LOCUS AB449342 10124 bp DNA linear PLN 20-DEC-2010 DEFINITION Ipomoea nil CHS-D gene for chalcone synthase, complete cds, cultivar: Tancho, allele: r-2. ACCESSION AB449342 VERSION AB449342.1 KEYWORDS . SOURCE Ipomoea nil (Japanese morning glory) ORGANISM Ipomoea nil Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; asterids; lamiids; Solanales; Convolvulaceae; Ipomoeeae; Ipomoea. REFERENCE 1 (bases 1 to 10124) AUTHORS Hoshino,A. TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (24-JUL-2008) to the DDBJ/EMBL/GenBank databases. Contact:Atsushi Hoshino National Institute for Basic Biology, Molecular Genetics; 38 Nishigonaka Myodaiji, Okazaki, Aichi 444-8585, Japan REFERENCE 2 AUTHORS Hoshino,A., Park,K.I. and Iida,S. TITLE Identification of r mutations conferring white flowers in the Japanese morning glory ( Ipomoea nil ) JOURNAL J. Plant Res. 122, 215-222 (2009) COMMENT FEATURES Location/Qualifiers source 1..10124 /cultivar="Tancho" /db_xref="taxon:35883" /mol_type="genomic DNA" /organism="Ipomoea nil" exon 558..815 /gene="CHS-D" CDS join(638..815,8242..9230) /allele="r-2" /codon_start=1 /gene="CHS-D" /product="chalcone synthase" /protein_id="BAH28851.1" /transl_table=1 /translation="MVTVEEVRKAQRAEGPATILAIGTATPANCVDQSTYPDYYFRIT NSDHMTDLKQKFQRMCDKSMITKRYMHLTEEILKENPSFCEYMAPSLDARQDIVVVEV PKLGKEAAQSAIKEWGQPKSKITHVIFCTTSGVDMPGADYQLTKLLGLRPSVKRLMMY QQGCFAGGTVLRVAKDLAENNKAARVLVVCSEITVVTFRGPNETHLDSLVGQALFGDG AAAIIVGSDPTPAEKPLFQLVSAAQTLAPDSCGAIDGHLREVGLTFHLLKDVPSIVSN NIEKCLSEAFNPLGISDWNSIFWIAHPGGPAILDQVEDKLGLKPEKLRATRHVLSEYG NMSSACVLFILDEMRKASSNDGLGTTGEGLEWGVLFGFGPGLTIETVVLHSVPA" mobile_element 1944..6683 /mobile_element_type="transposon: Tpn6" exon 8242..9240 /gene="CHS-D" BASE COUNT 3104 a 1911 c 1778 g 3331 t ORIGIN 1 gctagctata caatttatga agctttataa atgctcttgt ataaatagtg gcgcaaaccc 61 acttaccaaa tcaatgtggg acaaatgcta ctttaaaacc tacacgtgaa ctgtaaccca 121 tgacctttgg catgactttg ataccaaatt gaagcatgtg ttttactcaa ctaaaagtct 181 aagcccatag ttaaattgca cattaatagt tatgtgctca acaatatcaa tctcttcgtc 241 tcactacgaa gaatccgaat cctctttgac tcgatccaaa ttgagagtga acccactaat 301 atctatacca caaaataccc accctatttt aaagctattt ttccaacacg agatacttat 361 tcaaaccatc aagtcatcat gcataacaat tattaattgc cgattgtgga cggtttgctg 421 agccgggtga ggcacgtgat tcctagctac catataagtc cattataacg tacactttaa 481 aatcttatat aaataccatg ccctataccc tatgacaaac agaacataca attgcagtta 541 gttaacgccg cttgtctgtt aataactaca tttaacgtac atccgttact ctgcaatagc 601 ctaaattctc ccacccaaac aaaacgccgg cgaagaaatg gtgaccgtcg aggaggtcag 661 aaaggcgcaa cgcgccgagg gtccggcgac cattctggcc atcggaacgg ccacgccggc 721 caactgcgtc gaccaaagca cctaccccga ctactatttt cgtatcacta atagcgacca 781 tatgaccgac ctcaagcaaa aatttcagcg catgtgtaag aacttatata tatatatata 841 tatgtgtgtg tgtgttttct ttaattttcc tattattata tatactgctc cctcgtcact 901 ttaactcttt cgtttacctc acatgatact gttatcatta 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