LOCUS AEC05621.1 152 aa PRT PLN 23-MAR-2023
DEFINITION Arabidopsis thaliana ubiquiting-conjugating enzyme 2 protein.
ACCESSION CP002685-332
PROTEIN_ID AEC05621.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Lin,X., Kaul,S., Rounsley,S., Shea,T.P., Benito,M.I., Town,C.D.,
Fujii,C.Y., Mason,T., Bowman,C.L., Barnstead,M., Feldblyum,T.V.,
Buell,C.R., Ketchum,K.A., Lee,J., Ronning,C.M., Koo,H.L.,
Moffat,K.S., Cronin,L.A., Shen,M., Pai,G., Van Aken,S., Umayam,L.,
Tallon,L.J., Gill,J.E., Adams,M.D., Carrera,A.J., Creasy,T.H.,
Goodman,H.M., Somerville,C.R., Copenhaver,G.P., Preuss,D.,
Nierman,W.C., White,O., Eisen,J.A., Salzberg,S.L., Fraser,C.M. and
Venter,J.C.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 2 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 402 (6763), 761-768 (1999)
PUBMED 10617197
REFERENCE 2 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 19698289)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="2"
/ecotype="Columbia"
protein /gene="UBC2"
/locus_tag="AT2G02760"
/gene_synonym="ATUBC2"
/gene_synonym="T20F6.10"
/gene_synonym="T20F6_10"
/gene_synonym="ubiquitin-conjugating enzyme 2"
/gene_synonym="ubiquiting-conjugating enzyme 2"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:DR263502.1,INSD:BP857268.1,INSD:ES011229.1,
INSD:EL269493.1,INSD:ES207689.1,INSD:EH818556.1,
INSD:EL175497.1,INSD:EH891660.1,INSD:ES210913.1,
INSD:EL039378.1,INSD:EH845004.1,INSD:EG473957.1,
INSD:EH900836.1,INSD:DR263500.1,INSD:BP578156.1,
INSD:EL012347.1,INSD:EH847703.1,INSD:EL020124.1,
INSD:EL200287.1,INSD:EL134530.1,INSD:EL144781.1,
INSD:ES199435.1,INSD:ES014073.1,INSD:EL260577.1,
INSD:AV552916.1,INSD:EL277151.1,INSD:EL105469.1,
INSD:BP578008.1,INSD:EL116920.1,INSD:EH842896.1,
INSD:ES037259.1,INSD:EL070849.1,INSD:EL029723.1,
INSD:EG528620.1,INSD:BP576940.1,INSD:EG497581.1,
INSD:EG471233.1,INSD:BP622795.1,INSD:EH928559.1,
INSD:BP866236.1,INSD:EL022370.1,INSD:EH854500.1,
INSD:EH829397.1,INSD:EL166002.1,INSD:BP560453.2,
INSD:EL335726.1,INSD:EH825522.1,INSD:ES017935.1,
INSD:BP863404.1,INSD:EH828001.1,INSD:EL276421.1,
INSD:ES044975.1,INSD:EH905477.1,INSD:ES182400.1,
INSD:EL982851.1,INSD:DR263501.1,INSD:EL171952.1,
INSD:CA781486.1,INSD:ES111173.1,INSD:BP564001.1,
INSD:EL015011.1,INSD:EH890578.1,INSD:EH871369.1,
INSD:EL012097.1,INSD:EH881514.1,INSD:CF773648.1,
INSD:ES174430.1,INSD:EL182612.1,INSD:DR233819.1,
INSD:EL159421.1,INSD:EH832977.1,INSD:AV544588.1,
INSD:ES191469.1,INSD:EL167843.1,INSD:EL038058.1,
INSD:EL029094.1,INSD:EH859459.1,INSD:EG497582.1,
INSD:EG497532.1,INSD:EL180175.1,INSD:ES184566.1,
INSD:EL134444.1,INSD:ES168162.1,INSD:EL024143.1,
INSD:ES184128.1,INSD:ES165557.1,INSD:BP661138.1,
INSD:EL285349.1,INSD:ES208909.1,INSD:AV796642.1,
INSD:ES172585.1,INSD:BP607574.1,INSD:EG502825.1,
INSD:EL970292.1,INSD:EH859158.1,INSD:EH853392.1,
INSD:AI999015.1,INSD:EH853177.1,INSD:EL334688.1,
INSD:BP574210.1,INSD:ES104908.1,INSD:BP567212.1,
INSD:EL271490.1,INSD:ES086345.1,INSD:ES189559.1,
INSD:ES079777.1,INSD:EH914523.1,INSD:ES096234.1,
INSD:EL976375.1,INSD:ES062534.1,INSD:EH875105.1,
INSD:ES139208.1,INSD:ES154600.1,INSD:EL036477.1,
INSD:BP815080.1,INSD:ES068284.1,INSD:EL038459.1,
INSD:EH897309.1,INSD:EH885397.1,INSD:EH910145.1,
INSD:CB261083.1,INSD:EL030848.1,INSD:EG497588.1,
INSD:EH882348.1,INSD:ES109197.1,INSD:ES034875.1,
INSD:BP865736.1,INSD:EH975788.1,INSD:EL096349.1,
INSD:EH827368.1,INSD:EL182990.1,INSD:EG528619.1,
INSD:ES136632.1,INSD:EL246103.1,INSD:BP830201.1,
INSD:BP560869.1,INSD:BP866294.1,INSD:EL085709.1,
INSD:EL128944.1,INSD:EH975833.1,INSD:ES201196.1,
INSD:ES207918.1,INSD:BP606972.1,INSD:EH820555.1,
INSD:EL190430.1,INSD:EH865328.1,INSD:EL142593.1,
INSD:EH978046.1,INSD:ES125489.1,INSD:EG473950.1,
INSD:EL167177.1,INSD:EL112283.1,INSD:ES191575.1,
INSD:EH896933.1,INSD:BP569760.1,INSD:EH901569.1,
INSD:EL135456.1,INSD:EL211158.1,INSD:ES125692.1,
INSD:EL299835.1,INSD:EL136265.1,INSD:ES074071.1,
INSD:EL015569.1,INSD:EL144302.1,INSD:ES032768.1,
INSD:EH848996.1,INSD:EL251245.1,INSD:BP577129.1,
INSD:EG502826.1,INSD:EL038905.1,INSD:EL163064.1,
INSD:EH836332.1,INSD:EL088842.1,INSD:ES026969.1,
INSD:EL341430.1,INSD:EH879950.1,INSD:ES146109.1,
INSD:EL969601.1,INSD:EH894293.1,INSD:BP779858.1,
INSD:EL056757.1,INSD:EL331319.1,INSD:ES123099.1,
INSD:EH898280.1,INSD:EL255030.1,INSD:ES105997.1,
INSD:ES160877.1,INSD:EH955844.1,INSD:EL125513.1,
INSD:ES147415.1,INSD:EH930424.1,INSD:AV796325.1,
INSD:EL257522.1,INSD:Z27262.1,INSD:ES101225.1,
INSD:EL050923.1,INSD:ES141167.1,INSD:EH977420.1,
INSD:EL234727.1,INSD:EH861691.1,INSD:EH882887.1,
INSD:BP584787.1,INSD:EH979902.1,INSD:EH934836.1,
INSD:EL140363.1,INSD:EH901673.1,INSD:BP614733.1,
INSD:ES124000.1,INSD:ES042262.1,INSD:ES125000.1,
INSD:BP578170.1,INSD:EH882170.1,INSD:EL118058.1,
INSD:BP859459.1,INSD:Z29863.1,INSD:EL217183.1,
INSD:EH802702.1,INSD:EL095569.1,INSD:BP580954.1,
INSD:EL167358.1,INSD:AV783573.1,INSD:AV781457.1,
INSD:EL277130.1,INSD:EH917607.1,INSD:BP573312.1,
INSD:ES202174.1,INSD:EL118268.1,INSD:ES143323.1,
INSD:EG497533.1,INSD:EL177936.1,INSD:BP572300.1,
INSD:EL212588.1,INSD:ES183716.1,INSD:EH853119.1,
INSD:BP573695.1,INSD:EH965687.1,INSD:EL167115.1,
INSD:ES161499.1,INSD:BP574784.1,INSD:EH929579.1,
INSD:EL007501.1,INSD:BP839923.1,INSD:EL135252.1,
INSD:EL016695.1,INSD:EL009439.1,INSD:EL021184.1,
INSD:ES119928.1,INSD:ES140482.1,INSD:EL335807.1,
INSD:EL307507.1,INSD:ES088115.1,INSD:EL079530.1,
INSD:ES016012.1,INSD:EL009272.1,INSD:EL163097.1,
INSD:EL296231.1,INSD:ES123579.1,INSD:EH951041.1,
INSD:ES069588.1,INSD:EL134617.1,INSD:EL044386.1"
/inference="similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:DQ027017.1,INSD:AF370558.1,INSD:AY072479.1,
INSD:Y13031.1"
/note="ubiquiting-conjugating enzyme 2 (UBC2); CONTAINS
InterPro DOMAIN/s: Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like
(InterPro:IPR016135), Ubiquitin-conjugating enzyme, E2
(InterPro:IPR000608); BEST Arabidopsis thaliana protein
match is: ubiquitin carrier protein 1 (TAIR:AT1G14400.2);
Has 10642 Blast hits to 10588 proteins in 402 species:
Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 4556; Fungi - 2331;
Plants - 2015; Viruses - 26; Other Eukaryotes - 1712
(source: NCBI BLink)."
/db_xref="Araport:AT2G02760"
/db_xref="TAIR:AT2G02760"
intron_pos 42:2 (1/4)
intron_pos 51:1 (2/4)
intron_pos 81:1 (3/4)
intron_pos 111:0 (4/4)
BEGIN
1 MSTPARKRLM RDFKRLQQDP PAGISGAPQD NNIMLWNAVI FGPDDTPWDG GTFKLSLQFS
61 EDYPNKPPTV RFVSRMFHPN IYADGSICLD ILQNQWSPIY DVAAILTSIQ SLLCDPNPNS
121 PANSEAARMF SESKREYNRR VREVVEQSWT AD
//