LOCUS AEC08466.1 695 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana FtsH extracellular protease family protein.
ACCESSION CP002685-4226
PROTEIN_ID AEC08466.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Lin,X., Kaul,S., Rounsley,S., Shea,T.P., Benito,M.I., Town,C.D.,
Fujii,C.Y., Mason,T., Bowman,C.L., Barnstead,M., Feldblyum,T.V.,
Buell,C.R., Ketchum,K.A., Lee,J., Ronning,C.M., Koo,H.L.,
Moffat,K.S., Cronin,L.A., Shen,M., Pai,G., Van Aken,S., Umayam,L.,
Tallon,L.J., Gill,J.E., Adams,M.D., Carrera,A.J., Creasy,T.H.,
Goodman,H.M., Somerville,C.R., Copenhaver,G.P., Preuss,D.,
Nierman,W.C., White,O., Eisen,J.A., Salzberg,S.L., Fraser,C.M. and
Venter,J.C.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 2 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 761-768 (1999)
PUBMED 10617197
REFERENCE 2 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="2"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="VAR2"
/locus_tag="AT2G30950"
/gene_synonym="F7F1.16"
/gene_synonym="F7F1_16"
/gene_synonym="FTSH2"
/gene_synonym="VARIEGATED 2"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:EL318631.1,INSD:AV793996.1,INSD:EL296024.1,
INSD:BP822489.1,INSD:BP640966.1,INSD:EH939445.1,
INSD:BP823357.1,INSD:EH857276.1,INSD:EH836486.1,
INSD:EL016722.1,INSD:AV791612.1,INSD:EL085130.1,
INSD:AV813520.1,INSD:BP785664.1,INSD:EL282698.1,
INSD:AV525708.1,INSD:BP777644.1,INSD:EL045776.1,
INSD:EL226554.1,INSD:EL270278.1,INSD:AV525865.1,
INSD:EH861349.1,INSD:BP653412.1,INSD:EH941304.1,
INSD:EL331063.1,INSD:EL249929.1,INSD:EL123768.1,
INSD:EL319666.1,INSD:AV813186.1,INSD:CB260960.1,
INSD:EL294842.1,INSD:AV801583.1,INSD:ES000169.1,
INSD:BP658609.1,INSD:BP784893.1,INSD:EL018070.1,
INSD:EH969237.1,INSD:BP830393.1,INSD:AV816761.1,
INSD:EL133346.1,INSD:CB263538.1,INSD:CD531504.1,
INSD:EL106005.1,INSD:EH854077.1,INSD:BP846932.1,
INSD:AV817415.1,INSD:EH958479.1,INSD:EH882429.1,
INSD:ES125932.1,INSD:EL199751.1,INSD:EG454286.1,
INSD:EL082129.1,INSD:AV795410.1,INSD:BP827880.1,
INSD:BP780776.1,INSD:AV558102.1,INSD:EH878138.1,
INSD:EL192761.1,INSD:EL198977.1,INSD:BP819644.2,
INSD:ES084070.1,INSD:EH972817.1,INSD:EH817103.1,
INSD:EL173503.1,INSD:EL270944.1,INSD:EL252680.1,
INSD:EL248730.1,INSD:AV807682.1,INSD:EH983810.1,
INSD:BP605604.1,INSD:EL310778.1,INSD:EH894857.1,
INSD:EH822033.1,INSD:EH823790.1,INSD:Z34785.1,
INSD:BP824705.1,INSD:EH853895.1,INSD:EH961225.1,
INSD:AV797052.1,INSD:EL116202.1,INSD:EH882610.1,
INSD:CD533708.1,INSD:CD531389.1,INSD:EL033025.1,
INSD:CB258813.1,INSD:BP793119.1,INSD:EL095012.1,
INSD:EL218908.1,INSD:AV522175.1,INSD:CD533466.1,
INSD:AV813347.1,INSD:EL049753.1,INSD:EL002603.1,
INSD:AV797852.1,INSD:BP648116.1,INSD:AV801506.1,
INSD:AV816730.1,INSD:ES182540.1,INSD:AV793512.1,
INSD:AI996049.1,INSD:EL332822.1,INSD:EH921607.1,
INSD:BP637065.1,INSD:EL005744.1,INSD:BP647806.1,
INSD:CB258815.1,INSD:EH925546.1,INSD:EH880086.1,
INSD:ES119132.1,INSD:DR356660.1,INSD:BP781696.1,
INSD:EH804058.1,INSD:EL204747.1,INSD:BP866035.1,
INSD:EL020231.1,INSD:EL214085.1,INSD:BP818685.1,
INSD:BP782100.1,INSD:EL243118.1,INSD:AV518555.1,
INSD:EH882631.1,INSD:EH953833.1,INSD:EH798922.1,
INSD:EH951651.1,INSD:EL017748.1,INSD:EH962384.1,
INSD:EH949435.1,INSD:EH947042.1,INSD:EH908435.1,
INSD:EL178376.1,INSD:EH900415.1,INSD:EL123895.1,
INSD:BP861005.1,INSD:EH834062.1,INSD:DR382679.1,
INSD:ES150668.1,INSD:ES074374.1,INSD:EH813592.1,
INSD:EL104794.1,INSD:EH906283.1,INSD:EH824161.1,
INSD:AV811813.1,INSD:EH812862.1,INSD:BP784948.1,
INSD:AV784012.1,INSD:AV534729.1,INSD:BP585194.1,
INSD:EL059870.1,INSD:EL995063.1,INSD:ES090650.1,
INSD:BP782463.1,INSD:EL302288.1,INSD:EL216311.1,
INSD:EL127742.1,INSD:BU636435.1,INSD:EL046087.1,
INSD:BP821881.1,INSD:AV555219.1,INSD:BP644200.1,
INSD:CB257762.1,INSD:EL174304.1,INSD:EL295920.1,
INSD:EL138837.1,INSD:EL161838.1,INSD:EH988569.1,
INSD:Z34784.1,INSD:EL170815.1,INSD:DR354807.1,
INSD:CD529283.1,INSD:AV800962.1,INSD:EH936416.1,
INSD:AV526977.1,INSD:AV802479.1,INSD:BP793970.1,
INSD:EL007771.1,INSD:EH809970.1,INSD:EL288947.1,
INSD:EH907415.1,INSD:BP829507.2,INSD:EL012553.1,
INSD:BP596941.1,INSD:AV518764.1,INSD:ES096944.1,
INSD:EL114026.1,INSD:EL158850.1,INSD:CD531823.1,
INSD:EL270345.1,INSD:EH826564.1,INSD:EL229002.1,
INSD:BP783254.1,INSD:AV521899.1,INSD:AV793539.1,
INSD:BP845045.1,INSD:EL096180.1,INSD:AV825654.1,
INSD:EL192908.1,INSD:EL234394.1,INSD:EL317747.1,
INSD:BP786905.1,INSD:EL192501.1,INSD:BP841934.1,
INSD:AV799224.1,INSD:EL236435.1,INSD:BP655326.1,
INSD:EH922158.1,INSD:EL159478.1,INSD:EL005245.1,
INSD:EL058946.1,INSD:BP820538.1,INSD:EL333534.1,
INSD:BP779621.1,INSD:EL106148.1,INSD:EH851168.1,
INSD:AV791852.1,INSD:BP858714.1,INSD:AV830444.1,
INSD:BP842133.1,INSD:AV555842.1,INSD:H36719.1,
INSD:EL106334.1,INSD:BP833410.1,INSD:EL006313.1,
INSD:EH943867.1,INSD:BP790809.1,INSD:AV801558.1,
INSD:EH968724.1,INSD:AV529088.1,INSD:BP652601.1,
INSD:BP653002.1,INSD:EL238370.1,INSD:EL171334.1,
INSD:EL249899.1,INSD:BP822352.1,INSD:BP651544.1,
INSD:AV525896.1,INSD:BP778240.1,INSD:EH981556.1,
INSD:EH888462.1,INSD:EL160240.1,INSD:AV792556.1,
INSD:EL120021.1,INSD:EH904500.1,INSD:EL257515.1,
INSD:EL121629.1,INSD:BP628286.1,INSD:EL214437.1,
INSD:AV563805.1,INSD:EL046568.1,INSD:EL047401.1,
INSD:EH961559.1,INSD:EH861557.1,INSD:EL299557.1,
INSD:AV563754.1,INSD:AV794884.1,INSD:EH911203.1,
INSD:EH991542.1,INSD:EL248163.1,INSD:EL068918.1,
INSD:AV534703.1,INSD:BP669109.1,INSD:BP817400.1,
INSD:EL298939.1,INSD:EH917074.1,INSD:EL206320.1,
INSD:AV829142.1,INSD:EH796596.1,INSD:BP587832.1,
INSD:AV804582.1,INSD:BP843770.1,INSD:EL104157.1,
INSD:EH911132.1,INSD:BP791543.1,INSD:EL115213.1,
INSD:BP792498.1,INSD:EH878816.1,INSD:EG454275.1,
INSD:BP649489.1,INSD:BP785237.1,INSD:BP868971.1,
INSD:BP791656.1,INSD:EL310639.1,INSD:BP646450.1,
INSD:EH829781.1,INSD:EH885972.1,INSD:BP785171.1,
INSD:BP835005.1,INSD:BP659298.1,INSD:BP635490.1,
INSD:EL097845.1,INSD:EL144358.1,INSD:EL067899.1,
INSD:EL081296.1,INSD:AV805315.1,INSD:EL018961.1,
INSD:BP794861.1,INSD:EL256157.1,INSD:BP655992.1,
INSD:AV808440.1,INSD:EL004551.1,INSD:EL098667.1,
INSD:EH820320.1,INSD:U74127.1,INSD:EH851339.1,
INSD:AU229253.1,INSD:EL121446.1,INSD:AV794070.1,
INSD:EH955184.1,INSD:EL293862.1,INSD:AV795381.1,
INSD:EH853809.1,INSD:AV561446.1,INSD:BP631212.1,
INSD:CB261111.1,INSD:AV802086.1,INSD:EH802434.1,
INSD:EL329326.1,INSD:BP664227.1,INSD:EL278796.1,
INSD:EL091570.1,INSD:CB258794.1,INSD:EL118274.1,
INSD:EL255982.1,INSD:EL064949.1,INSD:AI999164.1,
INSD:EH866687.1,INSD:BP808696.1,INSD:EH992816.1,
INSD:EL323678.1"
/inference="similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:AK221155.1,INSD:AY045599.1,INSD:AF135189.1,
INSD:AY093791.1"
/note="VARIEGATED 2 (VAR2); FUNCTIONS IN: metallopeptidase
activity, ATP-dependent peptidase activity, ATPase
activity, zinc ion binding; INVOLVED IN: photoinhibition,
oxygen and reactive oxygen species metabolic process,
thylakoid membrane organization, PSII associated
light-harvesting complex II catabolic process, protein
catabolic process; LOCATED IN: in 6 components; EXPRESSED
IN: 26 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth
stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase M41, FtsH
(InterPro:IPR005936), ATPase, AAA+ type, core
(InterPro:IPR003593), ATPase, AAA-type, core
(InterPro:IPR003959), ATPase, AAA-type, conserved site
(InterPro:IPR003960), Peptidase M41 (InterPro:IPR000642),
Peptidase M41, FtsH extracellular (InterPro:IPR011546);
BEST Arabidopsis thaliana protein match is: FTSH protease
8 (TAIR:AT1G06430.1); Has 42824 Blast hits to 40381
proteins in 3333 species: Archae - 1597; Bacteria - 18199;
Metazoa - 4991; Fungi - 3835; Plants - 3350; Viruses - 34;
Other Eukaryotes - 10818 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="Araport:AT2G30950"
/db_xref="TAIR:AT2G30950"
intron_pos 392:0 (1/3)
intron_pos 496:2 (2/3)
intron_pos 577:0 (3/3)
BEGIN
1 MAASSACLVG NGLSVNTTTK QRLSKHFSGR QTSFSSVIRT SKVNVVKASL DGKKKQEGRR
61 DFLKILLGNA GVGLVASGKA NADEQGVSSS RMSYSRFLEY LDKDRVNKVD LYENGTIAIV
121 EAVSPELGNR VERVRVQLPG LSQELLQKLR AKNIDFAAHN AQEDQGSVLF NLIGNLAFPA
181 LLIGGLFLLS RRSGGGMGGP GGPGNPLQFG QSKAKFQMEP NTGVTFDDVA GVDEAKQDFM
241 EVVEFLKKPE RFTAVGAKIP KGVLLIGPPG TGKTLLAKAI AGEAGVPFFS ISGSEFVEMF
301 VGVGASRVRD LFKKAKENAP CIVFVDEIDA VGRQRGTGIG GGNDEREQTL NQLLTEMDGF
361 EGNTGVIVVA ATNRADILDS ALLRPGRFDR QVSVDVPDVK GRTDILKVHA GNKKFDNDVS
421 LEIIAMRTPG FSGADLANLL NEAAILAGRR ARTSISSKEI DDSIDRIVAG MEGTVMTDGK
481 SKSLVAYHEV GHAVCGTLTP GHDAVQKVTL IPRGQARGLT WFIPSDDPTL ISKQQLFARI
541 VGGLGGRAAE EIIFGDSEVT TGAVGDLQQI TGLARQMVTT FGMSDIGPWS LMDSSAQSDV
601 IMRMMARNSM SEKLAEDIDS AVKKLSDSAY EIALSHIKNN REAMDKLVEV LLEKETIGGD
661 EFRAILSEFT EIPPENRVPS STTTTPASAP TPAAV
//