LOCUS AEC08402.1 545 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana Phototropic-responsive NPH3 family
protein protein.
ACCESSION CP002685-4125
PROTEIN_ID AEC08402.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Lin,X., Kaul,S., Rounsley,S., Shea,T.P., Benito,M.I., Town,C.D.,
Fujii,C.Y., Mason,T., Bowman,C.L., Barnstead,M., Feldblyum,T.V.,
Buell,C.R., Ketchum,K.A., Lee,J., Ronning,C.M., Koo,H.L.,
Moffat,K.S., Cronin,L.A., Shen,M., Pai,G., Van Aken,S., Umayam,L.,
Tallon,L.J., Gill,J.E., Adams,M.D., Carrera,A.J., Creasy,T.H.,
Goodman,H.M., Somerville,C.R., Copenhaver,G.P., Preuss,D.,
Nierman,W.C., White,O., Eisen,J.A., Salzberg,S.L., Fraser,C.M. and
Venter,J.C.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 2 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 761-768 (1999)
PUBMED 10617197
REFERENCE 2 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="2"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="RPT2"
/locus_tag="AT2G30520"
/gene_synonym="AT2G30510"
/gene_synonym="ROOT PHOTOTROPISM 2"
/gene_synonym="T6B20.13"
/gene_synonym="T6B20_13"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:Z34212.1,INSD:EL107548.1,INSD:EL103758.1,
INSD:EL169001.1,INSD:EL165955.1,INSD:EL207445.1,
INSD:EL083106.1,INSD:EH839632.1,INSD:BP793749.1,
INSD:EH849617.1,INSD:EH912453.1,INSD:EH974188.1,
INSD:EL080143.1,INSD:EH953778.1,INSD:EL089997.1,
INSD:EH849980.1,INSD:EH851644.1,INSD:EL093750.1,
INSD:EH917624.1,INSD:EL122654.1,INSD:CB256563.1,
INSD:EL052296.1,INSD:EL128486.1,INSD:EL012626.1,
INSD:EL140411.1,INSD:EH965655.1,INSD:EH923946.1,
INSD:EH917593.1,INSD:EL175100.1,INSD:EL241576.1,
INSD:EH863952.1,INSD:EH904664.1,INSD:EH962173.1,
INSD:EL102517.1,INSD:DR360425.1,INSD:EL173045.1,
INSD:EH994585.1,INSD:EL071586.1,INSD:EH829512.1,
INSD:EL237536.1,INSD:EH945129.1,INSD:EH880817.1,
INSD:BP614263.1,INSD:EL328904.1,INSD:EH928371.1,
INSD:EH808484.1,INSD:EL210120.1,INSD:EL224097.1,
INSD:EH864798.1,INSD:EH844600.1,INSD:T76330.1,
INSD:EL040297.1,INSD:EH914744.1,INSD:EL308694.1,
INSD:EL215990.1,INSD:EL312487.1,INSD:EL205695.1,
INSD:EL016885.1,INSD:EL192065.1,INSD:EH944307.1,
INSD:EL025990.1,INSD:EH990742.1,INSD:EH988645.1,
INSD:EL177230.1,INSD:EH894647.1,INSD:EH895987.1,
INSD:EL256228.1,INSD:EL314663.1,INSD:EH940474.1,
INSD:EH964575.1,INSD:EG500888.1,INSD:EL015794.1,
INSD:BP792257.1,INSD:EL086012.1,INSD:EL281047.1,
INSD:EH798540.1,INSD:DR360426.1,INSD:EH908067.1,
INSD:EL053010.1,INSD:EL335174.1,INSD:EL265056.1,
INSD:EH881179.1,INSD:CB261349.1,INSD:AV810247.1,
INSD:EH856383.1,INSD:EL141521.1,INSD:AV519174.1,
INSD:EG500886.1,INSD:BP627787.1,INSD:EH963210.1,
INSD:EH923094.1,INSD:EL111632.1,INSD:EL265222.1,
INSD:EL327467.1,INSD:EL053138.1,INSD:AV811363.1,
INSD:EL165522.1,INSD:EH825440.1,INSD:DR360423.1,
INSD:EL251108.1,INSD:EH850984.1,INSD:EG500882.1,
INSD:EH821872.1,INSD:EH970853.1,INSD:AA651198.1,
INSD:EH811920.1,INSD:EL257129.1,INSD:EL158252.1,
INSD:EH822795.1,INSD:BP665680.1,INSD:EH928478.1,
INSD:EL297749.1,INSD:EL122713.1,INSD:AV814205.1,
INSD:DR259657.1,INSD:EL322085.1,INSD:AI999182.1,
INSD:EL309947.1,INSD:EH987610.1,INSD:EL332649.1,
INSD:EH974285.1,INSD:EL148122.1,INSD:EH844435.1,
INSD:AV799255.1,INSD:EH907266.1,INSD:EL103354.1,
INSD:EH917020.1,INSD:EH911818.1,INSD:EL245307.1,
INSD:EH890514.1,INSD:EL239820.1,INSD:EL034142.1,
INSD:EL309186.1,INSD:EL191497.1,INSD:EL258878.1,
INSD:EL216590.1,INSD:EH938442.1,INSD:EL097410.1,
INSD:EL182852.1,INSD:EH935054.1,INSD:AV802385.1,
INSD:EH962433.1,INSD:EL215073.1,INSD:AV805004.1,
INSD:EL047905.1,INSD:EL333785.1,INSD:EH875470.1,
INSD:EL209236.1,INSD:EH936583.1,INSD:EL227634.1,
INSD:EH815481.1,INSD:EL170053.1,INSD:BP630269.1,
INSD:EL247421.1,INSD:EL195846.1,INSD:EL030900.1,
INSD:EL105577.1,INSD:EH833430.1,INSD:EH803043.1,
INSD:EL292655.1,INSD:EL188323.1,INSD:BP594841.1,
INSD:EL087069.1,INSD:BP786347.1,INSD:EL074546.1,
INSD:EL154203.1,INSD:EL133658.1,INSD:EL262205.1,
INSD:EL331520.1,INSD:EL257969.1,INSD:EL268834.1,
INSD:BP602530.1,INSD:AV538329.1,INSD:EH980444.1,
INSD:AV799769.1,INSD:EL224447.1,INSD:EH942138.1,
INSD:EL013177.1,INSD:BP781623.1,INSD:EH824723.1,
INSD:EL023321.1,INSD:BP794459.1,INSD:EL026444.1,
INSD:EH805566.1,INSD:EL124729.1,INSD:EH989726.1,
INSD:AV798123.1,INSD:AV816126.1,INSD:BP597142.1,
INSD:BP589417.1,INSD:EH859903.1,INSD:AV786948.1,
INSD:EL161086.1,INSD:EL076633.1,INSD:AV518761.1,
INSD:EL252831.1,INSD:EL187310.1,INSD:EL056922.1,
INSD:EL102413.1,INSD:EL143137.1,INSD:BP622944.1,
INSD:EL320942.1,INSD:EL294378.1,INSD:EL088945.1,
INSD:EL277636.1,INSD:EH809170.1,INSD:EL278035.1,
INSD:DR382783.1,INSD:BP643898.1,INSD:EH989898.1,
INSD:EH979699.1,INSD:EL145947.1,INSD:BP620205.1,
INSD:BP590177.1,INSD:EH926864.1,INSD:EH808779.1,
INSD:EL263694.1,INSD:EL188511.1,INSD:EL188103.1,
INSD:AV526387.1,INSD:EL254503.1,INSD:EL124215.1,
INSD:EL221065.1,INSD:EL004480.1,INSD:EL031029.1,
INSD:EL187671.1,INSD:EL204348.1,INSD:EL025968.1,
INSD:EL045315.1,INSD:AV519307.1,INSD:DR358290.1,
INSD:EL265328.1,INSD:EL245004.1,INSD:EH906844.1,
INSD:EH810094.1,INSD:EH811532.1,INSD:EL045470.1,
INSD:AV814755.1,INSD:EL062189.1,INSD:EH858947.1,
INSD:EL001554.1,INSD:Z34626.1,INSD:EL332203.1,
INSD:EL263266.1,INSD:EL174576.1,INSD:EH930145.1,
INSD:EH837855.1,INSD:AI100190.1,INSD:T23001.1,
INSD:BP865240.1,INSD:BP792680.1,INSD:EL055916.1,
INSD:EH886233.1,INSD:EG500885.1,INSD:EL215704.1,
INSD:EG500883.1,INSD:EL072227.1,INSD:EL243691.1,
INSD:EL122526.1,INSD:EL304272.1,INSD:EH905348.1,
INSD:EL057965.1,INSD:EL078977.1,INSD:EL076604.1,
INSD:EL336529.1,INSD:EL167884.1,INSD:EL221292.1,
INSD:EH842365.1,INSD:EH921687.1,INSD:EH825484.1,
INSD:AV786792.1,INSD:EH907837.1,INSD:T46312.1,
INSD:EL194480.1,INSD:EH807488.1,INSD:EL224448.1,
INSD:BP651534.1,INSD:EL220859.1,INSD:EL019414.1,
INSD:EL183225.1,INSD:EH805697.1,INSD:BU635194.1,
INSD:EL326959.1,INSD:EL034807.1,INSD:EL094117.1,
INSD:EH798869.1,INSD:EH858914.1,INSD:AV815336.1,
INSD:EH849821.1,INSD:EL045502.1,INSD:EH988768.1,
INSD:BP636270.1,INSD:EL298087.1,INSD:EH859007.1,
INSD:AV520240.1,INSD:AV795265.1,INSD:EH928207.1,
INSD:EH940659.1,INSD:EH947502.1,INSD:EL238736.1,
INSD:EL076294.1,INSD:EL238144.1,INSD:EH936802.1,
INSD:EL138403.1,INSD:AV798789.1,INSD:EL180072.1,
INSD:EL141507.1,INSD:EL149518.1,INSD:EL113498.1,
INSD:CD528946.1,INSD:EL019156.1,INSD:AV809615.1,
INSD:EL258138.1,INSD:AV550584.1,INSD:EH847785.1,
INSD:AV812353.1,INSD:EG500884.1,INSD:EL061341.1,
INSD:EL111611.1,INSD:EH857145.1,INSD:EL016471.1,
INSD:EH858330.1,INSD:EH963480.1,INSD:EL225382.1,
INSD:EH971838.1,INSD:DR360424.1,INSD:AV791542.1,
INSD:EL130498.1,INSD:EL057984.1,INSD:EL233887.1,
INSD:EL294313.1,INSD:EL163276.1,INSD:EL195169.1,
INSD:EH886023.1,INSD:EL192152.1,INSD:EH807268.1,
INSD:EL005659.1,INSD:EL022028.1,INSD:EH917463.1,
INSD:EL060774.1,INSD:EL302134.1,INSD:EH863982.1,
INSD:EH848390.1"
/inference="similar to RNA sequence, mRNA:INSD:AK175297.1"
/note="ROOT PHOTOTROPISM 2 (RPT2); FUNCTIONS IN: signal
transducer activity; INVOLVED IN: phototropism; LOCATED
IN: nucleus; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED
DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: NPH3
(InterPro:IPR004249), BTB/POZ (InterPro:IPR013069),
BTB/POZ fold (InterPro:IPR011333); BEST Arabidopsis
thaliana protein match is: Phototropic-responsive NPH3
family protein (TAIR:AT5G67385.1); Has 35333 Blast hits to
34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria -
22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses -
0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="Araport:AT2G30520"
/db_xref="TAIR:AT2G30520"
intron_pos 126:0 (1/1)
BEGIN
1 MLVAKSNYIR KLIMESKDSD VTRINLSDIP GGPEIFEKAA KFCYGVNFEI TVQNVAALHC
61 AAEFLQMTDK YCDNNLAGRT QDFLSQVALS SLSGAIVVLK SCEILLPISR DLGIVRRCVD
121 VVGAKACNEA MFPCRTPPNW WTEELCILDV DFFSDVVSSM KQRGVKPSSL ASAIITYTEK
181 SLRDLVRDHS GRGVKYSDPG DNESDERSQQ RDLVQSIVSL LPSDKGLFPV NFLCSLLRCA
241 VFLDTSLTCK NELEKRISVV LEHVSVDDLL IPSFTYDGER LLDLDSVRRI ISAFVEKEKN
301 VGVFNGGDFN RGVCSVSLQR VAKTVDSYLA EIATYGDLTI SKFNAIANLV PKSARKSDDD
361 LYRAIDIFLK AHPNLDEIER EKVCSSMDPL KLSYDARLHA SQNKRLPVNI VLHALYYDQL
421 KLRSGVAEQE ERAVVVLPEA LKTRSQLQAD TTLAKENEAL RSELMKMKMY VSDMQKNKNG
481 AGASSSNSSS LVSSKKSKHT FFSSVSKKLG KLNPFKNGSK DTSHIDEDLG GVDITKPRRR
541 RFSIS
//