LOCUS AEC10520.1 122 aa PRT PLN 23-MAR-2023 DEFINITION Arabidopsis thaliana AUTOPHAGY 8E protein. ACCESSION CP002685-6998 PROTEIN_ID AEC10520.1 SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress) ORGANISM Arabidopsis thaliana Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae; Camelineae; Arabidopsis. REFERENCE 1 (bases 1 to 19698289) AUTHORS Lin,X., Kaul,S., Rounsley,S., Shea,T.P., Benito,M.I., Town,C.D., Fujii,C.Y., Mason,T., Bowman,C.L., Barnstead,M., Feldblyum,T.V., Buell,C.R., Ketchum,K.A., Lee,J., Ronning,C.M., Koo,H.L., Moffat,K.S., Cronin,L.A., Shen,M., Pai,G., Van Aken,S., Umayam,L., Tallon,L.J., Gill,J.E., Adams,M.D., Carrera,A.J., Creasy,T.H., Goodman,H.M., Somerville,C.R., Copenhaver,G.P., Preuss,D., Nierman,W.C., White,O., Eisen,J.A., Salzberg,S.L., Fraser,C.M. and Venter,J.C. TITLE Sequence and analysis of chromosome 2 of the plant Arabidopsis thaliana JOURNAL Nature 402 (6763), 761-768 (1999) PUBMED 10617197 REFERENCE 2 (bases 1 to 19698289) AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E. CONSRTM TAIR TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA REFERENCE 3 (bases 1 to 19698289) AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M., Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R., Vaughn,M. and Town,C.D. TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute, 9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA REMARK Protein update by submitter FEATURES Qualifiers source /organism="Arabidopsis thaliana" /mol_type="genomic DNA" /db_xref="taxon:3702" /chromosome="2" /ecotype="Columbia" protein /gene="ATG8E" /locus_tag="AT2G45170" /gene_synonym="ATATG8E" /gene_synonym="AUTOPHAGY 8E" /gene_synonym="T14P1.2" /inference="Similar to RNA sequence, EST:INSD:EH871115.1,INSD:EL243704.1,INSD:ES029118.1, INSD:EL159405.1,INSD:EH897249.1,INSD:EH796567.1, INSD:Z46713.1,INSD:EL081552.1,INSD:EH812838.1, INSD:AV824802.1,INSD:EL971758.1,INSD:EH889626.1, INSD:EL221646.1,INSD:EH816187.1,INSD:ES214316.1, INSD:EL180422.1,INSD:EL213588.1,INSD:CD533447.1, INSD:EH827957.1,INSD:EL194427.1,INSD:ES087985.1, INSD:DR357801.1,INSD:EH994306.1,INSD:EH849307.1, INSD:EL214687.1,INSD:DR382652.1,INSD:EH986059.1, INSD:EH830503.1,INSD:DR357796.1,INSD:EL286013.1, INSD:EL972758.1,INSD:ES044396.1,INSD:ES071550.1, INSD:EL028087.1,INSD:EH908732.1,INSD:CD531934.1, INSD:EH798338.1,INSD:DR357790.1,INSD:EL307537.1, INSD:EH989510.1,INSD:ES082861.1,INSD:EL030542.1, INSD:EL968290.1,INSD:EL198132.1,INSD:BP567070.1, INSD:EL113898.1,INSD:EL308977.1,INSD:EL315269.1, INSD:EL281940.1,INSD:R65365.1,INSD:EL199232.1, INSD:EH845670.1,INSD:EH806468.1,INSD:EL109651.1, INSD:EL030052.1,INSD:EL969393.1,INSD:EL185678.1, INSD:ES042261.1,INSD:EL124535.1,INSD:ES013011.1, INSD:EL152613.1,INSD:EL020577.1,INSD:EL321282.1, INSD:DR357789.1,INSD:DR357786.1,INSD:EL228782.1, INSD:DR357799.1,INSD:DR357794.1,INSD:EL204149.1, INSD:EH862481.1,INSD:EH921823.1,INSD:AV787767.1, INSD:CD530039.1,INSD:EH834414.1,INSD:EL327102.1, INSD:EL109230.1,INSD:EH953830.1,INSD:DR357800.1, INSD:EL171931.1,INSD:CD529613.1,INSD:BP868213.1, INSD:CD532471.1,INSD:AV800799.1,INSD:DR357793.1, INSD:EH944135.1,INSD:DR357797.1,INSD:EL177631.1, INSD:EL138157.1,INSD:EL275962.1,INSD:Z46714.1, INSD:EH802970.1,INSD:EL967739.1,INSD:EL976820.1, INSD:DR357791.1,INSD:EL250021.1,INSD:EL049613.1, INSD:ES118661.1,INSD:AI998809.1,INSD:EL168060.1, INSD:EL328774.1,INSD:EH902142.1,INSD:DR357798.1, INSD:EL070451.1,INSD:ES103066.1,INSD:DR357792.1, INSD:EL968836.1,INSD:EH838805.1,INSD:EH934308.1, INSD:EL325613.1,INSD:EL037887.1,INSD:EH971971.1, INSD:EH956873.1,INSD:CD529504.1,INSD:EH810401.1, INSD:DR357795.1,INSD:EL972924.1,INSD:CB255638.1, INSD:CD533314.1,INSD:BP657070.1,INSD:CB263610.1, INSD:EH806683.1,INSD:ES031342.1,INSD:AV805879.1, INSD:EL071729.1,INSD:BP802977.1,INSD:EL129508.1, INSD:EL971291.1,INSD:EL098014.1,INSD:ES000298.1, INSD:DR357788.1,INSD:EL067710.1,INSD:EL169241.1, INSD:DR357787.1" /inference="similar to RNA sequence, mRNA:INSD:AB073179.1,INSD:AY074388.1,INSD:AF412106.1, INSD:BX819493.1" /note="AUTOPHAGY 8E (ATG8E); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Light chain 3 (LC3) (InterPro:IPR004241); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ubiquitin-like superfamily protein (TAIR:AT4G16520.2); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink)." /db_xref="Araport:AT2G45170" /db_xref="TAIR:AT2G45170" intron_pos 14:1 (1/3) intron_pos 33:0 (2/3) intron_pos 50:2 (3/3) BEGIN 1 MNKGSIFKMD NDFEKRKAEA GRIREKYPDR IPVIVEKAEK SEVPNIDKKK YLVPSDLTVG 61 QFVYVIRKRI KLSAEKAIFI FVDNVLPPTG ELMSSVYEDK KDEDGFLYIT YSGENTFGAS 121 SI //