LOCUS AEC06918.1 143 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana Ribosomal L28e protein family protein.
ACCESSION CP002685-2072
PROTEIN_ID AEC06918.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Lin,X., Kaul,S., Rounsley,S., Shea,T.P., Benito,M.I., Town,C.D.,
Fujii,C.Y., Mason,T., Bowman,C.L., Barnstead,M., Feldblyum,T.V.,
Buell,C.R., Ketchum,K.A., Lee,J., Ronning,C.M., Koo,H.L.,
Moffat,K.S., Cronin,L.A., Shen,M., Pai,G., Van Aken,S., Umayam,L.,
Tallon,L.J., Gill,J.E., Adams,M.D., Carrera,A.J., Creasy,T.H.,
Goodman,H.M., Somerville,C.R., Copenhaver,G.P., Preuss,D.,
Nierman,W.C., White,O., Eisen,J.A., Salzberg,S.L., Fraser,C.M. and
Venter,J.C.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 2 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 761-768 (1999)
PUBMED 10617197
REFERENCE 2 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="2"
/ecotype="Columbia"
protein /locus_tag="AT2G19730"
/gene_synonym="F6F22.24"
/gene_synonym="F6F22_24"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:ES042089.1,INSD:ES189576.1,INSD:ES201105.1,
INSD:AV564522.1,INSD:EH872120.1,INSD:ES151306.1,
INSD:ES022013.1,INSD:ES014429.1,INSD:EL294344.1,
INSD:EL318385.1,INSD:AV823405.1,INSD:DR288848.1,
INSD:ES124333.1,INSD:EH909625.1,INSD:ES199403.1,
INSD:AV534576.1,INSD:ES089551.1,INSD:DR288835.1,
INSD:DR288833.1,INSD:ES144278.1,INSD:DR288851.1,
INSD:ES080827.1,INSD:ES056080.1,INSD:BE038429.1,
INSD:EH976477.1,INSD:AA597524.1,INSD:DR288831.1,
INSD:DR288843.1,INSD:ES203730.1,INSD:ES206943.1,
INSD:EG509632.1,INSD:ES060289.1,INSD:EL322520.1,
INSD:ES190700.1,INSD:EL046999.1,INSD:BP573462.1,
INSD:ES117342.1,INSD:BE529472.1,INSD:ES057930.1,
INSD:BP566283.1,INSD:EL015266.1,INSD:ES062555.1,
INSD:AV550092.1,INSD:ES077205.1,INSD:EH865523.1,
INSD:EL112204.1,INSD:ES046267.1,INSD:EH950709.1,
INSD:ES152582.1,INSD:BP565396.1,INSD:DR288853.1,
INSD:EG482284.1,INSD:ES127161.1,INSD:BP567554.1,
INSD:ES179865.1,INSD:EH867465.1,INSD:EL003406.1,
INSD:ES208466.1,INSD:ES026572.1,INSD:ES079291.1,
INSD:ES086139.1,INSD:EH946727.1,INSD:ES150440.1,
INSD:BP779585.1,INSD:EL054254.1,INSD:DR288829.1,
INSD:ES085549.1,INSD:EL065285.1,INSD:ES125953.1,
INSD:EL973423.1,INSD:DR288846.1,INSD:ES037820.1,
INSD:ES023951.1,INSD:BP589226.1,INSD:BP597676.1,
INSD:AA712884.1,INSD:ES119366.1,INSD:EH978838.1,
INSD:ES110066.1,INSD:EL227778.1,INSD:DR288841.1,
INSD:ES151277.1,INSD:ES024282.1,INSD:EL093150.1,
INSD:ES037066.1,INSD:EH896777.1,INSD:EL996004.1,
INSD:EG518651.1,INSD:H37001.1,INSD:EL984877.1,
INSD:EL322413.1,INSD:EL987403.1,INSD:EG482167.1,
INSD:AV784363.1,INSD:ES036916.1,INSD:ES129946.1,
INSD:EL003763.1,INSD:ES054577.1,INSD:DR288849.1,
INSD:EL137741.1,INSD:EH888724.1,INSD:ES058189.1,
INSD:EL041240.1,INSD:DR376973.1,INSD:EL031907.1,
INSD:ES158184.1,INSD:ES185614.1,INSD:BP564916.1,
INSD:ES035037.1,INSD:EL023901.1,INSD:DR288837.1,
INSD:EL132888.1,INSD:ES161884.1,INSD:ES026521.1,
INSD:DR288828.1,INSD:EL238490.1,INSD:ES169580.1,
INSD:ES028180.1,INSD:EL042001.1,INSD:EL188410.1,
INSD:EH839247.1,INSD:DR374900.1,INSD:ES019735.1,
INSD:ES082501.1,INSD:EH802037.1,INSD:EL975831.1,
INSD:BP580758.1,INSD:DR288844.1,INSD:EH978579.1,
INSD:EL259826.1,INSD:EL081960.1,INSD:DR288842.1,
INSD:EL985310.1,INSD:CF652803.1,INSD:EL159614.1,
INSD:ES104086.1,INSD:EL052005.1,INSD:DR288850.1,
INSD:EH855356.1,INSD:EH931073.1,INSD:ES118894.1,
INSD:EL145409.1,INSD:ES199027.1,INSD:DR288840.1,
INSD:EL264488.1,INSD:ES015988.1,INSD:ES139024.1,
INSD:ES045172.1,INSD:EL149663.1,INSD:ES118637.1,
INSD:EL999406.1,INSD:EL114979.1,INSD:ES209376.1,
INSD:DR288845.1,INSD:EL029344.1,INSD:EH980074.1,
INSD:ES008104.1,INSD:ES045604.1,INSD:AV819301.1,
INSD:DR288834.1,INSD:DR288856.1,INSD:DR288827.1,
INSD:EL153799.1,INSD:ES133329.1,INSD:ES206157.1,
INSD:ES099979.1,INSD:EH953740.1,INSD:EH811495.1,
INSD:DR288832.1,INSD:EL139526.1,INSD:EH988493.1,
INSD:EL031673.1,INSD:EL193838.1,INSD:EL325200.1,
INSD:EL072988.1,INSD:EL204807.1,INSD:ES076259.1,
INSD:EH942230.1,INSD:EL012088.1,INSD:EH849535.1,
INSD:EL235836.1,INSD:AI995261.1,INSD:EL018140.1,
INSD:EL019684.1,INSD:EH907987.1,INSD:EL245242.1,
INSD:EG518650.1,INSD:EL275377.1,INSD:ES113955.1,
INSD:ES079592.1,INSD:ES211052.1,INSD:DR288836.1,
INSD:ES181791.1,INSD:EL305518.1,INSD:EL186817.1,
INSD:EH832028.1,INSD:EH840216.1,INSD:BP647538.1,
INSD:EH822463.1,INSD:ES055715.1,INSD:EL989725.1,
INSD:BP863424.1,INSD:EL332224.1,INSD:EG509633.1,
INSD:DR288854.1,INSD:DR288838.1,INSD:ES064996.1,
INSD:ES071576.1,INSD:EG482282.1,INSD:BP630038.1,
INSD:ES002199.1,INSD:DR288852.1,INSD:ES068455.1,
INSD:CF652479.1,INSD:EL004965.1,INSD:ES035867.1,
INSD:BP796967.1,INSD:DR288830.1,INSD:ES137825.1,
INSD:EL014859.1,INSD:EH893003.1,INSD:EL208312.1,
INSD:EL031957.1,INSD:EL065443.1,INSD:ES157390.1,
INSD:DR288847.1,INSD:EL986317.1,INSD:EL056276.1,
INSD:CB265133.1,INSD:EL995635.1,INSD:ES063264.1,
INSD:EH865722.1,INSD:ES053509.1,INSD:EL974695.1,
INSD:DR288855.1,INSD:EL977937.1,INSD:ES125399.1,
INSD:EH806151.1,INSD:EH944027.1,INSD:EH802373.1,
INSD:EL223338.1,INSD:EH798969.1,INSD:DR288858.1,
INSD:EL089339.1,INSD:ES046554.1"
/inference="similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:BX821549.1,INSD:AY079378.1,INSD:AY050769.1,
INSD:BX820934.1"
/note="Ribosomal L28e protein family; FUNCTIONS IN:
structural constituent of ribosome; INVOLVED IN:
translation, ribosome biogenesis; LOCATED IN: in 6
components; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED
DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s:
Ribosomal protein L28e (InterPro:IPR002672); BEST
Arabidopsis thaliana protein match is: Ribosomal L28e
protein family (TAIR:AT4G29410.2); Has 531 Blast hits to
531 proteins in 211 species: Archae - 0; Bacteria - 0;
Metazoa - 280; Fungi - 94; Plants - 107; Viruses - 0;
Other Eukaryotes - 50 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="Araport:AT2G19730"
/db_xref="TAIR:AT2G19730"
intron_pos 50:1 (1/2)
intron_pos 105:0 (2/2)
BEGIN
1 MATVPGQLIW EIVKNNNCFL VKQFGRGNSK VQFSKETNNL TNVHSYKHSG LANKKTVTIQ
61 AADKDQAVVL ATTKTKKQNK PKLSVNKSIL KKEFPRMSKA VANQVVDNYY RPDLKKAALA
121 RLSAISKGLR VAKSGAKQRN RQA
//