LOCUS AEC09211.1 150 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana Ribosomal protein S11 family protein protein.
ACCESSION CP002685-5222
PROTEIN_ID AEC09211.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Lin,X., Kaul,S., Rounsley,S., Shea,T.P., Benito,M.I., Town,C.D.,
Fujii,C.Y., Mason,T., Bowman,C.L., Barnstead,M., Feldblyum,T.V.,
Buell,C.R., Ketchum,K.A., Lee,J., Ronning,C.M., Koo,H.L.,
Moffat,K.S., Cronin,L.A., Shen,M., Pai,G., Van Aken,S., Umayam,L.,
Tallon,L.J., Gill,J.E., Adams,M.D., Carrera,A.J., Creasy,T.H.,
Goodman,H.M., Somerville,C.R., Copenhaver,G.P., Preuss,D.,
Nierman,W.C., White,O., Eisen,J.A., Salzberg,S.L., Fraser,C.M. and
Venter,J.C.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 2 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 761-768 (1999)
PUBMED 10617197
REFERENCE 2 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="2"
/ecotype="Columbia"
protein /locus_tag="AT2G36160"
/gene_synonym="F9C22.9"
/gene_synonym="F9C22_9"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:ES003795.1,INSD:DR345144.1,INSD:ES041002.1,
INSD:ES090849.1,INSD:EH926652.1,INSD:ES144905.1,
INSD:EH810847.1,INSD:EH922501.1,INSD:DR345131.1,
INSD:EH797373.1,INSD:DR345141.1,INSD:ES137421.1,
INSD:ES154269.1,INSD:ES120544.1,INSD:EL293600.1,
INSD:ES154451.1,INSD:ES111573.1,INSD:EG521019.1,
INSD:ES064002.1,INSD:EH972726.1,INSD:EL166979.1,
INSD:ES125649.1,INSD:EL995943.1,INSD:DR345133.1,
INSD:EH955427.1,INSD:ES052248.1,INSD:EH899500.1,
INSD:EL130421.1,INSD:DR345148.1,INSD:ES123481.1,
INSD:EL198410.1,INSD:DR345150.1,INSD:EL074427.1,
INSD:EH803687.1,INSD:EG462508.1,INSD:EH901238.1,
INSD:ES207223.1,INSD:EL978535.1,INSD:EL146485.1,
INSD:ES045192.1,INSD:DR345139.1,INSD:EG521016.1,
INSD:ES088689.1,INSD:EL169561.1,INSD:EL259038.1,
INSD:EH892252.1,INSD:EL082402.1,INSD:AV552523.1,
INSD:EH847648.1,INSD:ES085220.1,INSD:ES083450.1,
INSD:DR345149.1,INSD:EH942411.1,INSD:EL970752.1,
INSD:EL305779.1,INSD:ES026339.1,INSD:CK119563.1,
INSD:ES082987.1,INSD:EL085604.1,INSD:EL082440.1,
INSD:EH844790.1,INSD:EL259005.1,INSD:EL008534.1,
INSD:EL049630.1,INSD:EL071893.1,INSD:EL276452.1,
INSD:DR345135.1,INSD:ES126037.1,INSD:DR345140.1,
INSD:EL196118.1,INSD:EL301247.1,INSD:AV557484.1,
INSD:ES003006.1,INSD:EL064172.1,INSD:EL978429.1,
INSD:EL205845.1,INSD:ES035579.1,INSD:ES032870.1,
INSD:EL193718.1,INSD:EL020965.1,INSD:EL069583.1,
INSD:ES093157.1,INSD:CK120242.1,INSD:EH798371.1,
INSD:DR345134.1,INSD:CK121886.1,INSD:EL126714.1,
INSD:EL267773.1,INSD:ES097734.1,INSD:EL196667.1,
INSD:ES156394.1,INSD:EL047535.1,INSD:EL024896.1,
INSD:DR345132.1,INSD:EL126819.1,INSD:EL186197.1,
INSD:EL330602.1,INSD:EH814319.1,INSD:ES029918.1,
INSD:EL049186.1,INSD:EH887798.1,INSD:CB260837.1,
INSD:EL994710.1,INSD:ES204086.1,INSD:ES028064.1,
INSD:EL090097.1,INSD:EH927117.1,INSD:ES180410.1,
INSD:DR345147.1,INSD:ES125882.1,INSD:EL003142.1,
INSD:DR345136.1,INSD:DR345137.1,INSD:ES004349.1,
INSD:EG462509.1,INSD:EH819047.1,INSD:ES146897.1,
INSD:EL050449.1,INSD:EL180320.1,INSD:ES002349.1,
INSD:EL078442.1,INSD:ES022756.1,INSD:EL134149.1,
INSD:ES133097.1,INSD:EL055705.1,INSD:DR345138.1,
INSD:DR345143.1,INSD:EL989788.1,INSD:ES027766.1,
INSD:EL028540.1,INSD:EL058214.1,INSD:ES077709.1,
INSD:ES112558.1,INSD:EL114016.1,INSD:ES214264.1,
INSD:EH925780.1,INSD:EL971650.1,INSD:ES135792.1,
INSD:EH962100.1,INSD:DR345146.1,INSD:ES045696.1,
INSD:ES126824.1,INSD:DR376850.1,INSD:ES025109.1,
INSD:EH862824.1,INSD:EH868698.1,INSD:ES202201.1,
INSD:ES164701.1,INSD:DR345142.1,INSD:EL026528.1,
INSD:EL231784.1,INSD:EH963838.1,INSD:EL243869.1,
INSD:ES179085.1,INSD:ES104178.1,INSD:ES069492.1"
/inference="similar to RNA sequence, mRNA:INSD:AY088120.1"
/note="Ribosomal protein S11 family protein; FUNCTIONS IN:
structural constituent of ribosome; INVOLVED IN:
translation; LOCATED IN: cytosolic small ribosomal
subunit, cytosolic ribosome, plasma membrane, chloroplast,
membrane; EXPRESSED IN: 26 plant structures; EXPRESSED
DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s:
Ribosomal protein S11 (InterPro:IPR001971), Ribosomal S11,
conserved site (InterPro:IPR018102); BEST Arabidopsis
thaliana protein match is: Ribosomal protein S11 family
protein (TAIR:AT3G11510.1); Has 8774 Blast hits to 8774
proteins in 2901 species: Archae - 250; Bacteria - 4863;
Metazoa - 587; Fungi - 162; Plants - 736; Viruses - 0;
Other Eukaryotes - 2176 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="Araport:AT2G36160"
/db_xref="TAIR:AT2G36160"
intron_pos 2:0 (1/5)
intron_pos 42:0 (2/5)
intron_pos 57:1 (3/5)
intron_pos 86:0 (4/5)
intron_pos 129:1 (5/5)
BEGIN
1 MSKRKTKEPK VDVVTLGPSV REGEQVFGVV HIFASFNDTF IHVTDLSGRE TLVRITGGMK
61 VKADRDESSP YAAMLAAQDV AQRCKELGIT AMHVKLRATG GNKTKTPGPG AQSALRALAR
121 SGMKIGRIED VTPIPTDSTR RKGGRRGRRL
//