LOCUS AEE27235.1 112 aa PRT PLN 20-JUL-2017
DEFINITION Arabidopsis thaliana 60S acidic ribosomal protein family protein.
ACCESSION CP002684-30
PROTEIN_ID AEE27235.1
SOURCE Arabidopsis thaliana (thale cress)
ORGANISM Arabidopsis thaliana
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae;
Pentapetalae; rosids; malvids; Brassicales; Brassicaceae;
Camelineae; Arabidopsis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 30427671)
AUTHORS Theologis,A., Ecker,J.R., Palm,C.J., Federspiel,N.A., Kaul,S.,
White,O., Alonso,J., Altafi,H., Araujo,R., Bowman,C.L.,
Brooks,S.Y., Buehler,E., Chan,A., Chao,Q., Chen,H., Cheuk,R.F.,
Chin,C.W., Chung,M.K., Conn,L., Conway,A.B., Conway,A.R.,
Creasy,T.H., Dewar,K., Dunn,P., Etgu,P., Feldblyum,T.V., Feng,J.,
Fong,B., Fujii,C.Y., Gill,J.E., Goldsmith,A.D., Haas,B.,
Hansen,N.F., Hughes,B., Huizar,L., Hunter,J.L., Jenkins,J.,
Johnson-Hopson,C., Khan,S., Khaykin,E., Kim,C.J., Koo,H.L.,
Kremenetskaia,I., Kurtz,D.B., Kwan,A., Lam,B., Langin-Hooper,S.,
Lee,A., Lee,J.M., Lenz,C.A., Li,J.H., Li,Y., Lin,X., Liu,S.X.,
Liu,Z.A., Luros,J.S., Maiti,R., Marziali,A., Militscher,J.,
Miranda,M., Nguyen,M., Nierman,W.C., Osborne,B.I., Pai,G.,
Peterson,J., Pham,P.K., Rizzo,M., Rooney,T., Rowley,D., Sakano,H.,
Salzberg,S.L., Schwartz,J.R., Shinn,P., Southwick,A.M., Sun,H.,
Tallon,L.J., Tambunga,G., Toriumi,M.J., Town,C.D., Utterback,T.,
Van Aken,S., Vaysberg,M., Vysotskaia,V.S., Walker,M., Wu,D., Yu,G.,
Fraser,C.M., Venter,J.C. and Davis,R.W.
TITLE Sequence and analysis of chromosome 1 of the plant Arabidopsis
thaliana
JOURNAL Nature 408 (6814), 816-820 (2000)
PUBMED 11130712
REFERENCE 2 (bases 1 to 30427671)
AUTHORS Swarbreck,D., Lamesch,P., Wilks,C. and Huala,E.
CONSRTM TAIR
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-FEB-2011) Department of Plant Biology, Carnegie
Institution, 260 Panama Street, Stanford, CA, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 30427671)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-MAY-2016) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
REFERENCE 4 (bases 1 to 30427671)
AUTHORS Krishnakumar,V., Cheng,C.-Y., Chan,A.P., Schobel,S., Kim,M.,
Ferlanti,E.S., Belyaeva,I., Rosen,B.D., Micklem,G., Miller,J.R.,
Vaughn,M. and Town,C.D.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (18-JUL-2017) Plant Genomics, J. Craig Venter Institute,
9704 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
REMARK Protein update by submitter
FEATURES Qualifiers
source /organism="Arabidopsis thaliana"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:3702"
/chromosome="1"
/ecotype="Columbia"
protein /locus_tag="AT1G01100"
/gene_synonym="T25K16.9"
/gene_synonym="T25K16_9"
/inference="Similar to RNA sequence,
EST:INSD:DR203113.1,INSD:DR203076.1,INSD:BP836092.1,
INSD:DR345226.1,INSD:AV541434.1,INSD:DR345280.1,
INSD:BP659894.1,INSD:DR345184.1,INSD:BP819138.1,
INSD:DR203092.1,INSD:BP623145.1,INSD:BP577478.1,
INSD:BP826237.1,INSD:AV826465.2,INSD:BP826782.1,
INSD:BP827053.1,INSD:ES050513.1,INSD:CB263926.1,
INSD:DR183471.1,INSD:ES118895.1,INSD:DR345278.1,
INSD:BP597769.1,INSD:DR345274.1,INSD:DR345364.1,
INSD:BP651270.1,INSD:DR183461.1,INSD:DR345284.1,
INSD:BP812196.1,INSD:EH892862.1,INSD:DR345350.1,
INSD:ES175630.1,INSD:DR377582.1,INSD:ES105448.1,
INSD:DR345246.1,INSD:DR345281.1,INSD:DR345185.1,
INSD:DR183470.1,INSD:EL065424.1,INSD:DR345270.1,
INSD:DR345242.1,INSD:DR345222.1,INSD:BP832733.1,
INSD:DR211234.1,INSD:BP823118.1,INSD:DR203086.1,
INSD:DR345186.1,INSD:DR345187.1,INSD:ES128418.1,
INSD:BP635904.1,INSD:DR345307.1,INSD:DR345229.1,
INSD:DR345332.1,INSD:DR345225.1,INSD:ES204655.1,
INSD:BP594706.1,INSD:ES030547.1,INSD:BP820681.1,
INSD:BP596190.1,INSD:BP854995.2,INSD:EL968449.1,
INSD:DR345218.1,INSD:BP576648.1,INSD:DR345235.1,
INSD:AV795787.1,INSD:DR345339.1,INSD:DR345210.1,
INSD:DR345287.1,INSD:BP833991.1,INSD:DR345362.1,
INSD:DR345205.1,INSD:DR345312.1,INSD:DR183450.1,
INSD:DR345261.1,INSD:AA712509.1,INSD:DR203122.1,
INSD:CB258426.1,INSD:AV795050.1,INSD:DR345272.1,
INSD:BP836713.1,INSD:DR345198.1,INSD:ES170500.1,
INSD:DR203074.1,INSD:DR345331.1,INSD:DR345214.1,
INSD:DR345219.1,INSD:AV536016.1,INSD:ES061279.1,
INSD:BP839086.1,INSD:EG501916.1,INSD:DR183456.1,
INSD:DR345206.1,INSD:EH817750.1,INSD:EL992329.1,
INSD:EL995834.1,INSD:DR345315.1,INSD:BP656953.1,
INSD:DR345356.1,INSD:BP634195.1,INSD:DR203078.1,
INSD:DR345201.1,INSD:DR203088.1,INSD:EL315161.1,
INSD:BP658890.1,INSD:EH897642.1,INSD:DR345283.1,
INSD:DR183448.1,INSD:DR345337.1,INSD:DR345303.1,
INSD:DR345298.1,INSD:DR203117.1,INSD:DR345238.1,
INSD:BP835923.1,INSD:DR345310.1,INSD:DR345212.1,
INSD:BP623338.1,INSD:DR345237.1,INSD:BP647501.1,
INSD:BP815940.1,INSD:DR345180.1,INSD:CB262253.1,
INSD:DR183473.1,INSD:BP813384.1,INSD:DR203067.1,
INSD:ES198802.1,INSD:EG453959.1,INSD:DR203079.1,
INSD:DR203094.1,INSD:DR203101.1,INSD:ES185539.1,
INSD:DR345245.1,INSD:EH944977.1,INSD:DR183451.1,
INSD:DR345191.1,INSD:ES009832.1,INSD:DR345196.1,
INSD:DR345279.1,INSD:DR345195.1,INSD:BP645001.1,
INSD:DR345346.1,INSD:BP658052.1,INSD:ES074073.1,
INSD:DR183446.1,INSD:ES188004.1,INSD:DR345338.1,
INSD:CK118326.1,INSD:DR345277.1,INSD:EL092124.1,
INSD:BP866537.1,INSD:EL177675.1,INSD:EL996608.1,
INSD:DR345234.1,INSD:DR183445.1,INSD:ES059175.1,
INSD:BP819741.1,INSD:DR345286.1,INSD:DR345282.1,
INSD:DR183457.1,INSD:DR203069.1,INSD:DR345357.1,
INSD:DR345248.1,INSD:BP817508.1,INSD:ES069648.1,
INSD:DR203068.1,INSD:DR345183.1,INSD:DR345343.1,
INSD:BP580994.1,INSD:DR203087.1,INSD:DR345213.1,
INSD:BP655343.1,INSD:BP623586.1,INSD:DR203066.1,
INSD:DR345267.1,INSD:ES144920.1,INSD:DR345204.1,
INSD:DR345257.1,INSD:EG501917.1,INSD:CK120355.1,
INSD:EL065885.1,INSD:BP654427.1,INSD:ES088148.1,
INSD:ES203647.1,INSD:DR345363.1,INSD:EH798627.1,
INSD:BP822056.1,INSD:ES174549.1,INSD:DR345220.1,
INSD:ES133505.1,INSD:ES140228.1,INSD:DR203119.1,
INSD:ES104133.1,INSD:DR345291.1,INSD:BP805395.1,
INSD:DR345178.1,INSD:DR345254.1,INSD:DR345340.1,
INSD:DR203080.1,INSD:CK119207.1,INSD:DR345353.1,
INSD:BP651781.1,INSD:ES059228.1,INSD:BP841386.1,
INSD:DR203104.1,INSD:DR345290.1,INSD:ES059823.1,
INSD:DR345317.1,INSD:DR345320.1,INSD:DR183459.1,
INSD:DR345190.1,INSD:BP821880.1,INSD:ES081529.1,
INSD:DR203091.1,INSD:ES069520.1,INSD:CF774158.1,
INSD:EL174160.1,INSD:DR345200.1,INSD:DR345176.1,
INSD:BP628642.1,INSD:EL244147.1,INSD:DR183472.1,
INSD:DR345285.1,INSD:DR345324.1,INSD:ES011850.1,
INSD:EL131090.1,INSD:DR371087.1,INSD:BP819536.1,
INSD:DR345304.1,INSD:DR183468.1,INSD:DR203120.1,
INSD:DR203085.1,INSD:DR183453.1,INSD:EL992171.1,
INSD:DR345348.1,INSD:DR345344.1,INSD:BP637169.1,
INSD:DR183454.1,INSD:DR345349.1,INSD:ES064675.1,
INSD:ES187419.1,INSD:DR345334.1,INSD:DR345316.1,
INSD:DR345217.1,INSD:DR203121.1,INSD:ES153752.1,
INSD:DR377427.1,INSD:DR203070.1,INSD:ES160212.1,
INSD:DR203108.1,INSD:BP812696.2,INSD:DR203077.1,
INSD:BP591577.1,INSD:ES097944.1,INSD:ES011414.1,
INSD:DR183441.1,INSD:DR183443.1,INSD:EG481405.1,
INSD:DR345329.1,INSD:DR345223.1,INSD:EL306810.1,
INSD:DR345269.1,INSD:EL995764.1,INSD:DR203112.1,
INSD:EL282417.1,INSD:DR345203.1,INSD:BP586021.1,
INSD:BP850988.1,INSD:CB256228.1,INSD:DR345326.1,
INSD:BP649434.1,INSD:DR203100.1,INSD:DR345323.1,
INSD:ES134239.1,INSD:DR345305.1,INSD:DR203118.1,
INSD:DR345182.1,INSD:BP576990.1,INSD:BP818377.1,
INSD:ES110165.1,INSD:BP815985.1,INSD:BP838367.1,
INSD:BP633463.1,INSD:DR203084.1,INSD:DR345207.1,
INSD:BP665314.1,INSD:DR203102.1,INSD:ES133837.1,
INSD:DR183447.1,INSD:DR345221.1,INSD:ES137464.1,
INSD:DR345318.1,INSD:ES020329.1,INSD:ES215879.1,
INSD:ES182779.1,INSD:DR345244.1,INSD:DR183466.1,
INSD:BP575467.1,INSD:DR345321.1,INSD:BP653939.1,
INSD:ES122817.1,INSD:BP634664.1,INSD:BP644796.1,
INSD:ES181661.1,INSD:DR345351.1,INSD:DR183460.1,
INSD:DR345262.1,INSD:DR345341.1,INSD:DR345232.1,
INSD:DR183465.1,INSD:DR345360.1,INSD:DR345260.1,
INSD:BP641756.1,INSD:ES025614.1,INSD:BP652778.1,
INSD:CK118988.1,INSD:EH868138.1,INSD:DR345265.1,
INSD:BP646654.1,INSD:BP574581.1,INSD:DR345216.1,
INSD:DR345354.1,INSD:DR345359.1,INSD:EG481406.1,
INSD:DR345328.1,INSD:DR345236.1,INSD:DR345288.1,
INSD:DR345333.1,INSD:DR345175.1,INSD:EL283860.1,
INSD:DR345264.1,INSD:ES033626.1,INSD:DR345302.1,
INSD:ES166802.1,INSD:BP655272.1,INSD:BP831604.1,
INSD:EH926618.1,INSD:AV542617.1,INSD:DR345231.1,
INSD:DR345336.1,INSD:BP828975.1,INSD:ES013118.1,
INSD:DR203116.1,INSD:DR345308.1,INSD:DR203082.1,
INSD:DR345255.1,INSD:DR345289.1,INSD:DR183458.1,
INSD:DR345361.1,INSD:DR345300.1,INSD:DR345296.1,
INSD:BP637909.1,INSD:ES067767.1,INSD:DR183438.1,
INSD:DR345319.1,INSD:ES065015.1,INSD:DR376980.1,
INSD:ES064137.1,INSD:AV534619.1,INSD:DR345355.1,
INSD:BP651992.1,INSD:EH963419.1,INSD:DR345347.1,
INSD:EL034531.1,INSD:DR345224.1,INSD:ES022248.1,
INSD:DR345268.1,INSD:DR183462.1,INSD:DR345327.1,
INSD:DR203098.1,INSD:DR345209.1,INSD:DR203096.1,
INSD:EL283008.1,INSD:BP638228.1,INSD:ES112062.1,
INSD:DR345294.1,INSD:DR345202.1,INSD:BP804030.1,
INSD:BP816855.1,INSD:DR203075.1,INSD:DR203099.1,
INSD:EH858407.1,INSD:DR345345.1,INSD:DR345233.1,
INSD:ES059035.1,INSD:DR183455.1,INSD:DR203089.1,
INSD:DR345208.1,INSD:BP665140.1,INSD:ES205817.1,
INSD:BP829458.1,INSD:DR345271.1,INSD:DR345188.1,
INSD:DR203107.1,INSD:DR345297.1,INSD:DR183467.1,
INSD:DR203072.1,INSD:DR373214.1,INSD:DR345251.1,
INSD:ES016077.1,INSD:DR183449.1,INSD:DR203110.1,
INSD:DR345240.1,INSD:DR203095.1,INSD:BP633834.1,
INSD:EL067665.1,INSD:ES177128.1,INSD:DR345253.1,
INSD:EL985143.1,INSD:DR345273.1,INSD:DR345258.1,
INSD:EH878787.1,INSD:DR183464.1,INSD:DR183469.1,
INSD:BP830305.1,INSD:EH906153.1,INSD:BP645200.1,
INSD:EL324478.1,INSD:DR183442.1,INSD:DR345301.1,
INSD:DR303028.1,INSD:BP650221.1,INSD:DR345263.1,
INSD:BP814243.1,INSD:EH920304.1,INSD:DR203097.1,
INSD:EH887322.1,INSD:DR345259.1,INSD:BP579634.1,
INSD:DR345193.1,INSD:CK120689.1,INSD:BP644342.1,
INSD:DR345199.1,INSD:DR345211.1,INSD:BP834640.1,
INSD:DR345179.1,INSD:DR345299.1,INSD:DR345194.1,
INSD:EL298566.1,INSD:BP653941.1,INSD:BP838604.1,
INSD:DR345250.1,INSD:BP648753.1,INSD:EL240545.1,
INSD:DR203083.1,INSD:DR345241.1,INSD:DR345177.1,
INSD:EL072872.1,INSD:EL035022.1,INSD:DR345230.1,
INSD:DR345266.1,INSD:DR345313.1,INSD:DR345252.1,
INSD:ES121775.1,INSD:DR203073.1,INSD:DR229009.1,
INSD:BP668181.1,INSD:DR203105.1,INSD:BP827040.1,
INSD:BP653931.1,INSD:EL973337.1,INSD:ES049523.1,
INSD:ES140406.1,INSD:ES012214.1,INSD:DR183440.1,
INSD:DR345192.1,INSD:ES184893.1,INSD:DR345243.1,
INSD:DR345249.1,INSD:DR345292.1,INSD:DR345325.1,
INSD:EH925429.1,INSD:ES170975.1,INSD:BP639724.1,
INSD:DR345352.1,INSD:BP579417.1,INSD:DR203090.1,
INSD:DR203115.1,INSD:EL051375.1,INSD:DR345256.1,
INSD:DR203106.1,INSD:DR345189.1,INSD:DR203103.1,
INSD:DR345227.1,INSD:BP626638.1,INSD:EL056298.1,
INSD:EG453960.1,INSD:BP648680.1,INSD:ES100179.1,
INSD:DR183452.1,INSD:EL176378.1,INSD:DR345228.1,
INSD:DR345322.1,INSD:DR345306.1,INSD:BE844776.1,
INSD:DR370723.1,INSD:EH898488.1,INSD:DR203081.1,
INSD:DR345314.1,INSD:EH842137.1,INSD:DR345309.1,
INSD:DR345197.1,INSD:EH866772.1,INSD:AA728491.1,
INSD:BP833092.1,INSD:ES123663.1,INSD:DR196271.1,
INSD:DR345358.1,INSD:DR183463.1,INSD:BP815348.1,
INSD:DR345181.1,INSD:BP843883.1,INSD:DR372502.1,
INSD:ES021461.1,INSD:EG503579.1,INSD:DR345275.1,
INSD:DR345295.1,INSD:DR345293.1,INSD:DR203093.1,
INSD:DR345247.1,INSD:EH896331.1,INSD:ES104251.1,
INSD:DR183444.1,INSD:DR345311.1,INSD:DR345330.1,
INSD:DR203109.1,INSD:BP637308.1,INSD:EH859658.1,
INSD:DR183439.1,INSD:DR345215.1,INSD:DR345342.1,
INSD:DR345239.1,INSD:BP643592.1,INSD:DR345276.1,
INSD:BP848565.1,INSD:DR345335.1,INSD:EG503578.1,
INSD:BP838692.1"
/inference="similar to RNA sequence,
mRNA:INSD:BX816971.1,INSD:AY091176.1,INSD:BX818525.1,
INSD:BX841793.1,INSD:AY050975.1"
/note="60S acidic ribosomal protein family; FUNCTIONS IN:
structural constituent of ribosome; INVOLVED IN:
translational elongation; LOCATED IN: cytosol, cytosolic
ribosome, ribosome, nucleus, plasma membrane; EXPRESSED
IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth
stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein 60S
(InterPro:IPR001813); BEST Arabidopsis thaliana protein
match is: 60S acidic ribosomal protein family
(TAIR:AT5G47700.2); Has 2175 Blast hits to 2175 proteins
in 383 species: Archae - 76; Bacteria - 0; Metazoa - 858;
Fungi - 474; Plants - 451; Viruses - 0; Other Eukaryotes -
316 (source: NCBI BLink)."
/db_xref="Araport:AT1G01100"
/db_xref="TAIR:AT1G01100"
intron_pos 25:0 (1/2)
intron_pos 96:0 (2/2)
BEGIN
1 MSTVGELACS YAVMILEDEG IAITADKIAT LVKAAGVSIE SYWPMLFAKM AEKRNVTDLI
61 MNVGAGGGGG APVAAAAPAA GGGAAAAPAA EEKKKDEPAE ESDGDLGFGL FD
//