LOCUS AEC09770.1 258 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana Clathrin light chain protein protein.
ACCESSION CP002685-5983
PROTEIN_ID AEC09770.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Lin,X., Kaul,S., Rounsley,S., Shea,T.P., Benito,M.I., Town,C.D.,
Fujii,C.Y., Mason,T., Bowman,C.L., Barnstead,M., Feldblyum,T.V.,
Buell,C.R., Ketchum,K.A., Lee,J., Ronning,C.M., Koo,H.L.,
Moffat,K.S., Cronin,L.A., Shen,M., Pai,G., Van Aken,S., Umayam,L.,
Tallon,L.J., Gill,J.E., Adams,M.D., Carrera,A.J., Creasy,T.H.,
Goodman,H.M., Somerville,C.R., Copenhaver,G.P., Preuss,D.,
Nierman,W.C., White,O., Eisen,J.A., Salzberg,S.L., Fraser,C.M. and
Venter,J.C.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 2 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 761-768 (1999)
PUBMED 10617197
REFERENCE 2 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="2"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="CLC2"
/locus_tag="AT2G40060"
/gene_synonym="clathrin light chain 2"
/gene_synonym="T28M21.22"
/gene_synonym="T28M21_22"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:EL169565.1,INSD:AA720270.1,INSD:EL989020.1,
INSD:EL032955.1,INSD:EH887358.1,INSD:EH960198.1,
INSD:BP834603.1,INSD:ES018659.1,INSD:EL330987.1,
INSD:ES175703.1,INSD:EL273001.1,INSD:EH881154.1,
INSD:AV535129.1,INSD:EL257805.1,INSD:EL245688.1,
INSD:EL223714.1,INSD:EL243579.1,INSD:ES061662.1,
INSD:EH897622.1,INSD:BP663289.1,INSD:EL012035.1,
INSD:EH920165.1,INSD:EH909828.1,INSD:EH823520.1,
INSD:AV786559.1,INSD:EH900649.1,INSD:BP858366.1,
INSD:ES195210.1,INSD:BP658640.1,INSD:EL982606.1,
INSD:DR370788.1,INSD:EL330036.1,INSD:BP821909.1,
INSD:EH904132.1,INSD:EG422341.1,INSD:EL289664.1,
INSD:EG496529.1,INSD:EL052813.1,INSD:EL337446.1,
INSD:EH921826.1,INSD:EL132272.1,INSD:BP811703.1,
INSD:EH985750.1,INSD:EL094332.1,INSD:ES057546.1,
INSD:EL339605.1,INSD:EL299899.1,INSD:EL002612.1,
INSD:EL062202.1,INSD:EH878907.1,INSD:EL971285.1,
INSD:EH804637.1,INSD:EH824142.1,INSD:AV540069.1,
INSD:BP561136.2,INSD:ES044102.1,INSD:EH986943.1,
INSD:EL158228.1,INSD:EL019979.1,INSD:EL071817.1,
INSD:EH903714.1,INSD:EH930070.1,INSD:EH981635.1,
INSD:ES015970.1,INSD:BP564503.1,INSD:EH895194.1,
INSD:EL981996.1,INSD:ES126786.1,INSD:EL265273.1,
INSD:ES016611.1,INSD:ES140643.1,INSD:EL007459.1,
INSD:EL326792.1,INSD:EH935890.1,INSD:EL296787.1,
INSD:EL139429.1,INSD:EL968738.1,INSD:AV556947.1,
INSD:EH970003.1,INSD:ES152012.1,INSD:EL112393.1,
INSD:EH843141.1,INSD:EL088687.1,INSD:DR279825.1,
INSD:EL326433.1,INSD:EL311289.1,INSD:EL293564.1,
INSD:EH984254.1,INSD:AA650806.1,INSD:EL168611.1,
INSD:AV564279.1,INSD:EL218183.1,INSD:EL316917.1,
INSD:DR279826.1,INSD:EL259216.1,INSD:EL279590.1,
INSD:EH935062.1,INSD:EL318926.1,INSD:EH983444.1,
INSD:EH971257.1,INSD:EL018365.1,INSD:EL297020.1,
INSD:EL176357.1,INSD:EH964922.1,INSD:EL057466.1,
INSD:BP848239.1,INSD:EL055290.1,INSD:EL027813.1,
INSD:EL280849.1,INSD:ES200947.1,INSD:EL033523.1,
INSD:EL062791.1,INSD:EL198261.1,INSD:ES066377.1,
INSD:EH916566.1,INSD:EH914366.1,INSD:AA395890.1,
INSD:ES063084.1,INSD:EL039440.1,INSD:ES022318.1,
INSD:DR379954.1,INSD:EL975231.1,INSD:EL109619.1,
INSD:EL256726.1,INSD:EL262526.1,INSD:EL123987.1,
INSD:EL233630.1,INSD:BP651908.1,INSD:EL003849.1,
INSD:EL210500.1,INSD:EH984059.1,INSD:EL064737.1,
INSD:ES179327.1,INSD:EL210893.1,INSD:BP622280.1,
INSD:EL224230.1,INSD:EL222390.1,INSD:CB254646.1,
INSD:EL267530.1,INSD:ES032178.1,INSD:EL200098.1,
INSD:BP844623.1,INSD:EL224503.1,INSD:BP787194.1,
INSD:AV532892.1,INSD:EL034752.1,INSD:EL285048.1,
INSD:EL023962.1,INSD:EH942268.1,INSD:EH798814.1,
INSD:EH964844.1,INSD:EH796980.1,INSD:EL256287.1,
INSD:EH977530.1,INSD:EH940408.1,INSD:ES124215.1,
INSD:EH952610.1,INSD:BP582742.1,INSD:EL071872.1,
INSD:EH980605.1,INSD:EL010008.1,INSD:BP639241.1,
INSD:ES210632.1,INSD:EL281666.1,INSD:EL045532.1,
INSD:EH872505.1,INSD:EH870852.1,INSD:ES124631.1,
INSD:EL065685.1,INSD:EL143908.1,INSD:DR279824.1,
INSD:EL010623.1,INSD:EL068545.1,INSD:EL246694.1,
INSD:EL131294.1,INSD:EL147760.1,INSD:EH949142.1,
INSD:EL297703.1,INSD:BP647460.1,INSD:EL208951.1,
INSD:EH819166.1,INSD:EL211850.1,INSD:EL011451.1,
INSD:EL339587.1,INSD:EL265182.1,INSD:EH982664.1,
INSD:EL054088.1,INSD:BP604049.1,INSD:EH832869.1,
INSD:EH902776.1,INSD:AV521565.1,INSD:BP840847.1,
INSD:ES158530.1,INSD:EH984942.1,INSD:EH899171.1,
INSD:EH914073.1,INSD:BP836782.1,INSD:EH887682.1,
INSD:CB254642.1,INSD:EL330688.1,INSD:ES139698.1,
INSD:EL275596.1,INSD:EL190745.1,INSD:EL303326.1,
INSD:BP663131.1,INSD:EG496518.1,INSD:ES183134.1,
INSD:ES047487.1,INSD:EL270289.1,INSD:EH839271.1,
INSD:AV543466.1,INSD:EL304439.1,INSD:BP830983.1,
INSD:EH863065.1,INSD:EL074466.1,INSD:BP793309.1,
INSD:EL169326.1,INSD:EH864557.1,INSD:EH988852.1,
INSD:BP644141.1,INSD:BP659376.1,INSD:EH883938.1,
INSD:AV561266.1,INSD:ES030496.1,INSD:EL305960.1,
INSD:EL107960.1,INSD:BP625491.1,INSD:EL181094.1,
INSD:EH822733.1,INSD:ES175970.1,INSD:EH980247.1,
INSD:EL017492.1,INSD:ES021485.1,INSD:ES200404.1,
INSD:EH888044.1,INSD:BP606045.1,INSD:EL223732.1,
INSD:EH962878.1,INSD:BP607302.1,INSD:EL031916.1,
INSD:EL169514.1,INSD:EH952133.1,INSD:EL300138.1,
INSD:AV532261.1,INSD:EL995531.1,INSD:EL254905.1,
INSD:EH847948.1,INSD:BP809439.1,INSD:EL002093.1,
INSD:EL097946.1,INSD:EL146868.1,INSD:EL240183.1,
INSD:EH814850.1,INSD:BP653413.1,INSD:EL058146.1,
INSD:ES113860.1,INSD:EL204229.1,INSD:EL172953.1,
INSD:EL281600.1,INSD:EL270237.1,INSD:EL218280.1,
INSD:EL176252.1,INSD:EL253516.1,INSD:EH847845.1,
INSD:EH909572.1,INSD:EL108070.1,INSD:EL163916.1,
INSD:BP845062.1,INSD:EH929854.1,INSD:EL104864.1,
INSD:ES043880.1,INSD:EL288086.1,INSD:AV564925.1,
INSD:ES153485.1,INSD:EH845619.1,INSD:EH846737.1,
INSD:EH841793.1,INSD:EL220581.1,INSD:AV785111.1,
INSD:EH980505.1,INSD:EL261395.1,INSD:EH978377.1,
INSD:EL085237.1,INSD:ES170071.1,INSD:EL177030.1,
INSD:EH980785.1,INSD:EL228820.1,INSD:ES214802.1,
INSD:ES157419.1,INSD:EL126390.1,INSD:EL336618.1,
INSD:EL217344.1,INSD:EL011293.1,INSD:BP859319.1,
INSD:EL009592.1,INSD:EL254849.1,INSD:BP864451.1,
INSD:EL171857.1,INSD:EH799503.1,INSD:EH848654.1,
INSD:EH944440.1,INSD:AV534590.1,INSD:R30088.1,
INSD:EL153469.1,INSD:EH965002.1,INSD:EH863174.1,
INSD:EH863725.1,INSD:EL233433.1,INSD:AV561228.1,
INSD:EL005630.1,INSD:EH851172.1,INSD:EH944506.1,
INSD:EL154606.1,INSD:EL259278.1,INSD:EH842058.1,
INSD:ES205438.1,INSD:EL015756.1,INSD:EL995523.1,
INSD:EL126022.1,INSD:EL230321.1,INSD:EL974232.1,
INSD:EL226260.1,INSD:EH880338.1,INSD:EH873717.1,
INSD:BP867272.1,INSD:ES210056.1,INSD:EH795469.1,
INSD:AV538997.1,INSD:ES199326.1,INSD:EH822250.1,
INSD:ES192218.1,INSD:EL313423.1,INSD:EL072794.1,
INSD:EH855538.1,INSD:EH975813.1,INSD:EL266517.1,
INSD:EL173981.1,INSD:BP838331.1,INSD:EL311545.1,
INSD:EL263670.1,INSD:EH843958.1,INSD:EL117882.1"
/inference="similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:AY114610.1,INSD:AK226476.1,INSD:BX818946.1,
INSD:AY092995.1,INSD:BX821301.1,INSD:AY088269.1"
/note="Clathrin light chain protein; FUNCTIONS IN:
structural molecule activity; INVOLVED IN: intracellular
protein transport, vesicle-mediated transport; LOCATED IN:
plasma membrane, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 24
plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages;
CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Clathrin light chain
(InterPro:IPR000996); BEST Arabidopsis thaliana protein
match is: Clathrin light chain protein (TAIR:AT3G51890.1);
Has 548 Blast hits to 536 proteins in 149 species: Archae
- 2; Bacteria - 80; Metazoa - 210; Fungi - 41; Plants -
105; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 108 (source: NCBI
BLink)."
/db_xref="Araport:AT2G40060"
/db_xref="TAIR:AT2G40060"
intron_pos 96:2 (1/2)
intron_pos 148:0 (2/2)
BEGIN
1 MSAFEDDSFV ILNDDASESV PVSGSFDATD SFSAFDGSLQ VEDSVDDVFA APSSDYGAYS
61 NGDGIFGSNG DHDGPILPPP SEMESDEGFA LREWRRQNAI QLEEKEKREK ELLKQIIEEA
121 DQYKEEFHKK IEVTCENNKA ANREKEKLYL ENQEKFYAES SKNYWKAIAE LVPKEVPTIE
181 KRRGKKEQQD PKKPTVSVIQ GPKPGKPTDL TRMRQILVKL KHNPPSHLKL TSQPPSEEAA
241 APPKNVPETK PTEAVTAA
//