LOCUS AEC07129.1 258 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana Translocon-associated protein (TRAP)
, alpha subunit protein.
ACCESSION CP002685-2368
PROTEIN_ID AEC07129.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Lin,X., Kaul,S., Rounsley,S., Shea,T.P., Benito,M.I., Town,C.D.,
Fujii,C.Y., Mason,T., Bowman,C.L., Barnstead,M., Feldblyum,T.V.,
Buell,C.R., Ketchum,K.A., Lee,J., Ronning,C.M., Koo,H.L.,
Moffat,K.S., Cronin,L.A., Shen,M., Pai,G., Van Aken,S., Umayam,L.,
Tallon,L.J., Gill,J.E., Adams,M.D., Carrera,A.J., Creasy,T.H.,
Goodman,H.M., Somerville,C.R., Copenhaver,G.P., Preuss,D.,
Nierman,W.C., White,O., Eisen,J.A., Salzberg,S.L., Fraser,C.M. and
Venter,J.C.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 2 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 761-768 (1999)
PUBMED 10617197
REFERENCE 2 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="2"
/ecotype="Columbia"
protein /locus_tag="AT2G21160"
/gene_synonym="F26H11.8"
/gene_synonym="F26H11_8"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:DR295637.1,INSD:EH862606.1,INSD:EL221667.1,
INSD:DR295639.1,INSD:BP561844.2,INSD:EL319180.1,
INSD:EG476940.1,INSD:EL255286.1,INSD:DR195430.1,
INSD:EL308392.1,INSD:EL096448.1,INSD:DR295647.1,
INSD:DR295654.1,INSD:DR231677.1,INSD:ES141218.1,
INSD:EL103005.1,INSD:EH836184.1,INSD:EH936709.1,
INSD:ES147026.1,INSD:EH893133.1,INSD:EL101751.1,
INSD:EH814572.1,INSD:ES108556.1,INSD:EH836878.1,
INSD:Z17687.1,INSD:DR295629.1,INSD:EL082064.1,
INSD:EL169163.1,INSD:EL145097.1,INSD:ES111953.1,
INSD:BP586540.1,INSD:DR378146.1,INSD:DR295662.1,
INSD:EL314560.1,INSD:DR295656.1,INSD:EL324234.1,
INSD:EG514851.1,INSD:BP777346.1,INSD:ES202786.1,
INSD:DR295622.1,INSD:EL252287.1,INSD:EH913151.1,
INSD:ES051626.1,INSD:DR295660.1,INSD:DR295657.1,
INSD:ES215157.1,INSD:DR295643.1,INSD:DR295626.1,
INSD:AV540220.1,INSD:EL285407.1,INSD:EL189019.1,
INSD:EL245605.1,INSD:ES198980.1,INSD:EH807745.1,
INSD:EH833532.1,INSD:EL994238.1,INSD:BP866412.1,
INSD:EG514850.1,INSD:EH851232.1,INSD:BE522523.1,
INSD:AV823247.1,INSD:AV555687.1,INSD:AV566907.1,
INSD:EH849703.1,INSD:EL999600.1,INSD:DR295645.1,
INSD:DR295667.1,INSD:BP587634.1,INSD:DR295646.1,
INSD:EL176192.1,INSD:EL220187.1,INSD:EH890027.1,
INSD:EH971715.1,INSD:ES145700.1,INSD:AV808946.1,
INSD:EL074822.1,INSD:EL259015.1,INSD:EL088273.1,
INSD:EH872662.1,INSD:Z37662.1,INSD:BE522524.1,
INSD:DR295650.1,INSD:ES082136.1,INSD:EH987451.1,
INSD:EL998810.1,INSD:EL973421.1,INSD:EL968814.1,
INSD:DR295649.1,INSD:ES038429.1,INSD:AV796962.1,
INSD:EL099800.1,INSD:EH919543.1,INSD:EL187061.1,
INSD:EL973017.1,INSD:DR195432.1,INSD:DR295633.1,
INSD:ES087321.1,INSD:EH916007.1,INSD:ES204031.1,
INSD:DR295658.1,INSD:AV800741.1,INSD:EH926310.1,
INSD:EL125506.1,INSD:DR295642.1,INSD:ES175720.1,
INSD:ES123837.1,INSD:EH913028.1,INSD:EL222470.1,
INSD:EL233984.1,INSD:ES053921.1,INSD:ES194616.1,
INSD:EL331743.1,INSD:BP851437.1,INSD:ES178959.1,
INSD:ES207527.1,INSD:DR295648.1,INSD:ES211488.1,
INSD:ES059129.1,INSD:EL072599.1,INSD:EL989733.1,
INSD:ES154796.1,INSD:DR381298.1,INSD:EH874460.1,
INSD:DR195431.1,INSD:BP827231.1,INSD:ES021625.1,
INSD:DR382305.1,INSD:DR195433.1,INSD:DR374280.1,
INSD:AI995183.1,INSD:DR295661.1,INSD:DR295625.1,
INSD:DR295634.1,INSD:EL037655.1,INSD:DR295641.1,
INSD:BE526401.1,INSD:ES004445.1,INSD:ES164306.1,
INSD:AV530031.1,INSD:EL967411.1,INSD:DR295664.1,
INSD:EL979999.1,INSD:BP795510.1,INSD:EL997720.1,
INSD:ES208433.1,INSD:ES112491.1,INSD:DR295623.1,
INSD:DR295640.1,INSD:AV558878.1,INSD:BP823913.1,
INSD:EL997418.1,INSD:EL995054.1,INSD:EL063000.1,
INSD:EH919985.1,INSD:AA713265.1,INSD:DR295631.1,
INSD:EH825387.1,INSD:DR295644.1,INSD:EL122992.1,
INSD:EL258680.1,INSD:EL018373.1,INSD:EL330630.1,
INSD:EL096325.1,INSD:EH863290.1,INSD:EH902237.1,
INSD:EL976689.1,INSD:EL217541.1,INSD:EH804945.1,
INSD:EL074789.1,INSD:EH971237.1,INSD:DR295655.1,
INSD:EL123671.1,INSD:EL116304.1,INSD:AV522381.1,
INSD:EH840785.1,INSD:EL999622.1,INSD:BP647404.1,
INSD:DR295621.1,INSD:ES175272.1,INSD:EL111507.1,
INSD:ES205806.1,INSD:DR295638.1,INSD:EL268830.1,
INSD:EH867325.1,INSD:BP846603.1,INSD:DR295651.1,
INSD:DR295624.1,INSD:EL028201.1,INSD:DR295665.1,
INSD:DR295652.1,INSD:ES076366.1,INSD:ES035278.1,
INSD:DR295653.1,INSD:ES150939.1,INSD:DR295632.1,
INSD:AV811962.1,INSD:EL322281.1,INSD:DR262213.1,
INSD:AA395525.1,INSD:EH904263.1,INSD:BP783870.1,
INSD:AV811043.1,INSD:BP649996.1,INSD:BP820641.1,
INSD:AV554400.1,INSD:EL163483.1,INSD:BP623924.1,
INSD:ES198168.1,INSD:ES166041.1,INSD:DR195427.1,
INSD:DR295659.1,INSD:DR295627.1,INSD:EL976821.1,
INSD:ES189601.1,INSD:N37192.1,INSD:AV788119.1,
INSD:EH931260.1,INSD:EL119222.1,INSD:BE528691.1,
INSD:EH902094.1,INSD:EL275436.1,INSD:ES083881.1,
INSD:BP649541.1,INSD:ES162714.1,INSD:AV788079.1,
INSD:DR295636.1,INSD:EL145660.1,INSD:DR295635.1,
INSD:T45517.1,INSD:EH967200.1,INSD:DR295663.1,
INSD:ES113956.1,INSD:BP562958.1,INSD:DR295630.1,
INSD:EL967535.1,INSD:DR195428.1,INSD:DR295628.1"
/inference="similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:BX820894.1,INSD:L32016.1,INSD:AY050351.1,
INSD:BT020421.1,INSD:AY086796.1,INSD:BX820437.1"
/note="Translocon-associated protein (TRAP), alpha
subunit; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED
IN: chloroplast thylakoid membrane, endoplasmic reticulum,
plasma membrane, vacuole; EXPRESSED IN: 27 plant
structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS
InterPro DOMAIN/s: Translocon-associated protein (TRAP),
alpha subunit (InterPro:IPR005595); BEST Arabidopsis
thaliana protein match is: Translocon-associated protein
(TRAP), alpha subunit (TAIR:AT2G16595.1); Has 246 Blast
hits to 246 proteins in 95 species: Archae - 0; Bacteria -
0; Metazoa - 141; Fungi - 24; Plants - 60; Viruses - 0;
Other Eukaryotes - 21 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="Araport:AT2G21160"
/db_xref="TAIR:AT2G21160"
intron_pos 21:1 (1/7)
intron_pos 77:1 (2/7)
intron_pos 94:1 (3/7)
intron_pos 124:0 (4/7)
intron_pos 150:0 (5/7)
intron_pos 218:0 (6/7)
intron_pos 242:0 (7/7)
BEGIN
1 MMNLRVLFLA LLLLASPLLQ VARCQSDAED HSSLVDDVVG ENTDDAVEED DHDLDMNLSS
61 FPGVETVCVF PKNSAKLVPA GEETELLVGL KNEGKTRVGV MGIRASVHLP YDHKLLVQNL
121 TMLRLNNASI PTSLQATFPY IFAVSQYLQP GAFDLVGYII YDVEGKPYQS VFYNGTIEVV
181 ESGGLLSGES VFLLTLGIGL LLLLGLWAYS QVQRLTKKTK KVSKVEVGTR STEASLDEWL
241 EGTTLAKTSS GKTKNKKN
//