LOCUS AEC07769.1 315 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type
family protein protein.
ACCESSION CP002685-3272
PROTEIN_ID AEC07769.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Lin,X., Kaul,S., Rounsley,S., Shea,T.P., Benito,M.I., Town,C.D.,
Fujii,C.Y., Mason,T., Bowman,C.L., Barnstead,M., Feldblyum,T.V.,
Buell,C.R., Ketchum,K.A., Lee,J., Ronning,C.M., Koo,H.L.,
Moffat,K.S., Cronin,L.A., Shen,M., Pai,G., Van Aken,S., Umayam,L.,
Tallon,L.J., Gill,J.E., Adams,M.D., Carrera,A.J., Creasy,T.H.,
Goodman,H.M., Somerville,C.R., Copenhaver,G.P., Preuss,D.,
Nierman,W.C., White,O., Eisen,J.A., Salzberg,S.L., Fraser,C.M. and
Venter,J.C.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 2 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 761-768 (1999)
PUBMED 10617197
REFERENCE 2 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="2"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="ATCTH"
/locus_tag="AT2G25900"
/gene_synonym="A. THALIANA TANDEM ZINC FINGER PROTEIN 1"
/gene_synonym="ATTZF1"
/gene_synonym="F17H15.7"
/gene_synonym="F17H15_7"
/gene_synonym="PUTATIVE CYS3HIS ZINC FINGER PROTEIN"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:ES112431.1,INSD:ES118914.1,INSD:ES080529.1,
INSD:EH804265.1,INSD:BP669044.1,INSD:EL043234.1,
INSD:ES152727.1,INSD:EL981071.1,INSD:EH935478.1,
INSD:EL091084.1,INSD:BP860646.1,INSD:DR345095.1,
INSD:EL995013.1,INSD:ES135797.1,INSD:ES161646.1,
INSD:ES102523.1,INSD:EL128005.1,INSD:ES143622.1,
INSD:DR345098.1,INSD:BP621126.1,INSD:EL257554.1,
INSD:ES093032.1,INSD:EH936357.1,INSD:ES190843.1,
INSD:EL215212.1,INSD:DR345097.1,INSD:EL330396.1,
INSD:AV567654.1,INSD:R64912.1,INSD:AV521861.1,
INSD:EL062139.1,INSD:ES008729.1,INSD:EL302316.1,
INSD:ES079794.1,INSD:EH872931.1,INSD:EH923942.1,
INSD:EL258135.1,INSD:AU237379.1,INSD:DR228411.1,
INSD:EL004692.1,INSD:AU238087.1,INSD:BP617621.1,
INSD:N38497.1,INSD:ES195112.1,INSD:EL065656.1,
INSD:EL237517.1,INSD:ES199968.1,INSD:EL203460.1,
INSD:EH959946.1,INSD:EH909177.1,INSD:EL257614.1,
INSD:EH935028.1,INSD:EL127633.1,INSD:DR345099.1,
INSD:BP854463.1,INSD:EL090002.1,INSD:EG516969.1,
INSD:DR345081.1,INSD:BP600919.1,INSD:EL070390.1,
INSD:EH796914.1,INSD:DR345076.1,INSD:AI994753.1,
INSD:EL322837.1,INSD:AV532556.1,INSD:ES167133.1,
INSD:EH912881.1,INSD:BX838754.1,INSD:DR345100.1,
INSD:ES197622.1,INSD:DR345089.1,INSD:ES149745.1,
INSD:H36143.1,INSD:ES011036.1,INSD:ES040833.1,
INSD:EG485827.1,INSD:H36538.1,INSD:EL182703.1,
INSD:DR228412.1,INSD:EH872253.1,INSD:ES212345.1,
INSD:H36531.1,INSD:ES199974.1,INSD:EL081873.1,
INSD:BP807095.1,INSD:EL119356.1,INSD:EL219173.1,
INSD:BP648762.1,INSD:DR345079.1,INSD:EL190969.1,
INSD:DR345090.1,INSD:AV441095.1,INSD:EG485828.1,
INSD:ES123454.1,INSD:DR345074.1,INSD:BP643815.1,
INSD:EL065787.1,INSD:ES122859.1,INSD:AV531605.1,
INSD:EH919188.1,INSD:ES181125.1,INSD:EL127764.1,
INSD:EH854303.1,INSD:EL031506.1,INSD:ES084588.1,
INSD:ES207462.1,INSD:BP849543.1,INSD:BP661024.1,
INSD:DR345084.1,INSD:EL023649.1,INSD:BE529743.1,
INSD:EL027875.1,INSD:ES197565.1,INSD:EH878012.1,
INSD:DR345093.1,INSD:ES082917.1,INSD:DR345080.1,
INSD:EL243866.1,INSD:ES026008.1,INSD:ES141270.1,
INSD:EL099196.1,INSD:R90483.1,INSD:ES053573.1,
INSD:T46474.1,INSD:ES011617.1,INSD:DR345096.1,
INSD:DR345102.1,INSD:EH838696.1,INSD:ES039626.1,
INSD:DR345101.1,INSD:ES177365.1,INSD:EL242928.1,
INSD:EL987963.1,INSD:EG491150.1,INSD:DR345094.1,
INSD:AV442108.1,INSD:EH978928.1,INSD:T21147.1,
INSD:EL039759.1,INSD:BE526118.1,INSD:DR345104.1,
INSD:AU229223.1,INSD:ES145528.1,INSD:DR345088.1,
INSD:EG491149.1,INSD:ES151878.1,INSD:BX837496.1,
INSD:ES203828.1,INSD:ES126675.1,INSD:ES006908.1,
INSD:ES181211.1,INSD:R90127.1,INSD:DR345092.1,
INSD:EH855742.1,INSD:DR345103.1,INSD:ES020658.1,
INSD:EL232563.1,INSD:ES110900.1,INSD:EL005363.1,
INSD:Z35224.1,INSD:EH857710.1,INSD:EL979031.1,
INSD:EL064176.1,INSD:ES087288.1,INSD:BE522960.1,
INSD:EH917851.1,INSD:EH919236.1,INSD:BP863971.1,
INSD:BP671366.1,INSD:EH833577.1,INSD:ES202941.1,
INSD:ES067992.1,INSD:ES016113.1,INSD:BP638615.1,
INSD:EL077943.1,INSD:EL052714.1,INSD:ES145294.1,
INSD:CF651389.1,INSD:BX838035.1,INSD:EL071785.1,
INSD:ES095803.1,INSD:EH799588.1,INSD:AV558454.1,
INSD:ES096711.1,INSD:ES086062.1,INSD:ES192698.1,
INSD:DR345078.1,INSD:BP612324.1,INSD:EL170851.1,
INSD:EL167157.1,INSD:AV535078.1,INSD:BP866939.1,
INSD:DR345077.1,INSD:ES068706.1,INSD:BP617057.1,
INSD:ES054675.1,INSD:AV535426.1,INSD:EH799136.1,
INSD:EH844250.1,INSD:EH982696.1,INSD:DR345082.1,
INSD:EL007960.1,INSD:DR345083.1,INSD:AV805798.1,
INSD:EH852976.1,INSD:EL041035.1,INSD:AV565042.1,
INSD:BP848530.1,INSD:EL971472.1,INSD:ES106087.1,
INSD:EH952843.1,INSD:DR345075.1,INSD:DR345091.1,
INSD:EH994971.1,INSD:EH809311.1,INSD:ES077594.1,
INSD:ES146267.1,INSD:BP629119.1,INSD:ES016783.1,
INSD:EL111721.1,INSD:EL068704.1,INSD:BX834888.1,
INSD:EH834622.1,INSD:BP668048.1,INSD:EL216150.1,
INSD:ES087923.1,INSD:AV567098.1,INSD:ES191920.1,
INSD:ES172849.1,INSD:Z35223.1,INSD:EL209408.1,
INSD:EH817995.1,INSD:EL281625.1,INSD:DR376536.1,
INSD:BP805387.1,INSD:EL118503.1,INSD:EH932778.1,
INSD:ES136550.1,INSD:DR345087.1,INSD:DR345085.1,
INSD:BP795336.1,INSD:ES028075.1,INSD:EL274456.1,
INSD:EG516968.1,INSD:EH848907.1,INSD:EL217180.1,
INSD:EH937896.1,INSD:AU228425.1,INSD:EL333811.1,
INSD:EH887751.1,INSD:BP809156.1,INSD:BP601495.1,
INSD:ES100439.1,INSD:AV821106.1,INSD:ES171622.1,
INSD:ES112725.1,INSD:EH905715.1,INSD:DR345086.1,
INSD:ES210443.1,INSD:ES120109.1,INSD:ES101857.1,
INSD:EH971681.1,INSD:CB074292.1,INSD:EL215750.1,
INSD:ES102107.1,INSD:EH966516.1"
/inference="similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:U81238.1,INSD:AK117272.1,INSD:BX819269.1,
INSD:BX819309.1,INSD:BX819606.1,INSD:AY129468.1,
INSD:BX821251.1,INSD:AF370590.1,INSD:BX819430.1,
INSD:AY087957.1,INSD:BX842012.1,INSD:BX820115.1,
INSD:BX819250.1,INSD:AF375403.1,INSD:BX819953.1"
/note="ATCTH; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Zinc finger,
CCCH-type (InterPro:IPR000571); BEST Arabidopsis thaliana
protein match is: CCCH-type zinc finger family protein
(TAIR:AT2G19810.1); Has 796 Blast hits to 771 proteins in
136 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 198;
Fungi - 6; Plants - 407; Viruses - 0; Other Eukaryotes -
185 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="Araport:AT2G25900"
/db_xref="TAIR:AT2G25900"
BEGIN
1 MMIGENKNRP HPTIHIPQWD QINDPTATIS SPFSSVNLNS VNDYPHSPSP YLDSFASLFR
61 YLPSNELTND SDSSSGDESS PLTDSFSSDE FRIYEFKIRR CARGRSHDWT ECPFAHPGEK
121 ARRRDPRKFH YSGTACPEFR KGSCRRGDSC EFSHGVFECW LHPSRYRTQP CKDGTSCRRR
181 ICFFAHTTEQ LRVLPCSLDP DLGFFSGLAT SPTSILVSPS FSPPSESPPL SPSTGELIAS
241 MRKMQLNGGG CSWSSPMRSA VRLPFSSSLR PIQAATWPRI REFEIEEAPA MEFVESGKEL
301 RAEMYARLSR ENSLG
//