LOCUS AEC07629.1 294 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana CONSTANS-like 3 protein.
ACCESSION CP002685-3072
PROTEIN_ID AEC07629.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Lin,X., Kaul,S., Rounsley,S., Shea,T.P., Benito,M.I., Town,C.D.,
Fujii,C.Y., Mason,T., Bowman,C.L., Barnstead,M., Feldblyum,T.V.,
Buell,C.R., Ketchum,K.A., Lee,J., Ronning,C.M., Koo,H.L.,
Moffat,K.S., Cronin,L.A., Shen,M., Pai,G., Van Aken,S., Umayam,L.,
Tallon,L.J., Gill,J.E., Adams,M.D., Carrera,A.J., Creasy,T.H.,
Goodman,H.M., Somerville,C.R., Copenhaver,G.P., Preuss,D.,
Nierman,W.C., White,O., Eisen,J.A., Salzberg,S.L., Fraser,C.M. and
Venter,J.C.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 2 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 761-768 (1999)
PUBMED 10617197
REFERENCE 2 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="2"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="COL3"
/locus_tag="AT2G24790"
/gene_synonym="ATCOL3"
/gene_synonym="B-box domain protein 4"
/gene_synonym="BBX4"
/gene_synonym="CONSTANS-like 3"
/gene_synonym="F27A10.10"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:EL202967.1,INSD:EL087317.1,INSD:DR222064.1,
INSD:BP817289.1,INSD:DR222037.1,INSD:EL163714.1,
INSD:EH805276.1,INSD:EL303118.1,INSD:BP585824.1,
INSD:ES001255.1,INSD:BP825720.1,INSD:EL244521.1,
INSD:EL277282.1,INSD:EL125777.1,INSD:EL094538.1,
INSD:EG502919.1,INSD:DR222051.1,INSD:AV788264.1,
INSD:BP670711.1,INSD:BP630336.1,INSD:EL333142.1,
INSD:EH809039.1,INSD:DR222030.1,INSD:ES112222.1,
INSD:EL234726.1,INSD:DR222058.1,INSD:EL302485.1,
INSD:DR222034.1,INSD:EL260085.1,INSD:ES041109.1,
INSD:BP656368.1,INSD:EL326572.1,INSD:BP838484.1,
INSD:ES204230.1,INSD:ES170457.1,INSD:EH948258.1,
INSD:DR222044.1,INSD:EH916368.1,INSD:EL080513.1,
INSD:DR222041.1,INSD:BP600226.1,INSD:ES202487.1,
INSD:EH987299.1,INSD:EH873735.1,INSD:EH802846.1,
INSD:DR222042.1,INSD:EL224288.1,INSD:ES129180.1,
INSD:DR222035.1,INSD:ES185005.1,INSD:DR222062.1,
INSD:BP646278.1,INSD:EL250587.1,INSD:ES013969.1,
INSD:ES181041.1,INSD:EH896201.1,INSD:DR222039.1,
INSD:DR222054.1,INSD:EL196039.1,INSD:EL130255.1,
INSD:ES115217.1,INSD:BP846688.1,INSD:EL305642.1,
INSD:CB185727.2,INSD:BP571646.1,INSD:EH904252.1,
INSD:ES012534.1,INSD:BP654523.1,INSD:H76905.1,
INSD:EL048814.1,INSD:BE039045.1,INSD:ES114418.1,
INSD:EG479005.1,INSD:ES052208.1,INSD:BP654634.1,
INSD:EL133452.1,INSD:BP818215.1,INSD:EG479004.1,
INSD:EL149166.1,INSD:BP654189.1,INSD:BP837352.1,
INSD:AV814202.1,INSD:BP630455.1,INSD:BP590993.1,
INSD:EH852716.1,INSD:ES104689.1,INSD:EL143807.1,
INSD:BP817803.1,INSD:EL254455.1,INSD:Z24476.1,
INSD:EL272349.1,INSD:EL197062.1,INSD:EL014293.1,
INSD:EL211470.1,INSD:EL060310.1,INSD:ES147248.1,
INSD:EL970736.1,INSD:ES205036.1,INSD:DR222043.1,
INSD:BP654587.1,INSD:DR222066.1,INSD:AV828461.1,
INSD:DR222063.1,INSD:EL008661.1,INSD:EL289135.1,
INSD:BP863569.1,INSD:DR222060.1,INSD:ES102211.1,
INSD:EH883686.1,INSD:DR372719.1,INSD:EL254817.1,
INSD:EL188221.1,INSD:DR222036.1,INSD:EH927115.1,
INSD:AV801488.1,INSD:BP817595.1,INSD:ES197314.1,
INSD:BP597493.1,INSD:EL015346.1,INSD:BP848886.1,
INSD:EL072380.1,INSD:BP816284.1,INSD:AV535023.1,
INSD:AI994709.1,INSD:DR222053.1,INSD:DR222052.1,
INSD:EH823047.1,INSD:DR222049.1,INSD:EH890234.1,
INSD:EL319911.1,INSD:EL265052.1,INSD:DN604707.1,
INSD:DR305794.1,INSD:DR222040.1,INSD:ES111857.1,
INSD:ES143893.1,INSD:ES119167.1,INSD:EH974124.1,
INSD:DR222047.1,INSD:EH864457.1,INSD:DR749946.1,
INSD:EL216408.1,INSD:DR222061.1,INSD:EL118835.1,
INSD:EH927053.1,INSD:ES020536.1,INSD:DR222065.1,
INSD:EH817066.1,INSD:BP644191.1,INSD:DR222048.1,
INSD:DR222045.1,INSD:AV519830.1,INSD:EL259406.1,
INSD:ES212631.1,INSD:EH850862.1,INSD:DR222029.1,
INSD:CD530587.1,INSD:DR222050.1,INSD:EG478008.1,
INSD:DR370961.1,INSD:EL219942.1,INSD:EL287659.1,
INSD:DR222038.1,INSD:BP570136.1,INSD:AV538590.1,
INSD:EG454147.1,INSD:EL215474.1,INSD:ES076547.1,
INSD:ES151486.1,INSD:ES086804.1,INSD:EL062136.1,
INSD:ES108980.1,INSD:ES055319.1,INSD:BP616566.1,
INSD:BP840973.1,INSD:EL974075.1,INSD:BP838389.1,
INSD:DR222033.1,INSD:EL118104.1,INSD:ES079328.1,
INSD:AV527725.1,INSD:AV805290.1,INSD:DR749947.1,
INSD:BP595948.1,INSD:EL244809.1,INSD:DR222046.1,
INSD:ES158737.1,INSD:DR222057.1,INSD:EL998620.1,
INSD:BP651073.1,INSD:EL274686.1,INSD:EL124292.1,
INSD:EL049172.1,INSD:EL012969.1,INSD:BP582391.1,
INSD:DR222059.1,INSD:EL147509.1,INSD:EL238269.1,
INSD:DR222031.1,INSD:DR222028.1,INSD:DR222056.1,
INSD:BP651836.1,INSD:N96038.1,INSD:ES211502.1,
INSD:EH966325.1,INSD:EL103234.1,INSD:ES135936.1,
INSD:BP792035.1,INSD:BP645422.1,INSD:BP858294.1,
INSD:ES058127.1,INSD:DR222055.1,INSD:AV785412.1,
INSD:EL325130.1,INSD:EH957320.1,INSD:BP644514.1,
INSD:N38693.1"
/inference="similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:AY140103.1,INSD:BX819991.1,INSD:AY058130.1,
INSD:BT002107.1,INSD:BX842081.1,INSD:BX819670.1,
INSD:BX841997.1,INSD:AY085729.1"
/note="CONSTANS-like 3 (COL3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s:
CCT domain (InterPro:IPR010402), Zinc finger, B-box
(InterPro:IPR000315); BEST Arabidopsis thaliana protein
match is: CONSTANS-like 4 (TAIR:AT5G24930.1); Has 3343
Blast hits to 2491 proteins in 138 species: Archae - 0;
Bacteria - 0; Metazoa - 2; Fungi - 1; Plants - 3148;
Viruses - 0; Other Eukaryotes - 192 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="Araport:AT2G24790"
/db_xref="TAIR:AT2G24790"
intron_pos 194:0 (1/1)
BEGIN
1 MASSSRLCDS CKSTAATLFC RADAAFLCGD CDGKIHTANK LASRHERVWL CEVCEQAPAH
61 VTCKADAAAL CVTCDRDIHS ANPLSRRHER VPITPFYDAV GPAKSASSSV NFVDEDGGDV
121 TASWLLAKEG IEITNLFSDL DYPKIEVTSE ENSSGNDGVV PVQNKLFLNE DYFNFDLSAS
181 KISQQGFNFI NQTVSTRTID VPLVPESGGV TAEMTNTETP AVQLSPAERE ARVLRYREKR
241 KNRKFEKTIR YASRKAYAEM RPRIKGRFAK RTDSRENDGG DVGVYGGFGV VPSF
//