LOCUS AEC08180.1 442 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana hypothetical protein protein.
ACCESSION CP002685-3826
PROTEIN_ID AEC08180.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Lin,X., Kaul,S., Rounsley,S., Shea,T.P., Benito,M.I., Town,C.D.,
Fujii,C.Y., Mason,T., Bowman,C.L., Barnstead,M., Feldblyum,T.V.,
Buell,C.R., Ketchum,K.A., Lee,J., Ronning,C.M., Koo,H.L.,
Moffat,K.S., Cronin,L.A., Shen,M., Pai,G., Van Aken,S., Umayam,L.,
Tallon,L.J., Gill,J.E., Adams,M.D., Carrera,A.J., Creasy,T.H.,
Goodman,H.M., Somerville,C.R., Copenhaver,G.P., Preuss,D.,
Nierman,W.C., White,O., Eisen,J.A., Salzberg,S.L., Fraser,C.M. and
Venter,J.C.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 2 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 761-768 (1999)
PUBMED 10617197
REFERENCE 2 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="2"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="XBAT31"
/locus_tag="AT2G28840"
/gene_synonym="F8N16.13"
/gene_synonym="F8N16_13"
/gene_synonym="XB3 ortholog 1 in Arabidopsis thaliana"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:EH986576.1,INSD:AV808963.1,INSD:BP657597.1,
INSD:EH808049.1,INSD:BP621031.1,INSD:EH836835.1,
INSD:EL083446.1,INSD:EG527985.1,INSD:EL132149.1,
INSD:EL100493.1,INSD:EL282840.1,INSD:T22344.1,
INSD:EH861685.1,INSD:EL216333.1,INSD:ES164329.1,
INSD:AV794265.1,INSD:EG500535.1,INSD:DR374521.1,
INSD:AI995745.1,INSD:EH910346.1,INSD:EL276259.1,
INSD:EH796700.1,INSD:EH840150.1,INSD:ES102876.1,
INSD:EL108209.1,INSD:EL026282.1,INSD:EH897023.1,
INSD:EH883301.1,INSD:AV798241.1,INSD:AV818617.1,
INSD:BP784276.1,INSD:AV800561.1,INSD:EL269903.1,
INSD:EL057068.1,INSD:EL332159.1,INSD:ES088986.1,
INSD:EH859416.1,INSD:EL172377.1,INSD:EH795494.1,
INSD:ES206044.1,INSD:EL206917.1,INSD:EL261297.1,
INSD:AV792745.1,INSD:EH946863.1,INSD:BP626349.1,
INSD:BP666805.1,INSD:EL174218.1,INSD:BP651396.1,
INSD:EG527984.1,INSD:BP636365.1,INSD:EH802685.1,
INSD:CK120282.1,INSD:EL275379.1,INSD:BP655623.1,
INSD:AV558508.1,INSD:EL232636.1,INSD:EL078357.1,
INSD:AV553034.1,INSD:EH882914.1,INSD:BP583055.1,
INSD:BE528305.1,INSD:EH983736.1,INSD:ES080037.1,
INSD:AV442814.1,INSD:BP648540.1,INSD:EL228542.1,
INSD:EL038927.1,INSD:EG500534.1,INSD:EL000213.1,
INSD:EL112690.1,INSD:BP584962.1,INSD:AV793384.1,
INSD:EH989835.1,INSD:EH799975.1,INSD:EH809574.1,
INSD:BP656354.1,INSD:EH950934.1,INSD:EH898236.1,
INSD:AV799615.1,INSD:EL231962.1,INSD:EH966040.1,
INSD:BP598638.1,INSD:BP642374.1,INSD:EH800634.1,
INSD:BP567165.1,INSD:EL267271.1,INSD:EL203345.1,
INSD:EH852062.1,INSD:EL227928.1,INSD:BP625442.1,
INSD:EL213321.1,INSD:BP787051.1,INSD:BP595900.1,
INSD:ES014797.1,INSD:BP792497.1,INSD:AV548389.1,
INSD:EL199107.1,INSD:EL170290.1,INSD:AV547376.1,
INSD:AV797646.1,INSD:EH807486.1,INSD:AV807162.1,
INSD:BP598767.1,INSD:EL004528.1,INSD:EL009994.1,
INSD:BP604859.1,INSD:BP783422.1,INSD:BP858259.1,
INSD:BP789202.1,INSD:BP569871.1,INSD:EH976611.1,
INSD:BE526140.1,INSD:EL328784.1,INSD:EL000928.1,
INSD:EL222535.1,INSD:AV790630.1,INSD:BP565763.1,
INSD:EL132250.1,INSD:EL138767.1,INSD:EL028484.1,
INSD:BP598192.1,INSD:EL038082.1,INSD:N96550.1,
INSD:ES162182.1,INSD:ES194198.1,INSD:AV799037.1,
INSD:EL250709.1,INSD:AA720147.1,INSD:BP662155.1,
INSD:EH873227.1,INSD:DR327548.1,INSD:EH884502.1,
INSD:BP604265.1,INSD:EL088701.1,INSD:EH983141.1,
INSD:ES118962.1,INSD:EL020781.1,INSD:AV786505.1,
INSD:EL203116.1,INSD:EL004587.1,INSD:ES180012.1,
INSD:EH951026.1,INSD:ES175091.1,INSD:AV540160.1,
INSD:EL151029.1,INSD:EL281737.1,INSD:EH831610.1,
INSD:EH934110.1,INSD:EL228204.1,INSD:EH817425.1,
INSD:BP594791.1,INSD:AV441080.1,INSD:EL269107.1,
INSD:BP650265.1,INSD:EH799933.1,INSD:BP590535.1,
INSD:EH832785.1,INSD:EH961312.1,INSD:EH869530.1,
INSD:BP613527.1,INSD:EL315273.1,INSD:ES208740.1,
INSD:BP866483.1,INSD:BP620358.1,INSD:EL987957.1,
INSD:BP856870.1,INSD:BP603192.1,INSD:EL998873.1,
INSD:ES216078.1,INSD:BP576733.1,INSD:BP790639.1,
INSD:EH866316.1,INSD:BP637531.1,INSD:EH939431.1,
INSD:EH814912.1,INSD:BP825115.1,INSD:BP664011.1,
INSD:EL005996.1,INSD:EL271989.1,INSD:EL144967.1,
INSD:BP607277.1,INSD:EL070377.1,INSD:BP643444.1,
INSD:BP584607.1,INSD:T46421.1,INSD:BP606273.1,
INSD:EL092343.1,INSD:EH813044.1,INSD:EL274520.1,
INSD:EH820257.1,INSD:EH899677.1,INSD:BP638680.1,
INSD:AI100142.1,INSD:ES025876.1,INSD:AV800780.1,
INSD:EL240613.1,INSD:EH955503.1,INSD:BP621725.1,
INSD:EL249497.1,INSD:EL152814.1,INSD:EL329850.1,
INSD:AV542295.1,INSD:EL075280.1,INSD:EG515269.1,
INSD:EL183612.1,INSD:EG470926.1,INSD:EL198800.1,
INSD:BP604958.1,INSD:BP598574.1,INSD:BP574431.1,
INSD:EL142123.1,INSD:Z33828.1,INSD:AV788732.1,
INSD:BP619942.1,INSD:EL178229.1,INSD:EL034164.1,
INSD:EL175298.1,INSD:AV797258.1,INSD:BP656839.1,
INSD:BP792148.1,INSD:EH970010.1,INSD:AV782408.1,
INSD:BP620072.1,INSD:EG527991.1,INSD:BP565182.1,
INSD:BP653583.1,INSD:BP583214.1,INSD:EH958245.1,
INSD:EH851688.1,INSD:EL967457.1,INSD:BP618443.1,
INSD:BP778917.1,INSD:BP604989.1"
/inference="similar to RNA sequence, mRNA:INSD:AK222223.1"
/note="XB3 ortholog 1 in Arabidopsis thaliana (XBAT31);
FUNCTIONS IN: zinc ion binding; LOCATED IN: endomembrane
system; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED
DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Zinc
finger, RING-type (InterPro:IPR001841), Ankyrin
repeat-containing domain (InterPro:IPR020683), Ankyrin
repeat (InterPro:IPR002110); BEST Arabidopsis thaliana
protein match is: XB3 ortholog 3 in Arabidopsis thaliana
(TAIR:AT5G07270.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins
in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa -
17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other
Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="Araport:AT2G28840"
/db_xref="TAIR:AT2G28840"
intron_pos 67:0 (1/6)
intron_pos 91:0 (2/6)
intron_pos 131:2 (3/6)
intron_pos 178:2 (4/6)
intron_pos 214:2 (5/6)
intron_pos 299:0 (6/6)
BEGIN
1 MIVTLFFMSL LLMVRSRLVS VIFSEISPES RRNLVFLFLM YLLFLQILSL LLERFTNPDL
61 LNRHKQTPLM LAAMYGRISC VKKLAEVGAN ILMFDSVNRR TCLHYAAYYG HANCVQAILS
121 AAQSSPVAVH WGYARFVNIR DDKGATPLHL AARQRRPECV NVLLDSGSLV CASTSVYGSP
181 GSTPLHLAAR SGSIDCVRKL LAWGADRLQR DASGRIPYVV AMKHKHGACG ALLNPSSAEP
241 LVWPSPLKFI SELNDEAKLL LEQALMEANR EREKTILKGT AYSLPSPSFS DTDDNMSEVS
301 DTELCCICFE QVCTIEVKDC GHQMCAQCTL ALCCHNKPNP TTSTVTPPVC PFCRSTIACL
361 VVAQNNNNNN EKSKSLDDVV VVDREAGDVS SSKFRKHRRS INLGEESSSF MGLSTIGSFG
421 RITGRGSGRI AAENELMDKP IL
//