LOCUS AEC09930.1 289 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana Calcium-binding EF hand family protein
protein.
ACCESSION CP002685-6212
PROTEIN_ID AEC09930.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Lin,X., Kaul,S., Rounsley,S., Shea,T.P., Benito,M.I., Town,C.D.,
Fujii,C.Y., Mason,T., Bowman,C.L., Barnstead,M., Feldblyum,T.V.,
Buell,C.R., Ketchum,K.A., Lee,J., Ronning,C.M., Koo,H.L.,
Moffat,K.S., Cronin,L.A., Shen,M., Pai,G., Van Aken,S., Umayam,L.,
Tallon,L.J., Gill,J.E., Adams,M.D., Carrera,A.J., Creasy,T.H.,
Goodman,H.M., Somerville,C.R., Copenhaver,G.P., Preuss,D.,
Nierman,W.C., White,O., Eisen,J.A., Salzberg,S.L., Fraser,C.M. and
Venter,J.C.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 2 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 761-768 (1999)
PUBMED 10617197
REFERENCE 2 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="2"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="TCH3"
/locus_tag="AT2G41100"
/gene_synonym="ARABIDOPSIS THALIANA CALMODULIN LIKE 4"
/gene_synonym="ATCAL4"
/gene_synonym="calmodulin-like 12"
/gene_synonym="CALMODULIN-RELATED PROTEIN"
/gene_synonym="CML12"
/gene_synonym="T3K9.13"
/gene_synonym="T3K9_13"
/gene_synonym="TOUCH 3"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:EL049842.1,INSD:EH850241.1,INSD:BP648217.1,
INSD:EL090448.1,INSD:BP629804.1,INSD:EL172216.1,
INSD:EH969955.1,INSD:EH856064.1,INSD:EH976571.1,
INSD:BP664951.1,INSD:EL152893.1,INSD:EL147912.1,
INSD:EL103156.1,INSD:BP602327.1,INSD:BP600256.1,
INSD:EH924745.1,INSD:EH883792.1,INSD:EH976955.1,
INSD:EL156472.1,INSD:BP616606.1,INSD:EH851831.1,
INSD:EH949095.1,INSD:EL159965.1,INSD:EL230684.1,
INSD:BP589924.1,INSD:BP829467.1,INSD:BP668614.1,
INSD:EL311978.1,INSD:BP665163.1,INSD:EL069019.1,
INSD:BP594065.1,INSD:EL103364.1,INSD:EH813014.1,
INSD:AV808106.1,INSD:EH960976.1,INSD:BP663541.1,
INSD:EH890132.1,INSD:BP588350.1,INSD:EL125779.1,
INSD:EL225608.1,INSD:EL304607.1,INSD:AV812972.1,
INSD:EL034246.1,INSD:BP625399.1,INSD:EH874159.1,
INSD:EL305807.1,INSD:EH943971.1,INSD:BP785647.1,
INSD:EH975663.1,INSD:EH976413.1,INSD:EL155143.1,
INSD:AV802950.1,INSD:EH954325.1,INSD:EL277144.1,
INSD:EL075655.1,INSD:AV536988.1,INSD:N97207.1,
INSD:BP625098.1,INSD:EL273697.1,INSD:EH881965.1,
INSD:AV811136.1,INSD:AV814770.1,INSD:EH985600.1,
INSD:BP786675.1,INSD:BP659640.1,INSD:EH952102.1,
INSD:BP603860.1,INSD:BP609238.1,INSD:BP670197.1,
INSD:BP654012.1,INSD:EL310563.1,INSD:BP632605.1,
INSD:AV783672.1,INSD:EG439165.1,INSD:EH845854.1,
INSD:BP634952.1,INSD:EL136789.1,INSD:EL235995.1,
INSD:EL158340.1,INSD:EH833782.1,INSD:EG505187.1,
INSD:BP668785.1,INSD:EL045230.1,INSD:EL285229.1,
INSD:EL099874.1,INSD:BP620231.1,INSD:EL154113.1,
INSD:EL217515.1,INSD:EL081205.1,INSD:EL095008.1,
INSD:BP595919.1,INSD:BP784794.1,INSD:BP663426.1,
INSD:EH856142.1,INSD:AV536907.1,INSD:EG503835.1,
INSD:EL095489.1,INSD:EH905137.1,INSD:BP663778.1,
INSD:EH989492.1,INSD:EL255141.1,INSD:EH982858.1,
INSD:EL035052.1,INSD:BP669391.1,INSD:EL073080.1,
INSD:EH859831.1,INSD:CB074261.1,INSD:EH910533.1,
INSD:EL248095.1,INSD:EL114823.1,INSD:EL115715.1,
INSD:BP662710.1,INSD:BP634776.1,INSD:EL045411.1,
INSD:N38224.1,INSD:BP662397.1,INSD:EL205478.1,
INSD:EL123267.1,INSD:CD531207.1,INSD:BP629949.1,
INSD:BE662892.1,INSD:BP634980.1,INSD:EH956627.1,
INSD:EH981621.1,INSD:EL055430.1,INSD:EL287077.1,
INSD:EL048405.1,INSD:EL232329.1,INSD:EL266566.1,
INSD:EL055332.1,INSD:EL271030.1,INSD:EL098558.1,
INSD:EL207102.1,INSD:EL147623.1,INSD:BP654468.1,
INSD:EL243338.1,INSD:EG486605.1,INSD:EH886712.1,
INSD:EL270725.1,INSD:EL217454.1,INSD:BP649819.1,
INSD:EL147045.1,INSD:EH993888.1,INSD:EH875106.1,
INSD:EH983113.1,INSD:EL309010.1,INSD:EL195541.1,
INSD:BP629975.1,INSD:EH846752.1,INSD:EL252422.1,
INSD:EL198530.1,INSD:BP596335.1,INSD:BP666052.1,
INSD:EL226943.1,INSD:BP630845.1,INSD:EH956213.1,
INSD:BE662975.1,INSD:EL057311.1,INSD:BP617527.1,
INSD:BP669768.1,INSD:AV787877.1,INSD:EL057432.1,
INSD:AV814074.1,INSD:BP667365.1,INSD:EL314520.1,
INSD:EL203898.1,INSD:EL039944.1,INSD:AV804987.1,
INSD:EH936684.1,INSD:BP670109.1,INSD:BP668173.1,
INSD:BP666449.1,INSD:EH840686.1,INSD:EL070499.1,
INSD:EH865450.1,INSD:EH987317.1,INSD:EH825405.1,
INSD:EL257668.1,INSD:EL334964.1,INSD:BP665853.1,
INSD:EH880284.1,INSD:EL329255.1,INSD:BP641088.1,
INSD:EL155806.1,INSD:EL178717.1,INSD:EL005364.1,
INSD:EL191858.1,INSD:BP593411.1,INSD:EL236704.1,
INSD:EH862340.1,INSD:EL283168.1,INSD:EL119178.1,
INSD:EH989672.1,INSD:EL072982.1,INSD:EL095848.1,
INSD:EH964497.1,INSD:AV544165.1,INSD:EL125148.1"
/inference="similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:BT011896.1,INSD:BX818994.1,INSD:BT000036.1"
/note="TOUCH 3 (TCH3); FUNCTIONS IN: calcium ion binding;
INVOLVED IN: response to mechanical stimulus, response to
temperature stimulus, thigmotropism, response to absence
of light; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 26
plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages;
CONTAINS InterPro DOMAIN/s: EF-Hand 1, calcium-binding
site (InterPro:IPR018247), EF-HAND 2 (InterPro:IPR018249),
EF-hand-like domain (InterPro:IPR011992), Calcium-binding
EF-hand (InterPro:IPR002048), EF-hand
(InterPro:IPR018248); BEST Arabidopsis thaliana protein
match is: calmodulin 5 (TAIR:AT2G27030.3); Has 35333 Blast
hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798;
Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants -
531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI
BLink)."
/db_xref="Araport:AT2G41100"
/db_xref="TAIR:AT2G41100"
intron_pos 80:1 (1/2)
intron_pos 170:1 (2/2)
BEGIN
1 MMRSIGEKPT KADLQDLMNE ADLDGDGTID FPEFLCVMAK NQGHDQAPRH TKKTMADKLT
61 DDQITEYRES FRLFDKNGDG SITKKELRTV MFSLGKNRTK ADLQDMMNEV DLDGDGTIDF
121 PEFLYLMAKN QGHDQAPRHT KKTMVDYQLT DDQILEFREA FRVFDKNGDG YITVNELRTT
181 MRSLGETQTK AELQDMINEA DADGDGTISF SEFVCVMTGK MIDTQSKKET YRVVNQGQGQ
241 VQRHTRNDRA GGTNWERDIA VGVASNIIAS PISDFMKDRF KDLFEALLS
//