LOCUS AEC08980.1 178 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana Ribosomal protein L18ae/LX family
protein protein.
ACCESSION CP002685-4927
PROTEIN_ID AEC08980.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Lin,X., Kaul,S., Rounsley,S., Shea,T.P., Benito,M.I., Town,C.D.,
Fujii,C.Y., Mason,T., Bowman,C.L., Barnstead,M., Feldblyum,T.V.,
Buell,C.R., Ketchum,K.A., Lee,J., Ronning,C.M., Koo,H.L.,
Moffat,K.S., Cronin,L.A., Shen,M., Pai,G., Van Aken,S., Umayam,L.,
Tallon,L.J., Gill,J.E., Adams,M.D., Carrera,A.J., Creasy,T.H.,
Goodman,H.M., Somerville,C.R., Copenhaver,G.P., Preuss,D.,
Nierman,W.C., White,O., Eisen,J.A., Salzberg,S.L., Fraser,C.M. and
Venter,J.C.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 2 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 761-768 (1999)
PUBMED 10617197
REFERENCE 2 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="2"
/ecotype="Columbia"
protein /locus_tag="AT2G34480"
/gene_synonym="F13P17.34"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:DR265820.1,INSD:EL110194.1,INSD:R89930.1,
INSD:EL216167.1,INSD:ES092803.1,INSD:BP631166.1,
INSD:EL206454.1,INSD:BP633124.1,INSD:DR330212.1,
INSD:DR330125.1,INSD:DR330132.1,INSD:EL278905.1,
INSD:DR330118.1,INSD:EL111271.1,INSD:DR330032.1,
INSD:EH993723.1,INSD:EL245466.1,INSD:EL178788.1,
INSD:AV565865.1,INSD:DR330028.1,INSD:DR330135.1,
INSD:EL270752.1,INSD:Z18039.1,INSD:DR330141.1,
INSD:EH899594.1,INSD:DR330020.1,INSD:DR330220.1,
INSD:EL188433.1,INSD:EH889128.1,INSD:DR330221.1,
INSD:BP825958.1,INSD:EL039714.1,INSD:ES106312.1,
INSD:DR330208.1,INSD:T43416.1,INSD:DR330146.1,
INSD:ES186679.1,INSD:BP667682.1,INSD:EL996538.1,
INSD:EL990665.1,INSD:AV787039.1,INSD:DR330150.1,
INSD:DR330164.1,INSD:BP826629.1,INSD:AV567719.1,
INSD:CB253547.1,INSD:DR330213.1,INSD:ES011819.1,
INSD:AV818744.1,INSD:ES058165.1,INSD:EH829850.1,
INSD:DR330077.1,INSD:DR330049.1,INSD:DR330016.1,
INSD:AV809897.1,INSD:BP669415.1,INSD:BP820773.1,
INSD:BP856226.1,INSD:EL037062.1,INSD:BP850233.1,
INSD:BP587866.1,INSD:EL174510.1,INSD:AV562040.1,
INSD:ES083518.1,INSD:AA728464.1,INSD:DR330189.1,
INSD:ES043518.1,INSD:ES166884.1,INSD:EL286058.1,
INSD:EL065266.1,INSD:DR330102.1,INSD:EL257838.1,
INSD:DR330148.1,INSD:BP853873.1,INSD:BP647598.1,
INSD:ES024131.1,INSD:ES159120.1,INSD:AV823912.1,
INSD:DR330200.1,INSD:ES113913.1,INSD:BP669343.1,
INSD:DR330161.1,INSD:EH966032.1,INSD:EH969116.1,
INSD:EL299501.1,INSD:BP857529.1,INSD:DR330153.1,
INSD:ES017281.1,INSD:DR330128.1,INSD:BP669816.1,
INSD:ES013729.1,INSD:EL999802.1,INSD:BP637130.1,
INSD:BP824938.1,INSD:BP578550.1,INSD:ES116013.1,
INSD:ES167952.1,INSD:BP844272.1,INSD:ES208806.1,
INSD:BP792425.1,INSD:DR330054.1,INSD:DR330157.1,
INSD:EH813169.1,INSD:DR330040.1,INSD:BP816512.1,
INSD:DR345548.1,INSD:DR330151.1,INSD:EL130212.1,
INSD:EL996724.1,INSD:EL103666.1,INSD:DR330092.1,
INSD:BP858795.1,INSD:EL326594.1,INSD:ES063641.1,
INSD:EL339173.1,INSD:DR330179.1,INSD:DR330155.1,
INSD:EL993558.1,INSD:DR330093.1,INSD:EH849627.1,
INSD:DR330195.1,INSD:AV787205.1,INSD:BP669831.1,
INSD:ES108634.1,INSD:DR330112.1,INSD:DR330173.1,
INSD:DR330143.1,INSD:DR330218.1,INSD:EH822040.1,
INSD:DR330087.1,INSD:BP825826.1,INSD:EL218544.1,
INSD:DR330055.1,INSD:BP807482.1,INSD:DR330116.1,
INSD:DR330108.1,INSD:DR330219.1,INSD:DR330101.1,
INSD:BP842917.1,INSD:BP596174.1,INSD:BP852504.1,
INSD:AV532113.1,INSD:DR330138.1,INSD:EH880392.1,
INSD:ES177648.1,INSD:EL139790.1,INSD:ES000519.1,
INSD:DR330122.1,INSD:ES014843.1,INSD:EL119452.1,
INSD:DR330035.1,INSD:EL267494.1,INSD:DR330163.1,
INSD:EH924672.1,INSD:DR330174.1,INSD:DR330107.1,
INSD:DR330039.1,INSD:ES184872.1,INSD:BP792131.1,
INSD:ES119751.1,INSD:DR330057.1,INSD:DR330090.1,
INSD:EL317843.1,INSD:EH925862.1,INSD:EH878747.1,
INSD:T46763.1,INSD:DR330121.1,INSD:AV552021.1,
INSD:CF773040.1,INSD:EH810271.1,INSD:DR330145.1,
INSD:EL150150.1,INSD:EL012752.1,INSD:DR330197.1,
INSD:AV787612.1,INSD:BP829492.1,INSD:ES019236.1,
INSD:BP630387.1,INSD:DR330006.1,INSD:DR330139.1,
INSD:ES103435.1,INSD:DR330201.1,INSD:BP846052.1,
INSD:DR330053.1,INSD:DR330047.1,INSD:DR330130.1,
INSD:DR330034.1,INSD:DR330069.1,INSD:EH965142.1,
INSD:DR330062.1,INSD:EL071409.1,INSD:BP668952.1,
INSD:ES204437.1,INSD:DR330065.1,INSD:BP831755.1,
INSD:AA040957.1,INSD:BP669771.1,INSD:DR330152.1,
INSD:BP856507.1,INSD:DR330038.1,INSD:ES150772.1,
INSD:DR330169.1,INSD:DR330172.1,INSD:DR330078.1,
INSD:ES088437.1,INSD:EH847187.1,INSD:EL150880.1,
INSD:EH857413.1,INSD:DR330183.1,INSD:DR371954.1,
INSD:DR330205.1,INSD:ES037432.1,INSD:EL981893.1,
INSD:DR330171.1,INSD:EH880563.1,INSD:ES039630.1,
INSD:DR330111.1,INSD:EL333160.1,INSD:DR330105.1,
INSD:EH859807.1,INSD:ES121851.1,INSD:CB253518.1,
INSD:DR330147.1,INSD:AV832249.1,INSD:EH898309.1,
INSD:DR330008.1,INSD:EL135704.1,INSD:EL262837.1,
INSD:BP577383.1,INSD:ES049146.1,INSD:ES084508.1,
INSD:AV812769.1,INSD:BP831495.1,INSD:EL174532.1,
INSD:ES209396.1,INSD:EH930714.1,INSD:DR330089.1,
INSD:DR330079.1,INSD:DR330187.1,INSD:EL056948.1,
INSD:DR330207.1,INSD:DR330184.1,INSD:N37898.1,
INSD:BP793629.1,INSD:EL995357.1,INSD:DR330015.1,
INSD:EL198956.1,INSD:ES032461.1,INSD:DR330005.1,
INSD:DR330137.1,INSD:BP633010.1,INSD:DR330131.1,
INSD:DR330222.1,INSD:ES187175.1,INSD:EL210038.1,
INSD:ES180429.1,INSD:AV781528.1,INSD:DR330072.1,
INSD:ES207732.1,INSD:ES045126.1,INSD:DR330036.1,
INSD:BP854909.1,INSD:BP815474.1,INSD:EL268941.1,
INSD:DR330064.1,INSD:BP827966.1,INSD:EL162633.1,
INSD:BP664059.1,INSD:ES007599.1,INSD:DR330159.1,
INSD:EL149385.1,INSD:BP653892.1,INSD:ES100339.1,
INSD:DR330165.1,INSD:DR330075.1,INSD:EL144883.1,
INSD:BP835434.1,INSD:ES111356.1,INSD:DR330117.1,
INSD:BP648645.1,INSD:AV549659.1,INSD:DR330210.1,
INSD:BP801633.1,INSD:DR330045.1,INSD:BP828863.1,
INSD:DR330196.1,INSD:AV781911.1,INSD:BP862205.1,
INSD:DR330010.1,INSD:DR225856.1,INSD:ES040784.1,
INSD:ES214328.1,INSD:ES182716.1,INSD:EL980047.1,
INSD:DR330027.1,INSD:DR330030.1,INSD:EL076613.1,
INSD:AV819817.1,INSD:DR330182.1,INSD:ES073427.1,
INSD:DR330094.1,INSD:DR330018.1,INSD:ES000871.1,
INSD:BP820547.1,INSD:ES044201.1,INSD:EL255467.1,
INSD:BP846151.1,INSD:BP628763.1,INSD:BP833182.1,
INSD:BP671603.1,INSD:DR330052.1,INSD:EL245294.1,
INSD:EH892676.1,INSD:EL201564.1,INSD:ES187940.1,
INSD:BP832697.1,INSD:DR330043.1,INSD:DR330042.1,
INSD:DR330180.1,INSD:ES158435.1,INSD:ES154859.1,
INSD:BP802184.1,INSD:EH950645.1,INSD:BP622415.1,
INSD:DR330095.1,INSD:ES206217.1,INSD:DR330033.1,
INSD:DR330013.1,INSD:DR330140.1,INSD:BP824961.1,
INSD:ES159015.1,INSD:EL999732.1,INSD:EH961161.1,
INSD:ES194085.1,INSD:DR330073.1,INSD:CF652569.1,
INSD:BP802243.1,INSD:DR330012.1,INSD:CB252708.1,
INSD:BP849383.1,INSD:EH847614.1,INSD:EL050861.1,
INSD:CK118306.1,INSD:DR330209.1,INSD:DR330156.1,
INSD:EH896038.1,INSD:EL082968.1,INSD:BP840618.1,
INSD:ES006690.1,INSD:BP572290.1,INSD:CK118621.1,
INSD:DR330085.1,INSD:DR330004.1,INSD:EG465754.1,
INSD:ES013607.1,INSD:DR330048.1,INSD:ES073059.1,
INSD:EL211014.1,INSD:DR330086.1,INSD:DR330081.1,
INSD:EL248455.1,INSD:EL078081.1,INSD:EH922531.1,
INSD:EH872194.1,INSD:EL153564.1,INSD:BP628682.1,
INSD:DR330119.1,INSD:ES072858.1,INSD:BP636760.1,
INSD:ES094005.1,INSD:ES040720.1,INSD:BP560797.2,
INSD:EH873616.1,INSD:DR330029.1,INSD:EL991355.1,
INSD:DR330026.1,INSD:EH978230.1,INSD:BP844656.1,
INSD:EH798369.1,INSD:BP628165.1,INSD:DR330129.1,
INSD:DR330003.1,INSD:U74171.1,INSD:EL217047.1,
INSD:EL333149.1,INSD:ES156994.1,INSD:BP652907.1,
INSD:DR330088.1,INSD:BE523835.1,INSD:BP641864.1,
INSD:EL116378.1,INSD:DR330082.1,INSD:EL317014.1,
INSD:EH883247.1,INSD:DR330058.1,INSD:ES119746.1,
INSD:DR330202.1,INSD:EH820922.1,INSD:EL979427.1,
INSD:AV832156.1,INSD:DR330193.1,INSD:DR330215.1,
INSD:EL180585.1,INSD:DR330115.1,INSD:DR330127.1,
INSD:DR330181.1,INSD:BP799242.1,INSD:AV540407.1,
INSD:DR330194.1,INSD:EH940004.1,INSD:EL235435.1,
INSD:DR330192.1,INSD:DR330068.1,INSD:DR330166.1,
INSD:ES079618.1,INSD:DR330104.1,INSD:BP664234.1,
INSD:BP826710.1,INSD:DR330059.1,INSD:DR330063.1,
INSD:EH927549.1,INSD:ES071743.1,INSD:ES097639.1,
INSD:DR330160.1,INSD:DR330188.1,INSD:BP864655.1,
INSD:EL308050.1,INSD:EH844777.1,INSD:BP668621.1,
INSD:DR330046.1,INSD:ES150465.1,INSD:DR330099.1,
INSD:DR330217.1,INSD:EL041814.1,INSD:EG419579.1,
INSD:DR345549.1,INSD:BP815061.1,INSD:DR330023.1,
INSD:EH873891.1,INSD:DR330071.1,INSD:BP867024.1,
INSD:ES067958.1,INSD:BP854824.1,INSD:ES075665.1,
INSD:DR330149.1,INSD:BP631574.1,INSD:EH860495.1,
INSD:ES026484.1,INSD:CK118622.1,INSD:BP662562.1,
INSD:DR330168.1,INSD:DR225855.1,INSD:ES144470.1,
INSD:BP577543.1,INSD:DR330199.1,INSD:DR330110.1,
INSD:DR330206.1,INSD:DR330123.1,INSD:EL325531.1,
INSD:BP623968.1,INSD:DR330120.1,INSD:DR330019.1,
INSD:DR330106.1,INSD:BP671516.1,INSD:EH897975.1,
INSD:ES053972.1,INSD:AV785898.1,INSD:AV796602.1,
INSD:EH906101.1,INSD:EH939195.1,INSD:BP585665.1,
INSD:DR330096.1,INSD:BP868395.1,INSD:ES093942.1,
INSD:AV542771.1,INSD:ES125393.1,INSD:ES113568.1,
INSD:DR330191.1,INSD:DR330186.1,INSD:AV803163.1,
INSD:DR330017.1,INSD:EL016697.1,INSD:DR330061.1,
INSD:DR330162.1,INSD:DR330060.1,INSD:BP848797.1,
INSD:DR330109.1,INSD:BP819522.1,INSD:EL007958.1,
INSD:ES034644.1,INSD:EL264614.1,INSD:AV788851.1,
INSD:EL292890.1,INSD:EH838127.1,INSD:DR330175.1,
INSD:ES158975.1,INSD:EL164914.1,INSD:DR330198.1,
INSD:ES126449.1,INSD:DR330144.1,INSD:DR330014.1,
INSD:ES123292.1,INSD:ES080283.1,INSD:BP583162.1,
INSD:ES028791.1,INSD:EG465755.1,INSD:DR330113.1,
INSD:DR330124.1,INSD:EH930072.1,INSD:DR376991.1,
INSD:EL044016.1,INSD:BP570457.1,INSD:AV783113.1,
INSD:BP852171.1,INSD:ES097636.1,INSD:DR330074.1,
INSD:EL235158.1,INSD:DR330167.1,INSD:EH867446.1,
INSD:ES175220.1,INSD:DR330216.1,INSD:EL223415.1,
INSD:ES124055.1,INSD:DR330083.1,INSD:EL067947.1,
INSD:DR330067.1,INSD:DR330214.1,INSD:EL989592.1,
INSD:EL058299.1,INSD:EH829630.1,INSD:ES005749.1,
INSD:BP830458.1,INSD:AV801337.1,INSD:ES107393.1,
INSD:EL094242.1,INSD:DR330178.1,INSD:DR330066.1,
INSD:DR330176.1,INSD:EL125705.1,INSD:EH817838.1,
INSD:ES066219.1,INSD:CB252704.1,INSD:DR330114.1,
INSD:AV561207.1,INSD:DR330190.1,INSD:EH840122.1,
INSD:EL178632.1,INSD:DR330177.1,INSD:ES114516.1,
INSD:ES212396.1,INSD:DR345550.1,INSD:AA389793.1,
INSD:DR330091.1,INSD:BP567590.1,INSD:EL967460.1,
INSD:EL128816.1,INSD:ES128103.1,INSD:EL992898.1,
INSD:EL010641.1,INSD:EH866276.1,INSD:ES053276.1,
INSD:EL021262.1,INSD:BP622665.1,INSD:DR330126.1,
INSD:EL993790.1,INSD:AV784996.1,INSD:DR330031.1,
INSD:BP851468.1,INSD:DR370605.1,INSD:DR330025.1,
INSD:DR330084.1,INSD:EL039285.1,INSD:EL070889.1,
INSD:BP778211.1,INSD:BP628852.1,INSD:BP656496.1,
INSD:EL031656.1,INSD:BP653450.1,INSD:DR225461.1,
INSD:EL165277.1,INSD:DR330024.1,INSD:EH800131.1,
INSD:EL014272.1,INSD:DR330097.1,INSD:DR330185.1,
INSD:CK121385.1,INSD:BP842183.1,INSD:EL097828.1,
INSD:BP659140.1,INSD:EL224479.1,INSD:BP837265.1,
INSD:EH890361.1,INSD:ES060749.1,INSD:ES197188.1,
INSD:DR330044.1,INSD:EH894008.1,INSD:BP572247.1,
INSD:BP803056.1,INSD:DR330158.1,INSD:BP625691.1,
INSD:DR330133.1,INSD:DR330142.1,INSD:EL113648.1,
INSD:DR330041.1,INSD:EL101794.1,INSD:DR280943.1,
INSD:AV830723.1,INSD:AV787518.1,INSD:DR330136.1,
INSD:AV819400.1,INSD:ES111758.1,INSD:EH846598.1,
INSD:EH860439.1,INSD:BP660524.1,INSD:AV532182.1,
INSD:BP593113.1,INSD:EL017585.1,INSD:DR330051.1,
INSD:AV531501.1,INSD:AV787465.1,INSD:BP847404.1,
INSD:DR330100.1,INSD:ES140006.1,INSD:ES013426.1,
INSD:BP667106.1,INSD:BP817841.1,INSD:BP833289.1,
INSD:DR330103.1,INSD:DR330050.1,INSD:DR330011.1,
INSD:ES045682.1,INSD:EL083043.1,INSD:BP652707.1,
INSD:EH925235.1,INSD:EL161080.1,INSD:ES074889.1,
INSD:DR330211.1,INSD:DR330056.1,INSD:DR330170.1,
INSD:EH962974.1,INSD:BP560473.1,INSD:BP642722.1,
INSD:DR330070.1,INSD:EL175653.1,INSD:EL044937.1,
INSD:DR330037.1,INSD:BP851645.1,INSD:DR330080.1,
INSD:DR330076.1,INSD:DR330021.1,INSD:BP672169.1,
INSD:BP643495.1,INSD:DR330022.1,INSD:BP650213.1,
INSD:ES184551.1,INSD:DR330154.1,INSD:DR330134.1,
INSD:DR330007.1,INSD:ES146569.1,INSD:DR330204.1,
INSD:DR330203.1,INSD:EL149635.1"
/inference="similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:BX818972.1,INSD:AY120778.1,INSD:BT000076.1,
INSD:BT006559.1,INSD:AY042803.1,INSD:BX819594.1"
/note="Ribosomal protein L18ae/LX family protein;
FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome; INVOLVED
IN: translation, ribosome biogenesis; LOCATED IN:
cytosolic ribosome, ribosome, cytosolic large ribosomal
subunit, plasma membrane; EXPRESSED IN: 23 plant
structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS
InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein L18ae/LX
(InterPro:IPR021138), Ribosomal protein L18ae
(InterPro:IPR002670); BEST Arabidopsis thaliana protein
match is: Ribosomal protein L18ae/LX family protein
(TAIR:AT1G29965.1); Has 759 Blast hits to 757 proteins in
282 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 315;
Fungi - 159; Plants - 155; Viruses - 0; Other Eukaryotes -
130 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="Araport:AT2G34480"
/db_xref="TAIR:AT2G34480"
intron_pos 6:0 (1/3)
intron_pos 44:2 (2/3)
intron_pos 66:0 (3/3)
BEGIN
1 MGAFRFHQYQ VVGRALPTEK DVQPKIYRMK LWATNEVRAK SKFWYFLRKL KKVKKSNGQM
61 LAINEIYEKN PTTIKNFGIW LRYQSRTGYH NMYKEYRDTT LNGAVEQMYT EMASRHRVRF
121 PCIQIIKTAT VPAKLCKRES TKQFHNSKIK FPLVFRKVRP PSRKLKTTYK ANKPNLFM
//