LOCUS AEC07845.1 125 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana cytochrome b6f complex subunit (petM) protein.
ACCESSION CP002685-3385
PROTEIN_ID AEC07845.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Lin,X., Kaul,S., Rounsley,S., Shea,T.P., Benito,M.I., Town,C.D.,
Fujii,C.Y., Mason,T., Bowman,C.L., Barnstead,M., Feldblyum,T.V.,
Buell,C.R., Ketchum,K.A., Lee,J., Ronning,C.M., Koo,H.L.,
Moffat,K.S., Cronin,L.A., Shen,M., Pai,G., Van Aken,S., Umayam,L.,
Tallon,L.J., Gill,J.E., Adams,M.D., Carrera,A.J., Creasy,T.H.,
Goodman,H.M., Somerville,C.R., Copenhaver,G.P., Preuss,D.,
Nierman,W.C., White,O., Eisen,J.A., Salzberg,S.L., Fraser,C.M. and
Venter,J.C.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 2 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 761-768 (1999)
PUBMED 10617197
REFERENCE 2 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="2"
/ecotype="Columbia"
protein /locus_tag="AT2G26500"
/gene_synonym="T9J22.17"
/gene_synonym="T9J22_17"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:EH833842.1,INSD:EL043631.1,INSD:EL087489.1,
INSD:EH988240.1,INSD:EL230281.1,INSD:AV530286.1,
INSD:BP586399.1,INSD:EH990296.1,INSD:EH880171.1,
INSD:EL154584.1,INSD:EH944341.1,INSD:EH858232.1,
INSD:EL143512.1,INSD:EH887166.1,INSD:EL167758.1,
INSD:EH926433.1,INSD:EG501203.1,INSD:BP653272.1,
INSD:EL338792.1,INSD:EH821021.1,INSD:EL169840.1,
INSD:EH959524.1,INSD:BP671044.1,INSD:EH839795.1,
INSD:EG459304.1,INSD:EL035952.1,INSD:EL230178.1,
INSD:EL021036.1,INSD:BP629242.1,INSD:EH806653.1,
INSD:EH899097.1,INSD:EL097122.1,INSD:EL115460.1,
INSD:BP627593.1,INSD:AA721886.1,INSD:EH983471.1,
INSD:EL174096.1,INSD:BP632698.1,INSD:ES016889.1,
INSD:EH858417.1,INSD:EL318088.1,INSD:EL159133.1,
INSD:BP625852.1,INSD:DR273382.1,INSD:EL215079.1,
INSD:EL228467.1,INSD:EH882318.1,INSD:EL216801.1,
INSD:EL094417.1,INSD:EL208870.1,INSD:EL194394.1,
INSD:BP587682.1,INSD:BP665185.1,INSD:EL309337.1,
INSD:EL193869.1,INSD:EL143467.1,INSD:EL325102.1,
INSD:EL168911.1,INSD:EH986341.1,INSD:EH810682.1,
INSD:EH871796.1,INSD:EL219260.1,INSD:EL092364.1,
INSD:EL144072.1,INSD:EH818114.1,INSD:EH889440.1,
INSD:EL253998.1,INSD:EH902457.1,INSD:EL052573.1,
INSD:EL213456.1,INSD:BP585698.1,INSD:BP628098.1,
INSD:EG524928.1,INSD:EL142502.1,INSD:EH928390.1,
INSD:EL045977.1,INSD:EL229650.1,INSD:EL030736.1,
INSD:EH956998.1,INSD:EH831065.1,INSD:EL021635.1,
INSD:EL043471.1,INSD:BP625913.1,INSD:BP588930.1,
INSD:BP628548.1,INSD:ES056618.1,INSD:BP589189.1,
INSD:EH933608.1,INSD:BP613708.1,INSD:EL147632.1,
INSD:ES084875.1,INSD:ES126920.1,INSD:EL333836.1,
INSD:EH981214.1,INSD:EH941347.1,INSD:EH888049.1,
INSD:EL182655.1,INSD:EH837306.1,INSD:EH869921.1,
INSD:EL018966.1,INSD:EH842154.1,INSD:BP588619.1,
INSD:ES120997.1,INSD:BP626995.1,INSD:EH943802.1,
INSD:EH845683.1,INSD:EL244377.1,INSD:BP667268.1,
INSD:BP630529.1,INSD:EL071900.1,INSD:DR214510.1,
INSD:EL024370.1,INSD:BP587311.1,INSD:EL275026.1,
INSD:EH912311.1,INSD:EH864423.1,INSD:EL243415.1,
INSD:EL019931.1,INSD:EH898687.1,INSD:BP662477.1,
INSD:EL067980.1,INSD:EL241810.1,INSD:EL156518.1,
INSD:EH891126.1,INSD:EL208762.1,INSD:ES142387.1,
INSD:EL067514.1,INSD:ES027886.1,INSD:EL281278.1,
INSD:EL056494.1,INSD:EG501202.1,INSD:EL081477.1,
INSD:EL162334.1,INSD:EH813528.1,INSD:EG442824.1,
INSD:ES005550.1,INSD:EG442825.1,INSD:EL104108.1,
INSD:EL146277.1,INSD:EL219638.1,INSD:EL159441.1,
INSD:AA712514.1,INSD:EH839907.1,INSD:EH799939.1,
INSD:EL315106.1,INSD:EH992776.1,INSD:EH831235.1,
INSD:EH809141.1,INSD:EL298999.1,INSD:BP636547.1,
INSD:EH871513.1,INSD:EL067425.1,INSD:EL253236.1,
INSD:EL015417.1,INSD:ES101051.1,INSD:EL159685.1,
INSD:EL086135.1,INSD:EL000787.1,INSD:BP628153.1,
INSD:EL262819.1,INSD:EH907463.1,INSD:EL164557.1,
INSD:ES166207.1,INSD:EL159273.1,INSD:BU635989.1,
INSD:EL006215.1,INSD:EL301802.1,INSD:EH862510.1,
INSD:EH980597.1,INSD:EL001756.1,INSD:EH936207.1,
INSD:EH834888.1,INSD:EL999505.1,INSD:EH815177.1,
INSD:EL025601.1,INSD:EH944777.1,INSD:EH953845.1,
INSD:EL223359.1,INSD:EL083957.1,INSD:EH837760.1,
INSD:EL200528.1,INSD:BP589024.1,INSD:EL269464.1,
INSD:EH908470.1,INSD:BP660584.1,INSD:EL290144.1,
INSD:EL012261.1,INSD:EH940150.1,INSD:EL058215.1,
INSD:EH905421.1,INSD:EL045346.1,INSD:EH958301.1,
INSD:EL180760.1,INSD:BP662095.1,INSD:EL217401.1,
INSD:EH986896.1,INSD:BE038810.1,INSD:EL190163.1,
INSD:BP629931.1,INSD:EL028107.1,INSD:EL339626.1,
INSD:EL050401.1,INSD:AV820553.1,INSD:AV534030.1,
INSD:EL205742.1,INSD:EH973565.1,INSD:ES055267.1,
INSD:EL013199.1,INSD:EL001049.1,INSD:EL143014.1,
INSD:BP633421.1,INSD:EL268999.1,INSD:EL101350.1,
INSD:EG504420.1,INSD:EL262720.1,INSD:EL123474.1,
INSD:EH819180.1,INSD:EH797567.1,INSD:BP634447.1,
INSD:EL140661.1,INSD:EL003314.1,INSD:BP667943.1,
INSD:BP666988.1,INSD:EL332278.1,INSD:EL176034.1,
INSD:EH875772.1,INSD:BP661053.1,INSD:EH864517.1,
INSD:BP672100.1,INSD:ES101152.1,INSD:EL308475.1,
INSD:ES008554.1,INSD:EL131109.1,INSD:EL296305.1,
INSD:EH913456.1,INSD:CB264160.1,INSD:ES071277.1,
INSD:EG504431.1,INSD:BP630274.1,INSD:ES169401.1,
INSD:EH844425.1,INSD:AV788246.1,INSD:EL096335.1,
INSD:EL013600.1,INSD:AV534182.1,INSD:EL194838.1,
INSD:ES137579.1,INSD:EH981766.1,INSD:EH865317.1,
INSD:ES073397.1,INSD:EL183911.1,INSD:ES118589.1,
INSD:EL278132.1,INSD:EL131122.1,INSD:EL033998.1,
INSD:EH927013.1,INSD:BP667815.1,INSD:EH951759.1,
INSD:EH820171.1,INSD:EL229828.1,INSD:BP622407.1,
INSD:EH974642.1,INSD:EL131310.1,INSD:EH966835.1,
INSD:EH930044.1,INSD:EH930315.1,INSD:EL244290.1,
INSD:EL018685.1,INSD:ES097488.1,INSD:EL066186.1,
INSD:EL991966.1,INSD:EH811596.1,INSD:EH964779.1,
INSD:EL289108.1,INSD:EH903790.1,INSD:EL268445.1,
INSD:EL299055.1,INSD:DR372291.1,INSD:EL040337.1,
INSD:DR273348.1,INSD:EL316438.1,INSD:BP656782.1,
INSD:EH838673.1,INSD:DR273407.1,INSD:BP671495.1,
INSD:EL132546.1,INSD:EL148718.1,INSD:EH842942.1,
INSD:EL341633.1,INSD:EL256299.1,INSD:EL277200.1"
/inference="similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:AY060541.1,INSD:BX821086.1"
/note="cytochrome b6f complex subunit (petM), putative;
FUNCTIONS IN: plastoquinol-plastocyanin reductase
activity; LOCATED IN: chloroplast thylakoid membrane;
EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13
growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: PetM of
cytochrome b6/f complex subunit 7 (InterPro:IPR012595);
Has 54 Blast hits to 54 proteins in 16 species: Archae -
0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 54;
Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="Araport:AT2G26500"
/db_xref="TAIR:AT2G26500"
BEGIN
1 MATAAAPAVI SWTRSGIVSK SGQTQKKSEM KVSYITGLNS YGGLKAQNNK VVSMGSPLCT
61 EQCFANVVMS LKGRRGNGGA LSTTCNAVGE IFKIAAIMNA LTLVGVAVGF VLLRIETSVE
121 EAEAE
//