LOCUS AEC10090.1 234 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana Rhodanese/Cell cycle control phosphatase
superfamily protein protein.
ACCESSION CP002685-6432
PROTEIN_ID AEC10090.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Lin,X., Kaul,S., Rounsley,S., Shea,T.P., Benito,M.I., Town,C.D.,
Fujii,C.Y., Mason,T., Bowman,C.L., Barnstead,M., Feldblyum,T.V.,
Buell,C.R., Ketchum,K.A., Lee,J., Ronning,C.M., Koo,H.L.,
Moffat,K.S., Cronin,L.A., Shen,M., Pai,G., Van Aken,S., Umayam,L.,
Tallon,L.J., Gill,J.E., Adams,M.D., Carrera,A.J., Creasy,T.H.,
Goodman,H.M., Somerville,C.R., Copenhaver,G.P., Preuss,D.,
Nierman,W.C., White,O., Eisen,J.A., Salzberg,S.L., Fraser,C.M. and
Venter,J.C.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 2 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 761-768 (1999)
PUBMED 10617197
REFERENCE 2 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="2"
/ecotype="Columbia"
protein /locus_tag="AT2G42220"
/gene_synonym="T24P15.13"
/gene_synonym="T24P15_13"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:EL332591.1,INSD:EL107484.1,INSD:EL297670.1,
INSD:EL010397.1,INSD:EH823323.1,INSD:DR210299.1,
INSD:EL300029.1,INSD:AV547136.1,INSD:EL147782.1,
INSD:EL006059.1,INSD:ES067427.1,INSD:EL016746.1,
INSD:EL265501.1,INSD:DR210308.1,INSD:AV783958.1,
INSD:EL143955.1,INSD:EL282489.1,INSD:EH855640.1,
INSD:EL148061.1,INSD:EH909834.1,INSD:EL199218.1,
INSD:BP648938.1,INSD:EH839849.1,INSD:BP868844.2,
INSD:EL266260.1,INSD:BP795636.1,INSD:BP816084.1,
INSD:BP626132.1,INSD:EL051366.1,INSD:EH904401.1,
INSD:EL123882.1,INSD:EH889600.1,INSD:EL011881.1,
INSD:EH951711.1,INSD:EL092762.1,INSD:EH805636.1,
INSD:EL057892.1,INSD:EL275651.1,INSD:EH978813.1,
INSD:AV825889.1,INSD:EL044773.1,INSD:EL086442.1,
INSD:BP868587.1,INSD:EH841420.1,INSD:ES113808.1,
INSD:AV830010.1,INSD:EH989678.1,INSD:AV792819.1,
INSD:BP650760.1,INSD:BP576061.1,INSD:DR383919.1,
INSD:BP864860.1,INSD:EL341796.1,INSD:EH838292.1,
INSD:DR210306.1,INSD:BP818813.1,INSD:EH831426.1,
INSD:DR210302.1,INSD:EH864906.1,INSD:EH968543.1,
INSD:DR210295.1,INSD:EL305906.1,INSD:DR374998.1,
INSD:EL309436.1,INSD:AV559397.1,INSD:EH972850.1,
INSD:BP657085.1,INSD:EL335521.1,INSD:BP617148.1,
INSD:EH969799.1,INSD:EL312454.1,INSD:EL291772.1,
INSD:EH981356.1,INSD:DR210307.1,INSD:EL162855.1,
INSD:EL290039.1,INSD:EL324366.1,INSD:DR210309.1,
INSD:EL142464.1,INSD:EL049439.1,INSD:EL030448.1,
INSD:EL094462.1,INSD:EL252614.1,INSD:BP851042.1,
INSD:BP840987.1,INSD:AV803316.1,INSD:EL171733.1,
INSD:EH897441.1,INSD:EL191569.1,INSD:EL261063.1,
INSD:EL021723.1,INSD:EH864706.1,INSD:EL100549.1,
INSD:EL062521.1,INSD:EL051093.1,INSD:EH926428.1,
INSD:EL260298.1,INSD:EL020802.1,INSD:EL170467.1,
INSD:EL283877.1,INSD:BP569037.1,INSD:EH796957.1,
INSD:EL251559.1,INSD:EH944361.1,INSD:EH824994.1,
INSD:EH848584.1,INSD:AV441425.1,INSD:BP819637.1,
INSD:BP663682.1,INSD:DR210296.1,INSD:EL310003.1,
INSD:EL216806.1,INSD:EL256056.1,INSD:EL110785.1,
INSD:ES094384.1,INSD:EL335798.1,INSD:EL115991.1,
INSD:EL316729.1,INSD:EL187509.1,INSD:ES187485.1,
INSD:EL206455.1,INSD:EH797799.1,INSD:EL108080.1,
INSD:AV809560.1,INSD:DR210303.1,INSD:EL037836.1,
INSD:EL228793.1,INSD:BP815231.1,INSD:DR210294.1,
INSD:ES102957.1,INSD:DR210305.1,INSD:EH917359.1,
INSD:EL162250.1,INSD:EH978190.1,INSD:EH931955.1,
INSD:BP838316.1,INSD:EL048225.1,INSD:EL324546.1,
INSD:EL062661.1,INSD:BE524505.1,INSD:DR210301.1,
INSD:AV535453.1,INSD:DR210300.1,INSD:EH946681.1,
INSD:EH992595.1,INSD:EL251684.1,INSD:EL005615.1,
INSD:CA781778.1,INSD:EL008693.1,INSD:EH858483.1,
INSD:EL290200.1,INSD:EH892932.1,INSD:AV786910.1,
INSD:ES032464.1,INSD:EH972079.1,INSD:ES026175.1,
INSD:EL324193.1"
/inference="similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:AY085207.1,INSD:AY045616.1"
/note="Rhodanese/Cell cycle control phosphatase
superfamily protein; FUNCTIONS IN: molecular_function
unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED
IN: chloroplast thylakoid membrane, chloroplast; EXPRESSED
IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth
stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Rhodanese-like
(InterPro:IPR001763); BEST Arabidopsis thaliana protein
match is: Rhodanese/Cell cycle control phosphatase
superfamily protein (TAIR:AT3G08920.1); Has 955 Blast hits
to 955 proteins in 207 species: Archae - 14; Bacteria -
343; Metazoa - 1; Fungi - 0; Plants - 204; Viruses - 0;
Other Eukaryotes - 393 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="Araport:AT2G42220"
/db_xref="TAIR:AT2G42220"
intron_pos 16:2 (1/5)
intron_pos 100:1 (2/5)
intron_pos 150:2 (3/5)
intron_pos 179:1 (4/5)
intron_pos 214:1 (5/5)
BEGIN
1 MAGIISPSPT ALYFTSNVGG RRLKAVSWAG KSVSGNVIRR RSLRIAAELK FVNAEEAKQL
61 IAEEGYSVVD VRDKTQFERA HIKSCSHIPL FIYNEDNDIG TIIKRTVHNN FSGLFFGLPF
121 TKVNPEFLKS VRNEFSQDSK LLLVCQEGLR SAAAASRLEE AGYENIACVT SGLQSVKPGT
181 FESVGSTELQ NAGKAGLITI QGKISAVLGT VLVCAYLFIQ FFPDQAEKLF PPTS
//