F.,
Schafer,M., Muller-Auer,S., Gabel,C., Fuchs,M., Benes,V.,
Wurmbach,E., Drzonek,H., Erfle,H., Jordan,N., Bangert,S.,
Wiedelmann,R., Kranz,H., Voss,H., Holland,R., Brandt,P.,
Nyakatura,G., Vezzi,A., D'Angelo,M., Pallavicini,A., Toppo,S.,
Simionati,B., Conrad,A., Hornischer,K., Kauer,G., Lohnert,T.H.,
Nordsiek,G., Reichelt,J., Scharfe,M., Schon,O., Bargues,M.,
Terol,J., Climent,J., Navarro,P., Collado,C., Perez-Perez,A.,
Ottenwalder,B., Duchemin,D., Cooke,R., Laudie,M., Berger-Llauro,C.,
Purnelle,B., Masuy,D., de Haan,M., Maarse,A.C., Alcaraz,J.P.,
Cottet,A., Casacuberta,E., Monfort,A., Argiriou,A., flores,M.,
Liguori,R., Vitale,D., Mannhaupt,G., Haase,D., Schoof,H., Rudd,S.,
Zaccaria,P., Mewes,H.W., Mayer,K.F., Kaul,S., Town,C.D., Koo,H.L.,
Tallon,L.J., Jenkins,J., Rooney,T., Rizzo,M., Walts,A.,
Utterback,T., Fujii,C.Y., Shea,T.P., Creasy,T.H., Haas,B.,
Maiti,R., Wu,D., Peterson,J., Van Aken,S., Pai,G., Militscher,J.,
Sellers,P., Gill,J.E., Feldblyum,T.V., Preuss,D., Lin,X.,
Nierman,W.C., Salzberg,S.L., White,O., Venter,J.C., Fraser,C.M.,
Kaneko,T., Nakamura,Y., Sato,S., Kato,T., Asamizu,E., Sasamoto,S.,
Kimura,T., Idesawa,K., Kawashima,K., Kishida,Y., Kiyokawa,C.,
Kohara,M., Matsumoto,M., Matsuno,A., Muraki,A., Nakayama,S.,
Nakazaki,N., Shinpo,S., Takeuchi,C., Wada,T., Watanabe,A.,
Yamada,M., Yasuda,M. and Tabata,S.
CONSRTM European Union Chromosome 3 Arabidopsis Sequencing Consortium;
Institute for Genomic Research; Kazusa DNA Research Institute
TITLE Sequence and analysis of chromosome 3 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 408 (6814), 820-822 (2000)
PUBMED 11130713
REFERENCE 2 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 23459830)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="3"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="TRXF1"
/locus_tag="AT3G02730"
/gene_synonym="ATF1"
/gene_synonym="thioredoxin F-type 1"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:EH963792.1,INSD:EL007770.1,INSD:EL128141.1,
INSD:EL284740.1,INSD:EH980403.1,INSD:EH881312.1,
INSD:EL089444.1,INSD:BP816970.1,INSD:EL339721.1,
INSD:EL076595.1,INSD:EL338707.1,INSD:EL124788.1,
INSD:ES203718.1,INSD:EL149730.1,INSD:EH857576.1,
INSD:DR294329.1,INSD:EH984985.1,INSD:EL207492.1,
INSD:EL297460.1,INSD:EL057598.1,INSD:EH895094.1,
INSD:EL163999.1,INSD:EL287777.1,INSD:BU634885.1,
INSD:EL148129.1,INSD:EH937801.1,INSD:EL004866.1,
INSD:EH982604.1,INSD:EH860169.1,INSD:DR294320.1,
INSD:EH889355.1,INSD:DR294327.1,INSD:EL006653.1,
INSD:EH823244.1,INSD:EH938484.1,INSD:EL079789.1,
INSD:EL152037.1,INSD:EL302276.1,INSD:EL199589.1,
INSD:EL004930.1,INSD:BE038707.1,INSD:EH921194.1,
INSD:EH800936.1,INSD:EL023824.1,INSD:EL123921.1,
INSD:EH969247.1,INSD:EH894353.1,INSD:ES130112.1,
INSD:EL100323.1,INSD:EL134290.1,INSD:EH927264.1,
INSD:EG527011.1,INSD:EL339831.1,INSD:EL048978.1,
INSD:EH898540.1,INSD:EL179191.1,INSD:EH948237.1,
INSD:EH897730.1,INSD:EL049599.1,INSD:EG527022.1,
INSD:EH868126.1,INSD:EL120985.1,INSD:EL235716.1,
INSD:EL245428.1,INSD:EL091985.1,INSD:EL212666.1,
INSD:EL254311.1,INSD:EH866609.1,INSD:EL096700.1,
INSD:EL161932.1,INSD:EH900077.1,INSD:EH942611.1,
INSD:EH816652.1,INSD:EH889664.1,INSD:EL124558.1,
INSD:EL341030.1,INSD:EL069453.1,INSD:EL190210.1,
INSD:EL284536.1,INSD:DR294328.1,INSD:EL283530.1,
INSD:EH944489.1,INSD:AV536620.1,INSD:EL094089.1,
INSD:EH923928.1,INSD:EH979333.1,INSD:EL257405.1,
INSD:EL293143.1,INSD:EL164427.1,INSD:EL066527.1,
INSD:EH807224.1,INSD:EL313544.1,INSD:EL230006.1,
INSD:EL124991.1,INSD:EL037888.1,INSD:EL090588.1,
INSD:EH993420.1,INSD:DR294319.1,INSD:EH944996.1,
INSD:EL220304.1,INSD:EH924355.1,INSD:EH983161.1,
INSD:EH957023.1,INSD:EL213460.1,INSD:EL149849.1,
INSD:EH947392.1,INSD:EL271285.1,INSD:EH900388.1,
INSD:EL193648.1,INSD:EL283123.1,INSD:BP844170.1,
INSD:EH894573.1,INSD:ES060324.1,INSD:EH858619.1,
INSD:EL238615.1,INSD:T45485.1,INSD:EL010648.1,
INSD:EH948663.1,INSD:EL168600.1,INSD:EL265511.1,
INSD:EL107743.1,INSD:DR294322.1,INSD:AV558019.1,
INSD:EH901827.1,INSD:EL324341.1,INSD:EL186577.1,
INSD:DR294321.1,INSD:EL187402.1,INSD:EH917224.1,
INSD:EH829557.1,INSD:EL008261.1,INSD:EL030387.1,
INSD:EH901825.1,INSD:EG528201.1,INSD:EH963610.1,
INSD:EL049069.1,INSD:EG522508.1,INSD:EL047086.1,
INSD:EG522509.1,INSD:DR294324.1,INSD:EH820477.1,
INSD:EH800822.1,INSD:EL211131.1,INSD:EL245624.1,
INSD:EL128355.1,INSD:EL320854.1,INSD:EL139663.1,
INSD:EH941703.1,INSD:EH904177.1,INSD:EH902242.1,
INSD:EL104020.1,INSD:EH835101.1,INSD:EL124831.1,
INSD:EL098799.1,INSD:EL312919.1,INSD:EL178417.1,
INSD:EL265330.1,INSD:EL052992.1,INSD:EL291793.1,
INSD:EH860254.1,INSD:EL331378.1,INSD:EH917147.1,
INSD:EL058617.1,INSD:EH945775.1,INSD:EH851198.1,
INSD:EH842748.1,INSD:EL232317.1,INSD:EH822913.1,
INSD:EH980429.1,INSD:EL151852.1,INSD:EL035723.1,
INSD:EH853268.1,INSD:AA597589.1,INSD:EG528200.1,
INSD:EL233975.1,INSD:EL126974.1,INSD:EL263576.1,
INSD:AV537001.1,INSD:EL292652.1,INSD:EH976827.1,
INSD:EL037953.1,INSD:EL234513.1,INSD:EL080796.1,
INSD:EL185831.1,INSD:EH934179.1,INSD:EL301168.1,
INSD:EL138113.1,INSD:BP630532.1,INSD:EH971837.1,
INSD:EL338547.1,INSD:EL048499.1,INSD:EL194788.1,
INSD:EH870362.1,INSD:EH879211.1,INSD:EL060152.1,
INSD:EH980800.1,INSD:EL082592.1,INSD:EH813163.1,
INSD:EH915021.1,INSD:EH896882.1,INSD:BP796658.1,
INSD:EL307674.1,INSD:EL286229.1,INSD:AV824381.1,
INSD:EL321408.1,INSD:EL186490.1,INSD:EL033483.1,
INSD:EH856524.1,INSD:EH808550.1,INSD:EL139336.1,
INSD:EL301497.1,INSD:EL126239.1,INSD:EL092202.1,
INSD:EH804220.1,INSD:EL970325.1,INSD:EH860999.1,
INSD:EL042213.1,INSD:EL324769.1,INSD:EL121857.1,
INSD:EH891805.1,INSD:EL320552.1,INSD:EL250718.1,
INSD:EH898451.1,INSD:EL043933.1,INSD:EL214287.1,
INSD:EH915661.1,INSD:EH885719.1,INSD:EL101384.1,
INSD:EH891621.1,INSD:EH869857.1,INSD:BP861669.1,
INSD:EL091953.1,INSD:EL154856.1"
/inference="Similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:AY084778.1,INSD:BX825421.1,INSD:AY065391.1,
INSD:AF144385.1,INSD:AY096721.1"
/note="thioredoxin F-type 1 (TRXF1); FUNCTIONS IN: enzyme
activator activity; INVOLVED IN: positive regulation of
catalytic activity; LOCATED IN: chloroplast, chloroplast
stroma; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED
DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s:
Thioredoxin fold (InterPro:IPR012335), Thioredoxin-like
subdomain (InterPro:IPR006662), Thioredoxin, core
(InterPro:IPR015467), Thioredoxin-like
(InterPro:IPR017936), Thioredoxin domain
(InterPro:IPR013766), Thioredoxin-like fold
(InterPro:IPR012336), Thioredoxin, conserved site
(InterPro:IPR017937); BEST Arabidopsis thaliana protein
match is: thioredoxin F2 (TAIR:AT5G16400.1); Has 15154
Blast hits to 14708 proteins in 2900 species: Archae -
210; Bacteria - 7832; Metazoa - 1846; Fungi - 908; Plants
- 1556; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 2799 (source: NCBI
BLink)."
/db_xref="TAIR:AT3G02730"
/db_xref="Araport:AT3G02730"
intron_pos 98:2 (1/2)
intron_pos 132:0 (2/2)
BEGIN
1 MPLSLRLSPS PTALSPTTGG FGPSRKQCRI PYSGVPTTKI GFCSLDSRKR GDSSVVRCSL
61 ETVNVSVGQV TEVDKDTFWP IVKAAGEKLV VLDMYTQWCG PCKVIAPKYK ALSEKYDDVV
121 FLKLDCNPDN RPLAKELGIR VVPTFKILKD NKVVKEVTGA KYDDLVAAIE TARSAASG
//