LOCUS AEC08179.1 456 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana hypothetical protein protein.
ACCESSION CP002685-3825
PROTEIN_ID AEC08179.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Lin,X., Kaul,S., Rounsley,S., Shea,T.P., Benito,M.I., Town,C.D.,
Fujii,C.Y., Mason,T., Bowman,C.L., Barnstead,M., Feldblyum,T.V.,
Buell,C.R., Ketchum,K.A., Lee,J., Ronning,C.M., Koo,H.L.,
Moffat,K.S., Cronin,L.A., Shen,M., Pai,G., Van Aken,S., Umayam,L.,
Tallon,L.J., Gill,J.E., Adams,M.D., Carrera,A.J., Creasy,T.H.,
Goodman,H.M., Somerville,C.R., Copenhaver,G.P., Preuss,D.,
Nierman,W.C., White,O., Eisen,J.A., Salzberg,S.L., Fraser,C.M. and
Venter,J.C.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 2 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 761-768 (1999)
PUBMED 10617197
REFERENCE 2 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="2"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="XBAT31"
/locus_tag="AT2G28840"
/gene_synonym="F8N16.13"
/gene_synonym="F8N16_13"
/gene_synonym="XB3 ortholog 1 in Arabidopsis thaliana"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:EH986576.1,INSD:AV808963.1,INSD:BP657597.1,
INSD:BP621031.1,INSD:EH808049.1,INSD:EH836835.1,
INSD:BP838062.1,INSD:EL083446.1,INSD:EG527985.1,
INSD:EL132149.1,INSD:EL100493.1,INSD:BP561780.2,
INSD:EL282840.1,INSD:BP829495.1,INSD:T22344.1,
INSD:EH861685.1,INSD:EL216333.1,INSD:EL189163.1,
INSD:ES164329.1,INSD:AV794265.1,INSD:EG500535.1,
INSD:AI995745.1,INSD:EH910346.1,INSD:EL276259.1,
INSD:DR327549.1,INSD:EH796700.1,INSD:EH840150.1,
INSD:ES102876.1,INSD:EL108209.1,INSD:EL026282.1,
INSD:EL129149.1,INSD:BP845735.1,INSD:EH897023.1,
INSD:DR327547.1,INSD:BP864144.1,INSD:EH883301.1,
INSD:AV798241.1,INSD:AV818617.1,INSD:EL313062.1,
INSD:BP784276.1,INSD:AV800561.1,INSD:EL269903.1,
INSD:EL017952.1,INSD:EL333972.1,INSD:EL057068.1,
INSD:EL332159.1,INSD:EH874368.1,INSD:ES088986.1,
INSD:CF651951.1,INSD:EH859416.1,INSD:DR363106.1,
INSD:EL172377.1,INSD:EH795494.1,INSD:ES206044.1,
INSD:EL206917.1,INSD:EL261297.1,INSD:AV792745.1,
INSD:EL120462.1,INSD:EH946863.1,INSD:DR327550.1,
INSD:BP626349.1,INSD:BP666805.1,INSD:BP844128.1,
INSD:BP796927.1,INSD:BP855162.1,INSD:BP847926.1,
INSD:EL174218.1,INSD:BP651396.1,INSD:EG527984.1,
INSD:EH858432.1,INSD:BP636365.1,INSD:CK120282.1,
INSD:EH802685.1,INSD:EL338968.1,INSD:EL275379.1,
INSD:BP799844.1,INSD:BP655623.1,INSD:AV558508.1,
INSD:DR327542.1,INSD:EL232636.1,INSD:BX836983.1,
INSD:ES163483.1,INSD:EH797252.1,INSD:EL078357.1,
INSD:AV553034.1,INSD:BP583055.1,INSD:EH882914.1,
INSD:EL340301.1,INSD:BE528305.1,INSD:EH983736.1,
INSD:ES080037.1,INSD:BP835985.1,INSD:AV442814.1,
INSD:BP648540.1,INSD:BP561828.1,INSD:EL228542.1,
INSD:EH895928.1,INSD:EL038927.1,INSD:EL148197.1,
INSD:EG500534.1,INSD:EL000213.1,INSD:BP584962.1,
INSD:EL112690.1,INSD:AV793384.1,INSD:EH989835.1,
INSD:EH799975.1,INSD:BP848762.1,INSD:EH809574.1,
INSD:BP656354.1,INSD:EH933326.1,INSD:EH950934.1,
INSD:EH898236.1,INSD:AV799615.1,INSD:EL021581.1,
INSD:EL231962.1,INSD:EH966040.1,INSD:EG458136.1,
INSD:BP598638.1,INSD:BP642374.1,INSD:BP567165.1,
INSD:EH800634.1,INSD:EL267271.1,INSD:EL203345.1,
INSD:EH852062.1,INSD:EL227928.1,INSD:BP809799.1,
INSD:BP625442.1,INSD:EL213321.1,INSD:BP787051.1,
INSD:BP595900.1,INSD:ES014797.1,INSD:EL159507.1,
INSD:BP792497.1,INSD:AV548389.1,INSD:BP562269.1,
INSD:EL170290.1,INSD:EL199107.1,INSD:EL159012.1,
INSD:AV547376.1,INSD:AV797646.1,INSD:BP598767.1,
INSD:EH807486.1,INSD:AV807162.1,INSD:DR327546.1,
INSD:CF651950.1,INSD:EL004528.1,INSD:EL156297.1,
INSD:BP604859.1,INSD:BP783422.1,INSD:BP858259.1,
INSD:BP789202.1,INSD:BP569871.1,INSD:EH976611.1,
INSD:BE526140.1,INSD:EL328784.1,INSD:EL000928.1,
INSD:EH925681.1,INSD:EL222535.1,INSD:AV790630.1,
INSD:DR327541.1,INSD:BP565763.1,INSD:EL132250.1,
INSD:EL138767.1,INSD:EL028484.1,INSD:BP598192.1,
INSD:EL038082.1,INSD:N96550.1,INSD:ES162182.1,
INSD:ES194198.1,INSD:AV799037.1,INSD:EL250709.1,
INSD:AA720147.1,INSD:BP662155.1,INSD:EH873227.1,
INSD:DR327548.1,INSD:BP604265.1,INSD:EH884502.1,
INSD:EL088701.1,INSD:EH983141.1,INSD:ES118962.1,
INSD:EL020781.1,INSD:AV786505.1,INSD:EL004587.1,
INSD:EL203116.1,INSD:ES180012.1,INSD:EH951026.1,
INSD:ES175091.1,INSD:AV540160.1,INSD:EL056015.1,
INSD:EL151029.1,INSD:EL281737.1,INSD:EH831610.1,
INSD:EH934110.1,INSD:EL228204.1,INSD:EH817425.1,
INSD:BP594791.1,INSD:AV441080.1,INSD:BP863476.1,
INSD:EL269107.1,INSD:BP650265.1,INSD:BP590535.1,
INSD:EH799933.1,INSD:BU636274.1,INSD:BP866075.1,
INSD:EH961312.1,INSD:EH832785.1,INSD:EH869530.1,
INSD:BP613527.1,INSD:EL315273.1,INSD:ES208740.1,
INSD:BP620358.1,INSD:DR327545.1,INSD:EL987957.1,
INSD:BP856870.1,INSD:BP603192.1,INSD:EL998873.1,
INSD:ES216078.1,INSD:DR327544.1,INSD:BP576733.1,
INSD:BP790639.1,INSD:EH866316.1,INSD:BP637531.1,
INSD:EH814912.1,INSD:BP664011.1,INSD:EL005996.1,
INSD:EL271989.1,INSD:DR327543.1,INSD:EL144967.1,
INSD:BP607277.1,INSD:EL070377.1,INSD:BP643444.1,
INSD:BP584607.1,INSD:BP606273.1,INSD:T46421.1,
INSD:EL092343.1,INSD:EH813044.1,INSD:EL274520.1,
INSD:EH899677.1,INSD:EH820257.1,INSD:BP638680.1,
INSD:ES162823.1,INSD:BP864415.1,INSD:EL175393.1,
INSD:ES025876.1,INSD:AV800780.1,INSD:EG523964.1,
INSD:EL012342.1,INSD:EL240613.1,INSD:EH955503.1,
INSD:BP814089.1,INSD:BP621725.1,INSD:T22042.1,
INSD:EL249497.1,INSD:EL152814.1,INSD:EL329850.1,
INSD:AV542295.1,INSD:EL075280.1,INSD:EL112272.1,
INSD:EG515269.1,INSD:EL183612.1,INSD:EL198800.1,
INSD:BP604958.1,INSD:BX837267.1,INSD:BP574431.1,
INSD:BP598574.1,INSD:EL142123.1,INSD:BP854592.1,
INSD:Z33828.1,INSD:AV788732.1,INSD:BP619942.1,
INSD:EL178229.1,INSD:EL034164.1,INSD:EL175298.1,
INSD:AV797258.1,INSD:BP656839.1,INSD:BP792148.1,
INSD:EH970010.1,INSD:AV782408.1,INSD:BP620072.1,
INSD:EG527991.1,INSD:BP565182.1,INSD:BP653583.1,
INSD:BP583214.1,INSD:EH958245.1,INSD:EH851688.1,
INSD:EL967457.1,INSD:BP618443.1,INSD:BP778917.1,
INSD:BP604989.1,INSD:AV826281.1"
/inference="similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:AY042842.1,INSD:AK222223.1,INSD:AF370581.1,
INSD:AF428301.1,INSD:DQ086863.1,INSD:AY081458.1,
INSD:BT000727.1,INSD:BX819933.1"
/note="XB3 ortholog 1 in Arabidopsis thaliana (XBAT31);
FUNCTIONS IN: zinc ion binding; EXPRESSED IN: 24 plant
structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS
InterPro DOMAIN/s: Zinc finger, RING-type
(InterPro:IPR001841), Ankyrin repeat-containing domain
(InterPro:IPR020683), Ankyrin repeat (InterPro:IPR002110);
BEST Arabidopsis thaliana protein match is: XB3 ortholog 3
in Arabidopsis thaliana (TAIR:AT5G07270.1); Has 52906
Blast hits to 22710 proteins in 954 species: Archae - 64;
Bacteria - 3597; Metazoa - 29466; Fungi - 4564; Plants -
3287; Viruses - 345; Other Eukaryotes - 11583 (source:
NCBI BLink)."
/db_xref="Araport:AT2G28840"
/db_xref="TAIR:AT2G28840"
intron_pos 61:0 (1/7)
intron_pos 81:0 (2/7)
intron_pos 105:0 (3/7)
intron_pos 145:2 (4/7)
intron_pos 192:2 (5/7)
intron_pos 228:2 (6/7)
intron_pos 313:0 (7/7)
BEGIN
1 MGQSMSCGSR PEHGIFASVQ CGDIITIRRV MATEPSLLNQ TTPYDRHSVL HVAAANGQIE
61 ILSLLLERFT NPDLLNRHKQ TPLMLAAMYG RISCVKKLAE VGANILMFDS VNRRTCLHYA
121 AYYGHANCVQ AILSAAQSSP VAVHWGYARF VNIRDDKGAT PLHLAARQRR PECVNVLLDS
181 GSLVCASTSV YGSPGSTPLH LAARSGSIDC VRKLLAWGAD RLQRDASGRI PYVVAMKHKH
241 GACGALLNPS SAEPLVWPSP LKFISELNDE AKLLLEQALM EANREREKTI LKGTAYSLPS
301 PSFSDTDDNM SEVSDTELCC ICFEQVCTIE VKDCGHQMCA QCTLALCCHN KPNPTTSTVT
361 PPVCPFCRST IACLVVAQNN NNNNEKSKSL DDVVVVDREA GDVSSSKFRK HRRSINLGEE
421 SSSFMGLSTI GSFGRITGRG SGRIAAENEL MDKPIL
//