LOCUS AEC09680.1 154 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana ribosomal protein L23AA protein.
ACCESSION CP002685-5857
PROTEIN_ID AEC09680.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Lin,X., Kaul,S., Rounsley,S., Shea,T.P., Benito,M.I., Town,C.D.,
Fujii,C.Y., Mason,T., Bowman,C.L., Barnstead,M., Feldblyum,T.V.,
Buell,C.R., Ketchum,K.A., Lee,J., Ronning,C.M., Koo,H.L.,
Moffat,K.S., Cronin,L.A., Shen,M., Pai,G., Van Aken,S., Umayam,L.,
Tallon,L.J., Gill,J.E., Adams,M.D., Carrera,A.J., Creasy,T.H.,
Goodman,H.M., Somerville,C.R., Copenhaver,G.P., Preuss,D.,
Nierman,W.C., White,O., Eisen,J.A., Salzberg,S.L., Fraser,C.M. and
Venter,J.C.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 2 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 761-768 (1999)
PUBMED 10617197
REFERENCE 2 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="2"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="RPL23AA"
/locus_tag="AT2G39460"
/gene_synonym="ARABIDOPSIS THALIANA RIBOSOMAL PROTEIN
L23A"
/gene_synonym="ATRPL23A"
/gene_synonym="F12L6.12"
/gene_synonym="F12L6_12"
/gene_synonym="RIBOSOMAL PROTEIN L23A"
/gene_synonym="RIBOSOMAL PROTEIN L23A1"
/gene_synonym="ribosomal protein L23AA"
/gene_synonym="RPL23A"
/gene_synonym="RPL23A1"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:EH943239.1,INSD:ES046503.1,INSD:EL010362.1,
INSD:ES061708.1,INSD:EL137620.1,INSD:ES002803.1,
INSD:AV820171.1,INSD:EL076109.1,INSD:ES111493.1,
INSD:EH829423.1,INSD:BP860148.1,INSD:EH902438.1,
INSD:ES074479.1,INSD:ES090077.1,INSD:BP633667.1,
INSD:EL239178.1,INSD:DR207028.1,INSD:ES048485.1,
INSD:ES004684.1,INSD:AV527001.1,INSD:EH857042.1,
INSD:EL979008.1,INSD:CK118277.1,INSD:EH961412.1,
INSD:CB264987.1,INSD:EL226893.1,INSD:ES161025.1,
INSD:EH900882.1,INSD:ES040254.1,INSD:EL978745.1,
INSD:ES030857.1,INSD:ES003028.1,INSD:BP665389.1,
INSD:ES042780.1,INSD:EL306437.1,INSD:ES191453.1,
INSD:BP840470.1,INSD:EL279266.1,INSD:ES111965.1,
INSD:ES078707.1,INSD:EL994300.1,INSD:EL090281.1,
INSD:EL267828.1,INSD:EH888129.1,INSD:EH857895.1,
INSD:BP639586.1,INSD:EL004780.1,INSD:AV787508.1,
INSD:DR232227.1,INSD:BP587172.1,INSD:EL091185.1,
INSD:BP578327.1,INSD:ES167046.1,INSD:BP575440.1,
INSD:EL154928.1,INSD:EL995146.1,INSD:BP564889.1,
INSD:BP574233.1,INSD:ES204476.1,INSD:ES180799.1,
INSD:ES062775.1,INSD:AW004249.1,INSD:BP670353.1,
INSD:BP574006.1,INSD:EL994914.1,INSD:EH855898.1,
INSD:BP582099.1,INSD:EL294558.1,INSD:ES093023.1,
INSD:EH808303.1,INSD:EH987444.1,INSD:EL298765.1,
INSD:EL978924.1,INSD:ES211238.1,INSD:ES107602.1,
INSD:BE039409.1,INSD:EL994768.1,INSD:ES070477.1,
INSD:BP587477.1,INSD:BP583074.1,INSD:EL031158.1,
INSD:EL142450.1,INSD:ES001280.1,INSD:ES074373.1,
INSD:ES213848.1,INSD:ES008260.1,INSD:BP573226.1,
INSD:EH950916.1,INSD:DR206988.1,INSD:BP647738.1,
INSD:ES109125.1,INSD:ES138559.1,INSD:ES018973.1,
INSD:EL057256.1,INSD:EH963654.1,INSD:EL029055.1,
INSD:ES074416.1,INSD:ES100545.1,INSD:EL988788.1,
INSD:ES173552.1,INSD:EL976576.1,INSD:ES096161.1,
INSD:ES043624.1,INSD:EL027068.1,INSD:BP623615.1,
INSD:CB252502.1,INSD:ES048828.1,INSD:ES143337.1,
INSD:CK118241.1,INSD:ES142393.1,INSD:ES035813.1,
INSD:BP585261.1,INSD:EL279917.1,INSD:BP664876.1,
INSD:EL222362.1,INSD:ES070159.1,INSD:ES068782.1,
INSD:ES019724.1,INSD:ES056851.1,INSD:BP668590.1,
INSD:BP567645.1,INSD:EH955250.1,INSD:ES125925.1,
INSD:BP640896.1,INSD:BP668731.1,INSD:EL073117.1,
INSD:EH893645.1,INSD:ES130143.1,INSD:EL991227.1,
INSD:ES197401.1,INSD:ES091275.1,INSD:ES026522.1,
INSD:BP596343.1,INSD:EH817195.1,INSD:EL340487.1,
INSD:BP646270.1,INSD:EH847244.1,INSD:BP571653.1,
INSD:EH865070.1,INSD:ES181656.1,INSD:EL312849.1,
INSD:ES171187.1,INSD:ES104836.1,INSD:ES017234.1,
INSD:EH930234.1,INSD:DR206983.1,INSD:AV790019.1,
INSD:EL988521.1,INSD:ES001807.1,INSD:ES010214.1,
INSD:ES128145.1,INSD:BP594527.1,INSD:EH808439.1,
INSD:EL975985.1,INSD:ES106281.1,INSD:BP563241.1,
INSD:CK118370.1,INSD:EL126797.1,INSD:EL278091.1,
INSD:EL322451.1,INSD:EL973694.1,INSD:ES071174.1,
INSD:EL279956.1,INSD:EH818760.1,INSD:EL138518.1,
INSD:ES138658.1,INSD:CB252498.1,INSD:EL236480.1,
INSD:EL115008.1,INSD:EH963907.1,INSD:ES133784.1,
INSD:BP824695.1,INSD:BP801493.1,INSD:EL321230.1,
INSD:ES124050.1,INSD:AV799788.1,INSD:ES203094.1,
INSD:DR206999.1,INSD:EL166062.1,INSD:EL983708.1,
INSD:ES195452.1,INSD:ES090960.1,INSD:EL978219.1,
INSD:ES010689.1,INSD:ES113092.1,INSD:ES010713.1,
INSD:CB265178.1,INSD:EL968549.1,INSD:ES044827.1,
INSD:BP638169.1,INSD:EL995969.1,INSD:ES132498.1,
INSD:CB265179.1,INSD:ES131674.1,INSD:CK118363.1,
INSD:ES050482.1,INSD:EH883727.1,INSD:AV811398.1,
INSD:EL991442.1,INSD:BP590716.1,INSD:ES105940.1,
INSD:ES144147.1,INSD:EH824666.1,INSD:ES106675.1,
INSD:EL998809.1,INSD:ES109402.1,INSD:ES161945.1,
INSD:BP788385.1,INSD:AV788597.1,INSD:ES198885.1,
INSD:DR373555.1,INSD:ES041131.1,INSD:ES161046.1,
INSD:BP662989.1,INSD:EL233784.1,INSD:EL048356.1,
INSD:ES187828.1,INSD:EL089747.1,INSD:ES102005.1,
INSD:EL129925.1,INSD:EH893522.1,INSD:EH959566.1,
INSD:EL272677.1,INSD:BP843147.1,INSD:ES138777.1,
INSD:EL337849.1,INSD:AI099631.1,INSD:EL163885.1,
INSD:EL315282.1,INSD:CK120796.1,INSD:ES075383.1,
INSD:DR207007.1,INSD:EL224505.1,INSD:BP567014.1,
INSD:BP564331.1,INSD:BP646308.1,INSD:EH949414.1,
INSD:EL309990.1,INSD:EL981220.1,INSD:BP869089.1,
INSD:EL195515.1,INSD:ES175546.1,INSD:EH870513.1"
/inference="similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:AF034694.1,INSD:BX841999.1"
/note="ribosomal protein L23AA (RPL23AA); FUNCTIONS IN:
structural constituent of ribosome, RNA binding,
nucleotide binding; INVOLVED IN: response to oxidative
stress, response to high light intensity, response to
cold, translation, ribosome biogenesis; LOCATED IN: in 6
components; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED
DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s:
Ribosomal protein L23/L25, conserved site
(InterPro:IPR001014), Ribosomal protein L23/L15e, core
(InterPro:IPR012678), Ribosomal protein L23/L25,
N-terminal (InterPro:IPR005633), Nucleotide-binding,
alpha-beta plait (InterPro:IPR012677), Ribosomal protein
L25/L23 (InterPro:IPR013025), Ribosomal protein L23
(InterPro:IPR019985); BEST Arabidopsis thaliana protein
match is: ribosomal protein L23AB (TAIR:AT3G55280.2); Has
2634 Blast hits to 2634 proteins in 929 species: Archae -
307; Bacteria - 1168; Metazoa - 411; Fungi - 142; Plants -
120; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 486 (source: NCBI
BLink)."
/db_xref="Araport:AT2G39460"
/db_xref="TAIR:AT2G39460"
intron_pos 6:1 (1/2)
intron_pos 127:2 (2/2)
BEGIN
1 MSPAKVDTTK KADPKAKALK AAKAVKSGQA FKKKDKKIRT KVTFHRPKTL TKPRTGKYPK
61 ISATPRNKLD HYQILKYPLT TESAMKKIED NNTLVFIVDI RADKKKIKDA VKKMYDIQTK
121 KVNTLIRPDG TKKAYVRLTP DYDALDVANK IGII
//