LOCUS AEC09681.1 154 aa PRT PLN 23-MAR-2023 DEFINITION Arabidopsis thaliana ribosomal protein L23AA protein. ACCESSION CP002685-5858 PROTEIN_ID AEC09681.1 SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress) ORGANISM Arabidopsis thaliana Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae; Camelineae; Arabidopsis. REFERENCE 1 (bases 1 to 19698289) AUTHORS Lin,X., Kaul,S., Rounsley,S., Shea,T.P., Benito,M.I., Town,C.D., Fujii,C.Y., Mason,T., Bowman,C.L., Barnstead,M., Feldblyum,T.V., Buell,C.R., Ketchum,K.A., Lee,J., Ronning,C.M., Koo,H.L., Moffat,K.S., Cronin,L.A., Shen,M., Pai,G., Van Aken,S., Umayam,L., Tallon,L.J., Gill,J.E., Adams,M.D., Carrera,A.J., Creasy,T.H., Goodman,H.M., Somerville,C.R., Copenhaver,G.P., Preuss,D., Nierman,W.C., White,O., Eisen,J.A., Salzberg,S.L., Fraser,C.M. and Venter,J.C. TITLE Sequence and analysis of chromosome 2 of the plant Arabidopsis thaliana JOURNAL Nature 402 (6763), 761-768 (1999) PUBMED 10617197 REFERENCE 2 (bases 1 to 19698289) AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E. CONSRTM TAIR TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA REFERENCE 3 (bases 1 to 19698289) AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M., Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R., Vaughn,M. and Town,C.D. TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute, 9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA REMARK Protein update by submitter FEATURES Qualifiers source /organism="Arabidopsis thaliana" /mol_type="genomic DNA" /db_xref="taxon:3702" /chromosome="2" /ecotype="Columbia" protein /gene="RPL23AA" /locus_tag="AT2G39460" /gene_synonym="ARABIDOPSIS THALIANA RIBOSOMAL PROTEIN L23A" /gene_synonym="ATRPL23A" /gene_synonym="F12L6.12" /gene_synonym="F12L6_12" /gene_synonym="RIBOSOMAL PROTEIN L23A" /gene_synonym="RIBOSOMAL PROTEIN L23A1" /gene_synonym="ribosomal protein L23AA" /gene_synonym="RPL23A" /gene_synonym="RPL23A1" /inference="Similar to RNA sequence, EST:INSD:EH943239.1,INSD:ES046503.1,INSD:EL010362.1, INSD:ES061708.1,INSD:EL137620.1,INSD:ES002803.1, INSD:AV820171.1,INSD:BP803044.1,INSD:EL076109.1, INSD:ES111493.1,INSD:EH829423.1,INSD:EL159627.1, INSD:DR206982.1,INSD:BP831441.1,INSD:EH902438.1, INSD:DR207006.1,INSD:DR207017.1,INSD:ES074479.1, INSD:ES090077.1,INSD:BP633667.1,INSD:EH929774.1, INSD:EL239178.1,INSD:ES048485.1,INSD:ES003117.1, INSD:ES004684.1,INSD:BP800135.1,INSD:BP818916.1, INSD:EL979008.1,INSD:EH857042.1,INSD:DR207026.1, INSD:EH961412.1,INSD:DR206989.1,INSD:ES108649.1, INSD:CB264987.1,INSD:EL226893.1,INSD:ES161025.1, INSD:ES080091.1,INSD:EH900882.1,INSD:ES040254.1, INSD:DR207033.1,INSD:BP802061.1,INSD:EL978745.1, INSD:ES030857.1,INSD:ES003028.1,INSD:BP665389.1, INSD:EL306437.1,INSD:ES191453.1,INSD:ES078707.1, INSD:EL994300.1,INSD:EL090281.1,INSD:EL267828.1, INSD:EH888129.1,INSD:EH857895.1,INSD:BP639586.1, INSD:EL004780.1,INSD:DR207019.1,INSD:ES107519.1, INSD:DR207021.1,INSD:AV787508.1,INSD:ES095848.1, INSD:DR232227.1,INSD:BP587172.1,INSD:EL091185.1, INSD:BP578327.1,INSD:ES167046.1,INSD:BP575440.1, INSD:EL154928.1,INSD:EL995146.1,INSD:ES007648.1, INSD:BP564889.1,INSD:BP574233.1,INSD:ES204476.1, INSD:ES099626.1,INSD:ES180799.1,INSD:ES062775.1, INSD:AW004249.1,INSD:BP670353.1,INSD:BP574006.1, INSD:EL994914.1,INSD:EH855898.1,INSD:BP582099.1, INSD:EL294558.1,INSD:ES093023.1,INSD:EH808303.1, INSD:EH987444.1,INSD:EL978924.1,INSD:EL298765.1, INSD:DR207031.1,INSD:DR206997.1,INSD:ES211238.1, INSD:ES107602.1,INSD:BE039409.1,INSD:EL994768.1, INSD:ES070477.1,INSD:BP587477.1,INSD:BP583074.1, INSD:EH932164.1,INSD:EL031158.1,INSD:EL142450.1, INSD:ES001280.1,INSD:ES213848.1,INSD:ES074373.1, INSD:ES008260.1,INSD:BP573226.1,INSD:EH950916.1, INSD:DR206996.1,INSD:DR206988.1,INSD:BP647738.1, INSD:ES109125.1,INSD:ES138559.1,INSD:ES018973.1, INSD:EL057256.1,INSD:DR207010.1,INSD:DR206987.1, INSD:EH963654.1,INSD:EL029055.1,INSD:ES074416.1, INSD:ES100545.1,INSD:DR207024.1,INSD:EL988788.1, INSD:ES173552.1,INSD:EL976576.1,INSD:ES096161.1, INSD:ES043624.1,INSD:BP843271.1,INSD:EL027068.1, INSD:ES044270.1,INSD:ES161606.1,INSD:BP623615.1, INSD:DR207038.1,INSD:DR207039.1,INSD:BP800705.1, INSD:ES048828.1,INSD:AV827895.1,INSD:DR206992.1, INSD:DR206993.1,INSD:DR207018.1,INSD:ES035813.1, INSD:ES142393.1,INSD:EL043978.1,INSD:BP585261.1, INSD:EL279917.1,INSD:EL196142.1,INSD:EH822314.1, INSD:AV822158.1,INSD:BP664876.1,INSD:EL222362.1, INSD:ES070159.1,INSD:EL015303.1,INSD:ES068782.1, INSD:DR207045.1,INSD:ES019724.1,INSD:ES056851.1, INSD:DR206991.1,INSD:BP668590.1,INSD:BP567645.1, INSD:EH955250.1,INSD:ES125925.1,INSD:BP640896.1, INSD:BP668731.1,INSD:EH893645.1,INSD:ES130143.1, INSD:DR207040.1,INSD:EL991227.1,INSD:DR207008.1, INSD:ES197401.1,INSD:ES091275.1,INSD:ES026522.1, INSD:DR207002.1,INSD:DR207041.1,INSD:BP596343.1, INSD:EH817195.1,INSD:BP868137.1,INSD:EL340487.1, INSD:BP646270.1,INSD:EL239272.1,INSD:EL194206.1, INSD:EL027902.1,INSD:BP571653.1,INSD:EH865070.1, INSD:ES181656.1,INSD:EL174902.1,INSD:EL312849.1, INSD:DR207043.1,INSD:ES171187.1,INSD:DR206985.1, INSD:ES104836.1,INSD:ES061388.1,INSD:ES017234.1, INSD:EL994383.1,INSD:EH930234.1,INSD:BP850978.1, INSD:DR206984.1,INSD:BP846427.1,INSD:DR206983.1, INSD:AV790019.1,INSD:EL988521.1,INSD:ES001807.1, INSD:EL064350.1,INSD:ES128145.1,INSD:BP594527.1, INSD:EH808439.1,INSD:EL975985.1,INSD:BP563241.1, INSD:EH966985.1,INSD:ES106281.1,INSD:DR207013.1, INSD:EL126797.1,INSD:EL278091.1,INSD:DR207012.1, INSD:EL322451.1,INSD:EL973694.1,INSD:ES071174.1, INSD:EL279956.1,INSD:DR206995.1,INSD:EH818760.1, INSD:EL138518.1,INSD:BP851163.2,INSD:ES138658.1, INSD:CB252498.1,INSD:EL236480.1,INSD:EL115008.1, INSD:ES133784.1,INSD:EH963907.1,INSD:DR207029.1, INSD:EL262772.1,INSD:BP824695.1,INSD:BP812300.1, INSD:EL321230.1,INSD:AV799788.1,INSD:ES124050.1, INSD:ES203094.1,INSD:DR206999.1,INSD:EL166062.1, INSD:DR207005.1,INSD:EL193147.1,INSD:EL983708.1, INSD:ES195452.1,INSD:DR207001.1,INSD:ES090960.1, INSD:EL978219.1,INSD:ES010689.1,INSD:DR207044.1, INSD:ES113092.1,INSD:ES010713.1,INSD:CB265178.1, INSD:EL968549.1,INSD:EL970199.1,INSD:DR207046.1, INSD:DR206986.1,INSD:ES044827.1,INSD:DR207015.1, INSD:BP638169.1,INSD:BP803824.1,INSD:ES099656.1, INSD:DR207016.1,INSD:CB265179.1,INSD:ES131674.1, INSD:DR207037.1,INSD:ES050482.1,INSD:EH883727.1, INSD:DR207014.1,INSD:AV811398.1,INSD:DR207035.1, INSD:DR207023.1,INSD:EL991442.1,INSD:BP590716.1, INSD:ES087350.1,INSD:ES105940.1,INSD:ES144147.1, INSD:EH824666.1,INSD:ES106675.1,INSD:DR207011.1, INSD:EL998809.1,INSD:EH886060.1,INSD:ES109402.1, INSD:ES161945.1,INSD:BP788385.1,INSD:AV788597.1, INSD:EL056155.1,INSD:DR207034.1,INSD:ES198885.1, INSD:DR373555.1,INSD:DR207025.1,INSD:DR207020.1, INSD:DR206990.1,INSD:AV782832.1,INSD:BP867426.1, INSD:ES041131.1,INSD:DR207042.1,INSD:ES161046.1, INSD:BP796560.1,INSD:DR207030.1,INSD:BP662989.1, INSD:EL233784.1,INSD:EL048356.1,INSD:ES187828.1, INSD:EL089747.1,INSD:ES102005.1,INSD:EH893522.1, INSD:EH959566.1,INSD:EL272677.1,INSD:BP835686.1, INSD:DR207032.1,INSD:EL337849.1,INSD:ES138777.1, INSD:DR207004.1,INSD:AI099631.1,INSD:DR206998.1, INSD:EL163885.1,INSD:DR207000.1,INSD:ES004214.1, INSD:EL315282.1,INSD:DR207007.1,INSD:BP803897.1, INSD:EL224505.1,INSD:BP567014.1,INSD:BP564331.1, INSD:DR207036.1,INSD:BP646308.1,INSD:EH949414.1, INSD:EL089347.1,INSD:EL309990.1,INSD:DR207003.1, INSD:EL981220.1,INSD:EL195515.1,INSD:EH829706.1, INSD:ES175546.1,INSD:ES022240.1,INSD:ES086440.1, INSD:EH870513.1" /inference="similar to RNA sequence, mRNA:INSD:AF034694.1,INSD:BX819997.1,INSD:AY086212.1, INSD:AF325056.2,INSD:AY039850.1,INSD:AY037235.1" /note="ribosomal protein L23AA (RPL23AA); FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome, RNA binding, nucleotide binding; INVOLVED IN: response to oxidative stress, response to high light intensity, response to cold, translation, ribosome biogenesis; LOCATED IN: cytosolic ribosome, cytosolic large ribosomal subunit, intracellular, large ribosomal subunit; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein L23/L25, conserved site (InterPro:IPR001014), Ribosomal protein L23/L15e, core (InterPro:IPR012678), Ribosomal protein L23/L25, N-terminal (InterPro:IPR005633), Nucleotide-binding, alpha-beta plait (InterPro:IPR012677), Ribosomal protein L25/L23 (InterPro:IPR013025), Ribosomal protein L23 (InterPro:IPR019985); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ribosomal protein L23AB (TAIR:AT3G55280.2); Has 2634 Blast hits to 2634 proteins in 929 species: Archae - 307; Bacteria - 1168; Metazoa - 411; Fungi - 142; Plants - 120; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 486 (source: NCBI BLink)." /db_xref="Araport:AT2G39460" /db_xref="TAIR:AT2G39460" intron_pos 6:1 (1/2) intron_pos 127:2 (2/2) BEGIN 1 MSPAKVDTTK KADPKAKALK AAKAVKSGQA FKKKDKKIRT KVTFHRPKTL TKPRTGKYPK 61 ISATPRNKLD HYQILKYPLT TESAMKKIED NNTLVFIVDI RADKKKIKDA VKKMYDIQTK 121 KVNTLIRPDG TKKAYVRLTP DYDALDVANK IGII //