LOCUS AEC07092.1 300 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana photosystem II reaction center PSB29
protein protein.
ACCESSION CP002685-2314
PROTEIN_ID AEC07092.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Lin,X., Kaul,S., Rounsley,S., Shea,T.P., Benito,M.I., Town,C.D.,
Fujii,C.Y., Mason,T., Bowman,C.L., Barnstead,M., Feldblyum,T.V.,
Buell,C.R., Ketchum,K.A., Lee,J., Ronning,C.M., Koo,H.L.,
Moffat,K.S., Cronin,L.A., Shen,M., Pai,G., Van Aken,S., Umayam,L.,
Tallon,L.J., Gill,J.E., Adams,M.D., Carrera,A.J., Creasy,T.H.,
Goodman,H.M., Somerville,C.R., Copenhaver,G.P., Preuss,D.,
Nierman,W.C., White,O., Eisen,J.A., Salzberg,S.L., Fraser,C.M. and
Venter,J.C.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 2 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 761-768 (1999)
PUBMED 10617197
REFERENCE 2 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="2"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="PSB29"
/locus_tag="AT2G20890"
/gene_synonym="F5H14.14"
/gene_synonym="F5H14_14"
/gene_synonym="photosystem II reaction center PSB29
protein"
/gene_synonym="THF1"
/gene_synonym="THYLAKOID FORMATION1"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:DR337186.1,INSD:EH805732.1,INSD:EL322877.1,
INSD:EH971382.1,INSD:AV798117.1,INSD:EL249139.1,
INSD:EL035684.1,INSD:DR337201.1,INSD:BP633038.1,
INSD:BP787107.1,INSD:EH860125.1,INSD:EL132782.1,
INSD:EH939305.1,INSD:ES136766.1,INSD:BP587630.1,
INSD:EH949714.1,INSD:EL173402.1,INSD:EL206602.1,
INSD:EH835584.1,INSD:ES198488.1,INSD:BP665653.1,
INSD:EH981258.1,INSD:DR337185.1,INSD:EH912394.1,
INSD:AV804682.1,INSD:EL228847.1,INSD:ES046805.1,
INSD:EL147485.1,INSD:DR337191.1,INSD:EH984165.1,
INSD:EL258654.1,INSD:AV796779.1,INSD:DR337190.1,
INSD:ES084185.1,INSD:BU634574.1,INSD:BU635731.1,
INSD:EL262637.1,INSD:AV784857.1,INSD:EH911647.1,
INSD:DR337198.1,INSD:DR337195.1,INSD:EH858259.1,
INSD:EL233580.1,INSD:DR337203.1,INSD:AV790454.1,
INSD:ES002622.1,INSD:DR337189.1,INSD:EG459544.1,
INSD:ES051094.1,INSD:DR337199.1,INSD:EL233675.1,
INSD:EL311800.1,INSD:BP783963.1,INSD:ES071032.1,
INSD:EL124807.1,INSD:BP867641.1,INSD:EH958777.1,
INSD:EH960506.1,INSD:AV803663.1,INSD:DR337181.1,
INSD:EL037334.1,INSD:BP627918.1,INSD:EH802976.1,
INSD:CB258731.1,INSD:EL103588.1,INSD:EL165171.1,
INSD:EL031587.1,INSD:DR375430.1,INSD:EL032666.1,
INSD:ES122421.1,INSD:DR337182.1,INSD:BX837060.1,
INSD:EG495904.1,INSD:EL245641.1,INSD:EL210163.1,
INSD:EL194979.1,INSD:DR337188.1,INSD:EL081068.1,
INSD:EL311568.1,INSD:ES152779.1,INSD:EH807981.1,
INSD:EH945309.1,INSD:EL332819.1,INSD:EL116338.1,
INSD:EL105242.1,INSD:EL226396.1,INSD:DR354872.1,
INSD:EL282664.1,INSD:AV803574.1,INSD:EL107292.1,
INSD:ES124909.1,INSD:EL057930.1,INSD:EL297654.1,
INSD:EH886150.1,INSD:EL031547.1,INSD:EH929211.1,
INSD:EL230211.1,INSD:DR337204.1,INSD:EL050855.1,
INSD:AV805574.1,INSD:EL018301.1,INSD:EH898821.1,
INSD:AV787021.1,INSD:EH979325.1,INSD:EL253402.1,
INSD:EH954681.1,INSD:ES146848.1,INSD:EL196435.1,
INSD:BP792114.1,INSD:BP627819.1,INSD:DR337196.1,
INSD:EH942246.1,INSD:EL290758.1,INSD:DR337193.1,
INSD:EL330385.1,INSD:EH802665.1,INSD:DR337192.1,
INSD:EL335260.1,INSD:DR337200.1,INSD:EH984101.1,
INSD:R90537.1,INSD:AI999281.1,INSD:BP624556.1,
INSD:EL203075.1,INSD:AV811590.1,INSD:EH821428.1,
INSD:EL169668.1,INSD:EH901417.1,INSD:EL021403.1,
INSD:EH907514.1,INSD:EL197993.1,INSD:AV814776.1,
INSD:EL256357.1,INSD:EL312155.1,INSD:BP858471.1,
INSD:EH897608.1,INSD:EH880864.1,INSD:EL129470.1,
INSD:EL247240.1,INSD:DR337183.1,INSD:EH825787.1,
INSD:ES081138.1,INSD:EH799983.1,INSD:EH829232.1,
INSD:EL997090.1,INSD:EL230727.1,INSD:EL306235.1,
INSD:EH864518.1,INSD:EL259244.1,INSD:EL098615.1,
INSD:ES095961.1,INSD:EH970293.1,INSD:EL261767.1,
INSD:EH840232.1,INSD:ES044066.1,INSD:EL199987.1,
INSD:AV440558.1,INSD:EH814334.1,INSD:BP646358.1,
INSD:EL044251.1,INSD:DR337187.1,INSD:EH870774.1,
INSD:EL005969.1,INSD:EH960162.1,INSD:AV788838.1,
INSD:EH843709.1,INSD:EL311281.1,INSD:BP779273.1,
INSD:EL183452.1,INSD:BE039146.1,INSD:EL119802.1,
INSD:AV802286.1,INSD:EG495903.1,INSD:EH980544.1,
INSD:EL078927.1,INSD:EL324905.1,INSD:EL027956.1,
INSD:EH925462.1,INSD:EH836183.1,INSD:EL258581.1,
INSD:ES080480.1,INSD:EL122234.1,INSD:EH798031.1,
INSD:EH890061.1,INSD:DR337202.1,INSD:BP786763.1,
INSD:EL220696.1,INSD:EL166082.1,INSD:ES136377.1,
INSD:EL101042.1,INSD:EL176830.1,INSD:EL233447.1,
INSD:DR337197.1,INSD:EH811680.1,INSD:EL074743.1,
INSD:EG459543.1,INSD:ES098907.1,INSD:EH957029.1,
INSD:EL331305.1,INSD:AV801617.1,INSD:EH938678.1,
INSD:EH835456.1,INSD:EH978553.1,INSD:EL161759.1,
INSD:EH882292.1,INSD:EL217422.1,INSD:EH804075.1,
INSD:DR337184.1,INSD:EL200409.1,INSD:EH799645.1,
INSD:ES090824.1,INSD:EL295426.1,INSD:EH918115.1,
INSD:EH981509.1,INSD:ES113894.1,INSD:EL085317.1,
INSD:EL094895.1,INSD:ES139425.1,INSD:EH894459.1,
INSD:EG459542.1,INSD:EL341293.1,INSD:EL034567.1,
INSD:EH870600.1,INSD:AV823803.1,INSD:EL066228.1,
INSD:AV555658.1,INSD:EL284945.1,INSD:DR337194.1,
INSD:EH834094.1,INSD:EH900040.1,INSD:EH813431.1,
INSD:EH845336.1,INSD:EL247293.1,INSD:EH903999.1,
INSD:AV808033.1,INSD:EH877978.1,INSD:AV555657.1,
INSD:EL016824.1,INSD:AA605442.1,INSD:EG459540.1,
INSD:EL194415.1"
/inference="similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:BX820020.1,INSD:AY087394.1,INSD:BX818803.1,
INSD:AY081596.1,INSD:AY899908.1,INSD:BX820185.1,
INSD:AY062799.1,INSD:BX818901.1"
/note="photosystem II reaction center PSB29 protein
(PSB29); FUNCTIONS IN: molecular_function unknown;
INVOLVED IN: in 6 processes; LOCATED IN: in 9 components;
EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14
growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Photosystem II
biogenesis protein Psp29 (InterPro:IPR017499); Has 330
Blast hits to 330 proteins in 95 species: Archae - 0;
Bacteria - 141; Metazoa - 1; Fungi - 0; Plants - 61;
Viruses - 6; Other Eukaryotes - 121 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="Araport:AT2G20890"
/db_xref="TAIR:AT2G20890"
intron_pos 63:1 (1/4)
intron_pos 152:2 (2/4)
intron_pos 225:0 (3/4)
intron_pos 263:2 (4/4)
BEGIN
1 MAATAISSLS FPALGQSDKI SNFASSRPLA SAIRICTKFS RLSLNSRSTS KSLIHCMSNV
61 TADVPPVSET KSKFLKAYKR PIPSIYNTVL QELIVQQHLM RYKKTYRYDP VFALGFVTVY
121 DQLMEGYPSD QDRDAIFKAY IEALNEDPKQ YRIDAQKMEE WARSQTSASL VDFSSKEGDI
181 EAVLKDIAGR AGSKEGFSYS RFFAVGLFRL LELASATDPT VLDKLCASLN INKKSVDRDL
241 DVYRNLLSKL VQAKELLKEY VEREKKKQGE RAQSQKANET ISKCLGDTLY NPSFLVERKS
//