LOCUS AEC08281.1 644 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana thiaminC protein.
ACCESSION CP002685-3955
PROTEIN_ID AEC08281.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Lin,X., Kaul,S., Rounsley,S., Shea,T.P., Benito,M.I., Town,C.D.,
Fujii,C.Y., Mason,T., Bowman,C.L., Barnstead,M., Feldblyum,T.V.,
Buell,C.R., Ketchum,K.A., Lee,J., Ronning,C.M., Koo,H.L.,
Moffat,K.S., Cronin,L.A., Shen,M., Pai,G., Van Aken,S., Umayam,L.,
Tallon,L.J., Gill,J.E., Adams,M.D., Carrera,A.J., Creasy,T.H.,
Goodman,H.M., Somerville,C.R., Copenhaver,G.P., Preuss,D.,
Nierman,W.C., White,O., Eisen,J.A., Salzberg,S.L., Fraser,C.M. and
Venter,J.C.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 2 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 761-768 (1999)
PUBMED 10617197
REFERENCE 2 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="2"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="THIC"
/locus_tag="AT2G29630"
/gene_synonym="PY"
/gene_synonym="PYRIMIDINE REQUIRING"
/gene_synonym="T27A16.27"
/gene_synonym="T27A16_27"
/gene_synonym="thiaminC"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:EL341314.1,INSD:EL070632.1,INSD:EH966971.1,
INSD:EG521589.1,INSD:EH920119.1,INSD:BP561747.2,
INSD:EL115720.1,INSD:EH902643.1,INSD:EH954992.1,
INSD:EL056235.1,INSD:EH870360.1,INSD:BP828605.2,
INSD:EH976241.1,INSD:EH890715.1,INSD:BP830727.2,
INSD:EL233274.1,INSD:EL189280.1,INSD:BE037715.1,
INSD:EH859648.1,INSD:ES099791.1,INSD:EL096157.1,
INSD:EL326797.1,INSD:EH941979.1,INSD:EH819155.1,
INSD:EL200100.1,INSD:EH966073.1,INSD:EH927498.1,
INSD:EH862186.1,INSD:EL261546.1,INSD:BU635940.1,
INSD:BP817345.1,INSD:EH885526.1,INSD:EL056564.1,
INSD:EL163185.1,INSD:EL338729.1,INSD:EH953493.1,
INSD:EL271867.1,INSD:EL338345.1,INSD:EH980735.1,
INSD:EL250343.1,INSD:EL217499.1,INSD:EL098476.1,
INSD:EL099459.1,INSD:EL168916.1,INSD:EH965493.1,
INSD:EH852638.1,INSD:EL221132.1,INSD:EL166108.1,
INSD:EL318662.1,INSD:EL187274.1,INSD:EL333860.1,
INSD:EH844972.1,INSD:EH868039.1,INSD:T42978.1,
INSD:EH947551.1,INSD:ES052044.1,INSD:EH978429.1,
INSD:EH961066.1,INSD:CB074405.1,INSD:ES092172.1,
INSD:AV529244.1,INSD:CB263222.1,INSD:ES081665.1,
INSD:EG518283.1,INSD:EL223060.1,INSD:EL250595.1,
INSD:EL211835.1,INSD:CF774389.1,INSD:ES155779.1,
INSD:EL190212.1,INSD:EL198761.1,INSD:EL170517.1,
INSD:EL211566.1,INSD:BP830168.1,INSD:EL048945.1,
INSD:EL320557.1,INSD:EH958731.1,INSD:EL987050.1,
INSD:EL023727.1,INSD:EL047732.1,INSD:EH933501.1,
INSD:EH971068.1,INSD:EL101727.1,INSD:EH832686.1,
INSD:EL083854.1,INSD:EL203097.1,INSD:BX837499.1,
INSD:EH943991.1,INSD:EG485224.1,INSD:EH871987.1,
INSD:EL246046.1,INSD:BP847646.1,INSD:EL334253.1,
INSD:EH921155.1,INSD:EH993312.1,INSD:ES150481.1,
INSD:EH820246.1,INSD:EL079420.1,INSD:BX834439.1,
INSD:EL150180.1,INSD:CK118737.1,INSD:EL208935.1,
INSD:EH944578.1,INSD:EL081560.1,INSD:EL211898.1,
INSD:EL277170.1,INSD:EL234784.1,INSD:EL267590.1,
INSD:EL229229.1,INSD:EG518284.1,INSD:EH994654.1,
INSD:EL200886.1,INSD:EH970038.1,INSD:EH964467.1,
INSD:EH942092.1,INSD:EH887080.1,INSD:EL034871.1,
INSD:EH942796.1,INSD:ES061874.1,INSD:EH819233.1,
INSD:EL066636.1,INSD:EH968642.1,INSD:EL250434.1,
INSD:EL206943.1,INSD:EL252169.1,INSD:EH814675.1,
INSD:EL199835.1,INSD:BP827950.1,INSD:EH869069.1,
INSD:EL127410.1,INSD:ES067077.1,INSD:EL086339.1,
INSD:EL252697.1,INSD:EH919996.1,INSD:EH885361.1,
INSD:EL167590.1,INSD:EH990526.1,INSD:EL099967.1,
INSD:EH984732.1,INSD:EL261362.1,INSD:EH987927.1,
INSD:EL068256.1,INSD:EL323189.1,INSD:EH821331.1,
INSD:EH885754.1,INSD:EL000031.1,INSD:AV823937.1,
INSD:EL148726.1,INSD:AV525792.1,INSD:EL341536.1,
INSD:EL307469.1,INSD:AV523338.1,INSD:EL135258.1"
/inference="similar to RNA sequence, mRNA:INSD:AY128756.1"
/note="thiaminC (THIC); FUNCTIONS IN: iron-sulfur cluster
binding, catalytic activity, ADP-ribose
pyrophosphohydrolase activity; INVOLVED IN: response to
vitamin B1, detection of bacterium, thiamin biosynthetic
process; LOCATED IN: chloroplast stroma, chloroplast,
plastid; EXPRESSED IN: 28 plant structures; EXPRESSED
DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s:
Thiamine biosynthesis protein ThiC (InterPro:IPR002817);
Has 4416 Blast hits to 4411 proteins in 1719 species:
Archae - 238; Bacteria - 3466; Metazoa - 3; Fungi - 0;
Plants - 61; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 648 (source:
NCBI BLink)."
/db_xref="Araport:AT2G29630"
/db_xref="TAIR:AT2G29630"
intron_pos 100:2 (1/3)
intron_pos 143:1 (2/3)
intron_pos 419:0 (3/3)
BEGIN
1 MAASVHCTLM SVVCNNKNHS ARPKLPNSSL LPGFDVVVQA AATRFKKETT TTRATLTFDP
61 PTTNSERAKQ RKHTIDPSSP DFQPIPSFEE CFPKSTKEHK EVVHEESGHV LKVPFRRVHL
121 SGGEPAFDNY DTSGPQNVNA HIGLAKLRKE WIDRREKLGT PRYTQMYYAK QGIITEEMLY
181 CATREKLDPE FVRSEVARGR AIIPSNKKHL ELEPMIVGRK FLVKVNANIG NSAVASSIEE
241 EVYKVQWATM WGADTIMDLS TGRHIHETRE WILRNSAVPV GTVPIYQALE KVDGIAENLN
301 WEVFRETLIE QAEQGVDYFT IHAGVLLRYI PLTAKRLTGI VSRGGSIHAK WCLAYHKENF
361 AYEHWDDILD ICNQYDVALS IGDGLRPGSI YDANDTAQFA ELLTQGELTR RAWEKDVQVM
421 NEGPGHVPMH KIPENMQKQL EWCNEAPFYT LGPLTTDIAP GYDHITSAIG AANIGALGTA
481 LLCYVTPKEH LGLPNRDDVK AGVIAYKIAA HAADLAKQHP HAQAWDDALS KARFEFRWMD
541 QFALSLDPMT AMSFHDETLP ADGAKVAHFC SMCGPKFCSM KITEDIRKYA EENGYGSAEE
601 AIRQGMDAMS EEFNIAKKTI SGEQHGEVGG EIYLPESYVK AAQK
//