LOCUS AEC10521.1 122 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana AUTOPHAGY 8E protein.
ACCESSION CP002685-6999
PROTEIN_ID AEC10521.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Lin,X., Kaul,S., Rounsley,S., Shea,T.P., Benito,M.I., Town,C.D.,
Fujii,C.Y., Mason,T., Bowman,C.L., Barnstead,M., Feldblyum,T.V.,
Buell,C.R., Ketchum,K.A., Lee,J., Ronning,C.M., Koo,H.L.,
Moffat,K.S., Cronin,L.A., Shen,M., Pai,G., Van Aken,S., Umayam,L.,
Tallon,L.J., Gill,J.E., Adams,M.D., Carrera,A.J., Creasy,T.H.,
Goodman,H.M., Somerville,C.R., Copenhaver,G.P., Preuss,D.,
Nierman,W.C., White,O., Eisen,J.A., Salzberg,S.L., Fraser,C.M. and
Venter,J.C.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 2 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 761-768 (1999)
PUBMED 10617197
REFERENCE 2 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="2"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="ATG8E"
/locus_tag="AT2G45170"
/gene_synonym="ATATG8E"
/gene_synonym="AUTOPHAGY 8E"
/gene_synonym="T14P1.2"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:EH871115.1,INSD:EL243704.1,INSD:ES027549.1,
INSD:ES029118.1,INSD:EL159405.1,INSD:EH897249.1,
INSD:EH796567.1,INSD:EL081552.1,INSD:EH812838.1,
INSD:EH939098.1,INSD:CB257428.1,INSD:EL971758.1,
INSD:EH889626.1,INSD:EL221646.1,INSD:EH816187.1,
INSD:EL210544.1,INSD:ES214316.1,INSD:EL180422.1,
INSD:EL213588.1,INSD:EH827957.1,INSD:EL194427.1,
INSD:CD533447.1,INSD:ES087985.1,INSD:EH994306.1,
INSD:EH849307.1,INSD:EL214687.1,INSD:DR382652.1,
INSD:EL267575.1,INSD:H36155.1,INSD:EL286013.1,
INSD:EL972758.1,INSD:EG509807.1,INSD:ES044396.1,
INSD:EL028087.1,INSD:EH908732.1,INSD:CD531934.1,
INSD:EH798338.1,INSD:EL307537.1,INSD:EH989510.1,
INSD:EL030542.1,INSD:EL968290.1,INSD:EL198132.1,
INSD:BP567070.1,INSD:EL113898.1,INSD:EL308977.1,
INSD:EL281940.1,INSD:EL051744.1,INSD:EL199232.1,
INSD:EH806468.1,INSD:EL109651.1,INSD:EL969393.1,
INSD:EL185678.1,INSD:ES042261.1,INSD:EL124535.1,
INSD:ES013011.1,INSD:EL020577.1,INSD:EL321282.1,
INSD:EL204149.1,INSD:EH862481.1,INSD:EH921823.1,
INSD:AV787767.1,INSD:CD530039.1,INSD:H36555.1,
INSD:EL327102.1,INSD:EL109230.1,INSD:EH953830.1,
INSD:EL171931.1,INSD:CD532471.1,INSD:AV800799.1,
INSD:EH944135.1,INSD:EL177631.1,INSD:EL138157.1,
INSD:EL275962.1,INSD:Z46714.1,INSD:EH802970.1,
INSD:EL967739.1,INSD:EL976820.1,INSD:EL049613.1,
INSD:ES118661.1,INSD:AI998809.1,INSD:EL168060.1,
INSD:EL328774.1,INSD:EH902142.1,INSD:EL070451.1,
INSD:EL968836.1,INSD:EH838805.1,INSD:EL325613.1,
INSD:EL037887.1,INSD:EH956873.1,INSD:CD529504.1,
INSD:EH810401.1,INSD:EL972924.1,INSD:CD533314.1,
INSD:BP657070.1,INSD:CB263610.1,INSD:EH806683.1,
INSD:ES031342.1,INSD:AV805879.1,INSD:EL071729.1,
INSD:EL129508.1,INSD:EL971291.1,INSD:EL098014.1,
INSD:ES000298.1,INSD:EL067710.1,INSD:EL169241.1"
/inference="similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:BX842088.1,INSD:BX821631.1"
/note="AUTOPHAGY 8E (ATATG8E); CONTAINS InterPro DOMAIN/s:
Light chain 3 (LC3) (InterPro:IPR004241); BEST Arabidopsis
thaliana protein match is: Ubiquitin-like superfamily
protein (TAIR:AT4G16520.2); Has 30201 Blast hits to 17322
proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396;
Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0;
Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="Araport:AT2G45170"
/db_xref="TAIR:AT2G45170"
intron_pos 14:1 (1/3)
intron_pos 33:0 (2/3)
intron_pos 50:2 (3/3)
BEGIN
1 MNKGSIFKMD NDFEKRKAEA GRIREKYPDR IPVIVEKAEK SEVPNIDKKK YLVPSDLTVG
61 QFVYVIRKRI KLSAEKAIFI FVDNVLPPTG ELMSSVYEDK KDEDGFLYIT YSGENTFGAS
121 SI
//